Filo (biología)

En biología, un filo (o phylum) es un nivel de clasificación o rango taxonómico por debajo del reino y por encima de la clase. Tradicionalmente, en botánica se ha utilizado el término división en lugar de phylum, aunque el Código Internacional de Nomenclatura para algas, hongos y plantas acepta los términos como equivalentes. Según las definiciones, el reino animal Animalia contiene alrededor de 31 phyla, el reino vegetal Plantae contiene alrededor de 14 phyla y el reino de los hongos Fungi contiene alrededor de 8 phyla. La investigación actual en filogenética está descubriendo las relaciones entre filos, que están contenidos en clados más grandes, como Ecdysozoa y Embryophyta.

Descripción general

El término phylum fue acuñado en 1866 por Ernst Haeckel del griego phylon (φῦλον, "raza, estirpe"), relacionado con phyle (φυλή, "tribu, clan"). Haeckel señaló que las especies evolucionaban constantemente hacia nuevas especies que parecían conservar pocas características consistentes entre sí y, por lo tanto, pocas características que las distinguieran como grupo ("una unidad autónoma"). "Wohl aber ist eine solche reale und vollkommen abgeschlossene Einheit die Summe aller Species, welche aus einer und derselben gemeinschaftlichen Stammform allmählig sich entwickelt haben, wie z. B. alle Wirbelthiere. Diese Summe nennen wir Stamm (Phylon)". que se traduce como: Sin embargo, tal vez tal unidad real y completamente autónoma sea el conjunto de todas las especies que han evolucionado gradualmente a partir de una y la misma forma original común, como, por ejemplo, todos los vertebrados. Llamamos a este agregado [a] Stamm [es decir, raza] (Phylon). En taxonomía de plantas, August W. Eichler (1883) clasificó las plantas en cinco grupos llamados divisiones, un término que sigue en uso hoy en día para grupos de plantas, algas y hongos. Las definiciones de filos zoológicos han cambiado desde sus orígenes en las seis clases de Linneo y las cuatro ramificaciones de Georges Cuvier.

De manera informal, se puede pensar en los filos como agrupaciones de organismos basadas en la especialización general del plan corporal. En su forma más básica, un phylum se puede definir de dos maneras: como un grupo de organismos con un cierto grado de similitud morfológica o de desarrollo (la definición fenética), o un grupo de organismos con un cierto grado de relación evolutiva (la definición filogenética).). Intentar definir un nivel de la jerarquía linneana sin referirse a la relación (evolutiva) no es satisfactorio, pero una definición fenética es útil cuando se abordan cuestiones de naturaleza morfológica, como qué tan exitosos fueron los diferentes planes corporales.

Definición basada en la relación genética

La medida objetiva más importante en las definiciones anteriores es el "cierto grado" que define cómo los diferentes organismos deben ser miembros de diferentes filos. El requisito mínimo es que todos los organismos de un filo deben estar claramente más estrechamente relacionados entre sí que con cualquier otro grupo.Incluso esto es problemático porque el requisito depende del conocimiento de las relaciones de los organismos: a medida que haya más datos disponibles, particularmente de estudios moleculares, podremos determinar mejor las relaciones entre grupos. Entonces, los filos se pueden fusionar o dividir si se hace evidente que están relacionados entre sí o no. Por ejemplo, los gusanos barbudos se describieron como un nuevo filo (los Pogonophora) a mediados del siglo XX, pero el trabajo molecular casi medio siglo después descubrió que eran un grupo de anélidos, por lo que los filos se fusionaron (los gusanos barbudos son ahora una familia de anélidos). Por otro lado, el filo altamente parasitario Mesozoa se dividió en dos filos (Orthonectida y Rhombozoa) cuando se descubrió que los Orthonectida son probablemente deuterostomes y los Rhombozoa protostomes.

Esta variabilidad de los filos ha llevado a algunos biólogos a pedir que se abandone el concepto de filo en favor de la cladística, un método en el que los grupos se colocan en un "árbol genealógico" sin ninguna clasificación formal del tamaño del grupo.

Definición basada en el plan corporal

Los paleontólogos Graham Budd y Sören Jensen han propuesto una definición de filo basada en el plan corporal (como lo había hecho Haeckel un siglo antes). La definición se planteó porque los organismos extintos son los más difíciles de clasificar: pueden ser retoños que se separaron de la línea de un phylum antes de que se adquirieran todos los caracteres que definen el phylum moderno. Según la definición de Budd y Jensen, un filo se define por un conjunto de caracteres compartidos por todos sus representantes vivos.

Este enfoque trae algunos pequeños problemas, por ejemplo, algunos miembros pueden haber perdido los caracteres ancestrales comunes a la mayoría de los miembros de un filo. Además, esta definición se basa en un punto de tiempo arbitrario: el presente. Sin embargo, como se basa en caracteres, es fácil de aplicar al registro fósil. Un problema mayor es que se basa en una decisión subjetiva sobre qué grupos de organismos deben considerarse filos.

El enfoque es útil porque facilita la clasificación de organismos extintos como "grupos troncales" de los filos con los que se parecen más, basándose únicamente en las similitudes taxonómicamente importantes. Sin embargo, es difícil probar que un fósil pertenece al grupo de la corona de un filo, ya que debe mostrar un carácter exclusivo de un subconjunto del grupo de la corona. Además, los organismos del grupo troncal de un phylum pueden poseer el "plan corporal" del phylum sin todas las características necesarias para caer dentro de él. Esto debilita la idea de que cada uno de los filos representa un plan corporal distinto.

Una clasificación que utilice esta definición puede verse fuertemente afectada por la probabilidad de supervivencia de grupos raros, lo que puede hacer que un filo sea mucho más diverso de lo que sería de otro modo.

Filos conocidos

Animales

Los números totales son estimaciones; las cifras de diferentes autores varían enormemente, sobre todo porque algunas se basan en especies descritas, otras en extrapolaciones a números de especies no descritas. Por ejemplo, se han descrito alrededor de 25 000 a 27 000 especies de nematodos, mientras que las estimaciones publicadas del número total de especies de nematodos incluyen 10 000 a 20 000; 500.000; 10 millones; y 100 millones.

Plantas

El reino Plantae se define de varias maneras por diferentes biólogos (ver Definiciones actuales de Plantae). Todas las definiciones incluyen las embriofitas vivas (plantas terrestres), a las que se pueden agregar las dos divisiones de algas verdes, Chlorophyta y Charophyta, para formar el clado Viridiplantae. La siguiente tabla sigue el influyente (aunque polémico) sistema Cavalier-Smith al equiparar "Plantae" con Archaeplastida, un grupo que contiene Viridiplantae y las divisiones de algas Rhodophyta y Glaucophyta.

La definición y clasificación de las plantas a nivel de división también varía de una fuente a otra y ha cambiado progresivamente en los últimos años. Por lo tanto, algunas fuentes ubican las colas de caballo en la división Arthrophyta y los helechos en la división Monilophyta, mientras que otras las ubican a ambas en Monilophyta, como se muestra a continuación. La división Pinophyta se puede utilizar para todas las gimnospermas (es decir, incluidas las cícadas, los ginkgos y las gnetofitas), o solo para las coníferas, como se indica a continuación.

Desde la primera publicación del sistema APG en 1998, que proponía una clasificación de las angiospermas hasta el nivel de órdenes, muchas fuentes han preferido tratar los rangos superiores a los órdenes como clados informales. Donde se han proporcionado rangos formales, las divisiones tradicionales enumeradas a continuación se han reducido a un nivel mucho más bajo, por ejemplo, subclases.

Hongos

Phylum Microsporidia generalmente se incluye en el reino Fungi, aunque sus relaciones exactas siguen siendo inciertas, y la Sociedad Internacional de Protistólogos lo considera un protozoo (ver Protista, a continuación). El análisis molecular de Zygomycota ha encontrado que es polifilético (sus miembros no comparten un ancestro inmediato), lo que muchos biólogos consideran indeseable. En consecuencia, existe una propuesta para abolir el phylum Zygomycota. Sus miembros se dividirían entre el phylum Glomeromycota y cuatro nuevos subphyla incertae sedis (de ubicación incierta): Entomophthoromycotina, Kickxellomycotina, Mucoromycotina y Zoopagomycotina.

Protista

Kingdom Protista (o Protoctista) está incluido en el modelo tradicional de cinco o seis reinos, donde se puede definir como que contiene todos los eucariotas que no son plantas, animales u hongos. Protista es un taxón polifilético, que es menos aceptable para los biólogos actuales que en el pasado. Se han hecho propuestas para dividirlo entre varios reinos nuevos, como Protozoa y Chromista en el sistema Cavalier-Smith.

La taxonomía de protistas ha sido inestable durante mucho tiempo, con diferentes enfoques y definiciones que dieron como resultado muchos esquemas de clasificación en competencia. Los phyla enumerados aquí se utilizan para Chromista y Protozoa por el Catalog of Life, adaptado del sistema utilizado por la Sociedad Internacional de Protistólogos.

El Catálogo de la Vida incluye Rhodophyta y Glaucophyta en el reino Plantae, pero otros sistemas consideran estos filos como parte de Protista.

Bacterias

Actualmente existen 40 filos bacterianos (sin incluir las "Cianobacterias") que han sido válidamente publicados según el Código Bacteriológico

1. Acidobacteriota, fenotípicamente diversa y en su mayoría no cultivada
2. Actinomycetota, especie Gram positiva con alto contenido de G+C
3. Aquificota, de ramificación profunda
4. Armatimonadota
5. Atribacterota
6. Bacillota, especies grampositivas con bajo contenido de G+C, como los bacilos formadores de esporas (aeróbicos) y Clostridia (anaeróbicos)
7. Bacteroidota
8. Balneolota
9. bdellovibrionota
10. Caldisericum, ex candidato división OP5, Caldisericum exilio es el único representante
11. Calditrichota
12. Campylobacterota
13. Clamidiota
14. Clorobiota, bacterias verdes del azufre
15. Cloroflexota, bacteria verde sin azufre
16. Chrysiogenota, solo 3 géneros (Chrysiogenes arsenatis, Desulfurispira natronophila, Desulfurispirillum alkaliphilum)
17. Coprothermobacterota
18. Deferribacterota
19. Deinococcota, Deinococcus radiodurans y Thermus aquaticus son especies "comúnmente conocidas" de este filo.
20. Dictyoglomota
21. Elusimicrobiota, antigua división candidata Thermite Group 1
22. fibrobacterota
23. fusobacteriota
24. Gemmatimonadota
25. Ignavibacteriota
26. Kiritimatiellota
27. Lentisphaerota, anteriormente clado VadinBE97
28. Mycoplasmatota, género notable: Mycoplasma
29. mixococota
30. Nitrospinota
31. nitrospirota
32. planctomicetota
33. Pseudomonadota, el filo más conocido, que contiene especies como Escherichia coli o Pseudomonas aeruginosa
34. rodotermota
35. Spirochaetota, las especies incluyen Borrelia burgdorferi, que causa la enfermedad de Lyme
36. Sinergistota
37. Termodesulfobacteria
38. termomicrobiota
39. Thermotogota, de ramificación profunda
40. verrucomicrobiota

Arqueas

Actualmente existen 2 phyla que han sido válidamente publicados según el Código Bacteriológico

1. Nitrososphaerota
2. Thermoproteota, el segundo filo de arqueas más común

Otros filos que se han propuesto, pero que no se han nombrado válidamente, incluyen:

1. "Euryarchaeota", filo arqueal más común
2. "Korarchaeota"
3. "Nanoarchaeota", simbiontes ultrapequeños, única especie conocida