Filo (biología)

En biología, un filo (o phylum) es un nivel de clasificación o rango taxonómico por debajo del reino y por encima de la clase. Tradicionalmente, en botánica se ha utilizado el término división en lugar de phylum, aunque el Código Internacional de Nomenclatura para algas, hongos y plantas acepta los términos como equivalentes. Según las definiciones, el reino animal Animalia contiene alrededor de 31 phyla, el reino vegetal Plantae contiene alrededor de 14 phyla y el reino de los hongos Fungi contiene alrededor de 8 phyla. La investigación actual en filogenética está descubriendo las relaciones entre filos, que están contenidos en clados más grandes, como Ecdysozoa y Embryophyta.

Descripción general

El término phylum fue acuñado en 1866 por Ernst Haeckel del griego phylon (φῦλον, "raza, estirpe"), relacionado con phyle (φυλή, "tribu, clan"). Haeckel señaló que las especies evolucionaban constantemente hacia nuevas especies que parecían conservar pocas características consistentes entre sí y, por lo tanto, pocas características que las distinguieran como grupo ("una unidad autónoma"). "Wohl aber ist eine solche reale und vollkommen abgeschlossene Einheit die Summe aller Species, welche aus einer und derselben gemeinschaftlichen Stammform allmählig sich entwickelt haben, wie z. B. alle Wirbelthiere. Diese Summe nennen wir Stamm (Phylon)". que se traduce como: Sin embargo, tal vez tal unidad real y completamente autónoma sea el conjunto de todas las especies que han evolucionado gradualmente a partir de una y la misma forma original común, como, por ejemplo, todos los vertebrados. Llamamos a este agregado [a] Stamm [es decir, raza] (Phylon). En taxonomía de plantas, August W. Eichler (1883) clasificó las plantas en cinco grupos llamados divisiones, un término que sigue en uso hoy en día para grupos de plantas, algas y hongos. Las definiciones de filos zoológicos han cambiado desde sus orígenes en las seis clases de Linneo y las cuatro ramificaciones de Georges Cuvier.

De manera informal, se puede pensar en los filos como agrupaciones de organismos basadas en la especialización general del plan corporal. En su forma más básica, un phylum se puede definir de dos maneras: como un grupo de organismos con un cierto grado de similitud morfológica o de desarrollo (la definición fenética), o un grupo de organismos con un cierto grado de relación evolutiva (la definición filogenética).). Intentar definir un nivel de la jerarquía linneana sin referirse a la relación (evolutiva) no es satisfactorio, pero una definición fenética es útil cuando se abordan cuestiones de naturaleza morfológica, como qué tan exitosos fueron los diferentes planes corporales.

Definición basada en la relación genética

La medida objetiva más importante en las definiciones anteriores es el "cierto grado" que define cómo los diferentes organismos deben ser miembros de diferentes filos. El requisito mínimo es que todos los organismos de un filo deben estar claramente más estrechamente relacionados entre sí que con cualquier otro grupo.Incluso esto es problemático porque el requisito depende del conocimiento de las relaciones de los organismos: a medida que haya más datos disponibles, particularmente de estudios moleculares, podremos determinar mejor las relaciones entre grupos. Entonces, los filos se pueden fusionar o dividir si se hace evidente que están relacionados entre sí o no. Por ejemplo, los gusanos barbudos se describieron como un nuevo filo (los Pogonophora) a mediados del siglo XX, pero el trabajo molecular casi medio siglo después descubrió que eran un grupo de anélidos, por lo que los filos se fusionaron (los gusanos barbudos son ahora una familia de anélidos). Por otro lado, el filo altamente parasitario Mesozoa se dividió en dos filos (Orthonectida y Rhombozoa) cuando se descubrió que los Orthonectida son probablemente deuterostomes y los Rhombozoa protostomes.

Esta variabilidad de los filos ha llevado a algunos biólogos a pedir que se abandone el concepto de filo en favor de la cladística, un método en el que los grupos se colocan en un "árbol genealógico" sin ninguna clasificación formal del tamaño del grupo.

Definición basada en el plan corporal

Los paleontólogos Graham Budd y Sören Jensen han propuesto una definición de filo basada en el plan corporal (como lo había hecho Haeckel un siglo antes). La definición se planteó porque los organismos extintos son los más difíciles de clasificar: pueden ser retoños que se separaron de la línea de un phylum antes de que se adquirieran todos los caracteres que definen el phylum moderno. Según la definición de Budd y Jensen, un filo se define por un conjunto de caracteres compartidos por todos sus representantes vivos.

Este enfoque trae algunos pequeños problemas, por ejemplo, algunos miembros pueden haber perdido los caracteres ancestrales comunes a la mayoría de los miembros de un filo. Además, esta definición se basa en un punto de tiempo arbitrario: el presente. Sin embargo, como se basa en caracteres, es fácil de aplicar al registro fósil. Un problema mayor es que se basa en una decisión subjetiva sobre qué grupos de organismos deben considerarse filos.

El enfoque es útil porque facilita la clasificación de organismos extintos como "grupos troncales" de los filos con los que se parecen más, basándose únicamente en las similitudes taxonómicamente importantes. Sin embargo, es difícil probar que un fósil pertenece al grupo de la corona de un filo, ya que debe mostrar un carácter exclusivo de un subconjunto del grupo de la corona. Además, los organismos del grupo troncal de un phylum pueden poseer el "plan corporal" del phylum sin todas las características necesarias para caer dentro de él. Esto debilita la idea de que cada uno de los filos representa un plan corporal distinto.

Una clasificación que utilice esta definición puede verse fuertemente afectada por la probabilidad de supervivencia de grupos raros, lo que puede hacer que un filo sea mucho más diverso de lo que sería de otro modo.

Filos conocidos

Animales

Los números totales son estimaciones; las cifras de diferentes autores varían enormemente, sobre todo porque algunas se basan en especies descritas, otras en extrapolaciones a números de especies no descritas. Por ejemplo, se han descrito alrededor de 25 000 a 27 000 especies de nematodos, mientras que las estimaciones publicadas del número total de especies de nematodos incluyen 10 000 a 20 000; 500.000; 10 millones; y 100 millones.

	protostoma	Bilatería	Nefrozoos
	Deuterostomo
	Basal/disputado	no bilateral
	Vendobionta
	parazoa
	Otros

Filo	Significado	Nombre común	característica distintiva	esconderespecies descritas
anélida	pequeño anillo	Gusanos segmentados	Múltiples segmentos circulares	22,000 + existentes
Agmata	Fragmentado	Agmatos
Archaeocyatha	Copas antiguas	Un taxón extinto de organismos constructores de arrecifes de grado esponja que vivían en aguas cálidas tropicales y subtropicales durante el Cámbrico Temprano.	3 clases conocidas (Extinto)
artrópodos	pie articulado	artrópodos	Cuerpos segmentados y extremidades articuladas, con exoesqueleto quitinoso.	1,250,000 + existente; 20,000+ extintos
braquiópodos	brazo pie	Conchas	Lofóforo y pedículo	300 -500 existentes; 12,000+ extintos
Briozoos (Ectoprocta)	animales de musgo	Musgos, esteras marinas, ectoproctos	Lofóforo, sin pedículo, tentáculos ciliados, ano fuera del anillo de cilios	6,000 existentes
Quetognata	mandíbula de pelo largo	Gusanos de flecha	Espinas quitinosas a cada lado de la cabeza, aletas	aprox. 100 existentes
cordados	con un cordón	cordados	Cordón nervioso dorsal hueco, notocorda, hendiduras faríngeas, endostilo, cola posanal	aprox. 55,000 +
cnidarios	Ortiga	cnidarios	Nematocistos (células urticantes)	aprox. 16,000
Ctenófora	Portador de peine	peine jaleas	Ocho "filas de peine" de cilios fusionados	aprox. 100 -150 existente
ciclófora	Transporte de ruedas	simbionte	Boca circular rodeada de pequeños cilios, cuerpos en forma de saco.	3 +
Equinodermos	piel espinosa	Equinodermos	Simetría radial quíntuple en formas vivas, espinas mesodérmicas calcificadas	aprox. 7.500 existentes; aprox. 13,000 extintos
entoprocta	dentro del ano	Gusanos de copa	Ano dentro del anillo de cilios	aprox. 150
gastrotricha	Estómago peludo	gusanos gastrotricos	Dos tubos adhesivos terminales	aprox. 690
Gnathostomulida	Orificio de mandíbula	gusanos de mandíbula	Diminutos gusanos relacionados con rotíferos sin cavidad corporal.	aprox. 100
Hemicordada	Media cuerda	Gusanos bellota, hemicordados	Estomocorda en cuello, hendiduras faríngeas	aprox. 130 existentes
Kinorhyncha	Hocico de movimiento	dragones de barro	Once segmentos, cada uno con una placa dorsal	aprox. 150
Loricífera	portador del corsé	cabezales de cepillo	Escamas en forma de paraguas en cada extremo	aprox. 122
micrognatozoos	Pequeños animales de mandíbula	Limnognatia	Tórax extensible en acordeón	1
medusoide	Como una medusa	Medusoides	Estas son criaturas extintas descritas como medusas y habitaron el Precámbrico tardío, el Ediacárico y el Cámbrico temprano.	18 géneros, extintos
moluscos	Suave	Moluscos / moluscos	Pie musculoso y caparazón redondo del manto	85,000 + existente; 80,000+ extintos
Nematoda	Hilo como	Gusanos redondos, gusanos de hilo	Sección transversal redonda, cutícula de queratina	25,000
nematomorfa	forma de hilo	Gusanos crin de caballo, gusanos gordianos	Gusanos parásitos largos y delgados estrechamente relacionados con los nematodos	aprox. 320
Nemertea	una ninfa del mar	Gusanos de cinta, rhynchocoela	Gusanos no segmentados, con una probóscide alojada en una cavidad derivada del celoma llamada rhynchocoel	aprox. 1200
onicofora	Portador de garras	gusanos de terciopelo	Animal parecido a un gusano con patas terminadas en garras quitinosas	aprox. 200 existentes
Petalonamae	Con forma de hojas	No	Un filo extinto del Ediacarano. Son habitantes del fondo e inmóviles, con forma de hojas (frondomorfos), plumas o husos.	3 clases, extinto
foronida	amante de zeus	gusanos de herradura	tripa en forma de U	11
placozoos	Plato animales	tricoplaxias	Superficies superior e inferior diferenciadas, dos capas de células ciliadas, células de fibra ameboidea en el medio	3
ornitorrincos	Gusano plano	gusanos planos	Gusanos aplanados sin cavidad corporal. Muchos son parásitos.	aprox. 29,500
Porifera	portador de poros	esponjas	Pared interior perforada, el más simple de todos los animales conocidos.	10,800 existentes
Priapulida	El pequeño Príapo	gusanos del pene	gusanos en forma de pene	aprox. 20
Proarticulata	antes de articular	proarticulados	Un grupo extinto de organismos con forma de colchón que muestran "simetría de deslizamiento". Encontrado durante el Ediacárico.	3 clases, extinto
Rombozoos (Dicyemida)	pastilla de animales	rombozoos	Endoparásitos de células axiales anteroposteriores simples, rodeados de células ciliadas	100 +
Rotíferos	portador de rueda	Rotíferos	Corona anterior de cilios	aprox. 2,000
Saccorhytida	Saccus: "bolsillo" y "arruga"	Saccorhytus	Saccorhytus mide solo alrededor de 1 mm (1,3 mm) y se caracteriza por un cuerpo esférico o hemisférico con una boca prominente. Su cuerpo está cubierto por una cutícula gruesa pero flexible. Tiene un nódulo encima de su boca. Alrededor de su cuerpo hay 8 aberturas en forma de tronco de cono con pliegues radiales.	1 especie, extinta
tardígrada	paso lento	Osos de agua, lechones de musgo	Parientes microscópicos de los artrópodos, con cuerpo y cabeza de cuatro segmentos.	1,000
trilobozoos	animal de tres lóbulos	trilobozoario	Un taxón de organismos en su mayoría discoidales que exhiben simetría tricéntrica. Todos son de edad ediacárica.	18 géneros, extintos
Vetulicolia	Habitante antiguo	vetulicoliano	Posiblemente podría ser un subfilo de los cordados. Su cuerpo consta de dos partes: una gran parte frontal y cubierta por una gran "boca" y cien objetos redondos a cada lado que se han interpretado como branquias -o al menos aberturas en las inmediaciones del animal-. Su faringe posterior consta de 7 segmentos.	15 especies, extintas
Xenacoelomorpha	Extraña forma hueca	Subfilo Acoelomorpha y xenoturbellida	Animales pequeños y sencillos. Bilateriano, pero sin las estructuras bilaterales típicas, como las cavidades intestinales, los anos y los sistemas circulatorios.	400 +
totales: 40				1,525,000

Plantas

El reino Plantae se define de varias maneras por diferentes biólogos (ver Definiciones actuales de Plantae). Todas las definiciones incluyen las embriofitas vivas (plantas terrestres), a las que se pueden agregar las dos divisiones de algas verdes, Chlorophyta y Charophyta, para formar el clado Viridiplantae. La siguiente tabla sigue el influyente (aunque polémico) sistema Cavalier-Smith al equiparar "Plantae" con Archaeplastida, un grupo que contiene Viridiplantae y las divisiones de algas Rhodophyta y Glaucophyta.

La definición y clasificación de las plantas a nivel de división también varía de una fuente a otra y ha cambiado progresivamente en los últimos años. Por lo tanto, algunas fuentes ubican las colas de caballo en la división Arthrophyta y los helechos en la división Monilophyta, mientras que otras las ubican a ambas en Monilophyta, como se muestra a continuación. La división Pinophyta se puede utilizar para todas las gimnospermas (es decir, incluidas las cícadas, los ginkgos y las gnetofitas), o solo para las coníferas, como se indica a continuación.

Desde la primera publicación del sistema APG en 1998, que proponía una clasificación de las angiospermas hasta el nivel de órdenes, muchas fuentes han preferido tratar los rangos superiores a los órdenes como clados informales. Donde se han proporcionado rangos formales, las divisiones tradicionales enumeradas a continuación se han reducido a un nivel mucho más bajo, por ejemplo, subclases.

	Plantas de tierra	Viridiplantae
	Alga verde
	Otras algas (Biliphyta)

División	Significado	Nombre común	Características distintivas	especies descritas
Anthocerotophyta	Anthoceros -como plantas	Hornworts	Esporofitos en forma de cuerno, sin sistema vascular	100 -300+
briófita	Bryum -como plantas, plantas de musgo	musgos	Esporofitos persistentes no ramificados, sin sistema vascular	aprox. 12,000
Charophyta	Plantas tipo Chara	Carófitos		aprox. 1,000
clorofita	Plantas (amarillas) verdes	clorofitas		aprox. 7,000
Cycadophyta	Plantas parecidas a cycas, plantas parecidas a palmeras.	cícadas	Semillas, corona de hojas compuestas	aprox. 100 -200
Ginkgophyta	Plantas parecidas al ginkgo	Ginkgo, árbol de culantrillo	Semillas no protegidas por frutos (especies vivas únicas)	solo 1 existente; 50+ extinto
glaucofita	plantas de color verde azulado	glaucofitos		15
gnetofita	Plantas similares a Gnetum	gnetofitas	Semillas y sistema vascular leñoso con vasos	aprox. 70
Lycopodiophyta,Lycophyta	Plantas similares a Lycopodiumplantas de lobo	Musgos de club y musgos de espiga	Hojas microfílicas, sistema vascular.	1290 existentes
Magnoliophyta	plantas parecidas a la magnolia	plantas con flores, angiospermas	Flores y frutos, sistema vascular con vasos.	300.000
marchantiophyta,hepatofita	Marchantia -plantas comoplantas de higado	hepáticas	Esporofitos efímeros no ramificados, sin sistema vascular	aprox. 9,000
Polipodiofita,Monilophyta	Plantas tipo polipodio	helechos	Hojas megáfilas, sistema vascular	aprox. 10,560
Pinofita,Coniferofita	Plantas tipo PinusPlanta de conos	Coníferas	Conos que contienen semillas y madera compuesta de traqueidas	629 existente
rodofita	plantas de rosas	alga roja	Utilizar ficobiliproteínas como pigmentos accesorios.	aprox. 7,000
totales: 14

Hongos

División	Significado	Nombre común	Características distintivas	especies descritas
Ascomicota	hongos en la vejiga	Ascomicetos, hongos del saco	Tienden a tener cuerpos fructíferos (ascocarpio). Filamentoso, produciendo hifas separadas por tabiques. Puede reproducirse asexualmente.	30,000
Basidiomycota	Hongo base pequeño	Basidiomicetos, hongos club	Hongos de soporte, hongos venenosos, carbones y óxido. Reproducción sexual.	31,515
Blastocladiomycota	Hongo de rama de retoño	Blastoclads		menos de 200
quitridiomycota	Pequeño hongo de la olla	Quitridos	Predominantemente acuáticos saprotróficos o parásitos. Tener un flagelo posterior. Tienden a ser unicelulares pero también pueden ser pluricelulares.	1000+
Glomeromycota	Hongo del ovillo	Glomeromicetos, hongos AM	Principalmente micorrizas arbusculares presentes, terrestres con una pequeña presencia en humedales. La reproducción es asexual pero requiere raíces de plantas.	284
microsporidios	Semillas pequeñas	microsporanos		1400
Neocallimastigomycota	Nuevo y hermoso hongo látigo	neocalimastigomicetos	Localizado predominantemente en el tracto digestivo de los animales herbívoros. Anaerobios, terrestres y acuáticos.	aprox. 20
Zygomycota	Par de hongos	Zygomycetes	La mayoría son saprobios y se reproducen sexual y asexualmente.	aprox. 1060
totales: 8

Phylum Microsporidia generalmente se incluye en el reino Fungi, aunque sus relaciones exactas siguen siendo inciertas, y la Sociedad Internacional de Protistólogos lo considera un protozoo (ver Protista, a continuación). El análisis molecular de Zygomycota ha encontrado que es polifilético (sus miembros no comparten un ancestro inmediato), lo que muchos biólogos consideran indeseable. En consecuencia, existe una propuesta para abolir el phylum Zygomycota. Sus miembros se dividirían entre el phylum Glomeromycota y cuatro nuevos subphyla incertae sedis (de ubicación incierta): Entomophthoromycotina, Kickxellomycotina, Mucoromycotina y Zoopagomycotina.

Protista

Kingdom Protista (o Protoctista) está incluido en el modelo tradicional de cinco o seis reinos, donde se puede definir como que contiene todos los eucariotas que no son plantas, animales u hongos. Protista es un taxón polifilético, que es menos aceptable para los biólogos actuales que en el pasado. Se han hecho propuestas para dividirlo entre varios reinos nuevos, como Protozoa y Chromista en el sistema Cavalier-Smith.

La taxonomía de protistas ha sido inestable durante mucho tiempo, con diferentes enfoques y definiciones que dieron como resultado muchos esquemas de clasificación en competencia. Los phyla enumerados aquí se utilizan para Chromista y Protozoa por el Catalog of Life, adaptado del sistema utilizado por la Sociedad Internacional de Protistólogos.

	harosa
	protozoos

Filo/División	Significado	Nombre común	Características distintivas	Ejemplo	especies descritas
Amoebozoa	animal amorfo	amebas	Presencia de seudópodos	Ameba	2400
Bigira	dos anillos
Cercozoa
Choanozoa	animales embudo			Presencia de un colar de microvellosidades que rodean un flagelo	125
ciliófora	Portador de cilios	ciliados	Presencia de múltiples cilios y un citostoma	paramecio	4500
criptista	Oculto
Euglenozoa	Ojo verdadero animal			Euglena	800
Foraminíferos	Portadores de agujeros	foraminíferos	Conchas complejas con una o más cámaras.	foraminíferos	10000, 50000 extintos
haptofita
lukozoa	animal de ranura
Metamonada	Organismos unicelulares medios				Giardia
microsporidios	pequeña espora
mizozoos	animal lactante				1555+
ocrofita	planta amarilla				diatomeas
oomicota	Hongo de huevo	oomicetos
percolozoos
radiozoos	Raya animal	radiolarios
Sarcomastigophora	Portador de carne y látigo
sulcozoos
totales: 19

El Catálogo de la Vida incluye Rhodophyta y Glaucophyta en el reino Plantae, pero otros sistemas consideran estos filos como parte de Protista.

Bacterias

Actualmente existen 40 filos bacterianos (sin incluir las "Cianobacterias") que han sido válidamente publicados según el Código Bacteriológico

1. Acidobacteriota, fenotípicamente diversa y en su mayoría no cultivada
2. Actinomycetota, especie Gram positiva con alto contenido de G+C
3. Aquificota, de ramificación profunda
4. Armatimonadota
5. Atribacterota
6. Bacillota, especies grampositivas con bajo contenido de G+C, como los bacilos formadores de esporas (aeróbicos) y Clostridia (anaeróbicos)
7. Bacteroidota
8. Balneolota
9. bdellovibrionota
10. Caldisericum, ex candidato división OP5, Caldisericum exilio es el único representante
11. Calditrichota
12. Campylobacterota
13. Clamidiota
14. Clorobiota, bacterias verdes del azufre
15. Cloroflexota, bacteria verde sin azufre
16. Chrysiogenota, solo 3 géneros (Chrysiogenes arsenatis, Desulfurispira natronophila, Desulfurispirillum alkaliphilum)
17. Coprothermobacterota
18. Deferribacterota
19. Deinococcota, Deinococcus radiodurans y Thermus aquaticus son especies "comúnmente conocidas" de este filo.
20. Dictyoglomota
21. Elusimicrobiota, antigua división candidata Thermite Group 1
22. fibrobacterota
23. fusobacteriota
24. Gemmatimonadota
25. Ignavibacteriota
26. Kiritimatiellota
27. Lentisphaerota, anteriormente clado VadinBE97
28. Mycoplasmatota, género notable: Mycoplasma
29. mixococota
30. Nitrospinota
31. nitrospirota
32. planctomicetota
33. Pseudomonadota, el filo más conocido, que contiene especies como Escherichia coli o Pseudomonas aeruginosa
34. rodotermota
35. Spirochaetota, las especies incluyen Borrelia burgdorferi, que causa la enfermedad de Lyme
36. Sinergistota
37. Termodesulfobacteria
38. termomicrobiota
39. Thermotogota, de ramificación profunda
40. verrucomicrobiota

Arqueas

Actualmente existen 2 phyla que han sido válidamente publicados según el Código Bacteriológico

1. Nitrososphaerota
2. Thermoproteota, el segundo filo de arqueas más común

Otros filos que se han propuesto, pero que no se han nombrado válidamente, incluyen:

1. "Euryarchaeota", filo arqueal más común
2. "Korarchaeota"
3. "Nanoarchaeota", simbiontes ultrapequeños, única especie conocida