Tablas de codones

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Se puede usar una tabla de codones para traducir un código genético en una secuencia de aminoácidos. El código genético estándar se representa tradicionalmente como una tabla de codones de ARN, porque cuando los ribosomas producen proteínas en una célula, es el ARN mensajero (ARNm) el que dirige la síntesis de proteínas. La secuencia de ARNm está determinada por la secuencia de ADN genómico. En este contexto, el código genético estándar se denomina tabla de traducción 1. También se puede representar en una tabla de codones de ADN. Los codones de ADN en dichas tablas se encuentran en la cadena de ADN sentido y están dispuestos en una dirección de 5′ a 3′. Se utilizan diferentes tablas con codones alternos dependiendo de la fuente del código genético, como de un núcleo celular, mitocondria, plástido o hidrogenosoma.

Hay 64 codones diferentes en el código genético y las tablas a continuación; la mayoría especifica un aminoácido. Tres secuencias, UAG, UGA y UAA, conocidas como codones de parada, no codifican un aminoácido sino que señalan la liberación del polipéptido naciente del ribosoma. En el código estándar, la secuencia AUG, que se lee como metionina, puede servir como codón de inicio y, junto con secuencias como un factor de iniciación, inicia la traducción. En raras ocasiones, los codones de inicio en el código estándar también pueden incluir GUG o UUG; estos codones normalmente representan valina y leucina, respectivamente, pero como codones de inicio se traducen como metionina o formilmetionina.

La primera tabla, la tabla estándar, se puede utilizar para traducir tripletes de nucleótidos en el aminoácido correspondiente o en la señal adecuada si se trata de un codón de inicio o finalización. La segunda tabla, apropiadamente llamada la inversa, hace lo contrario: se puede usar para deducir un posible código de triplete si se conoce el aminoácido. Como varios codones pueden codificar el mismo aminoácido, en algunos casos se proporciona la notación de ácido nucleico de la Unión Internacional de Química Pura y Aplicada (IUPAC).

Tabla de traducción 1

Tabla de codones de ARN estándar

Propiedades bioquímicas de aminoácidosno polarflecha arribaPolardagaBásicodaga dobleÁcido ↓Terminación: codón de terminación *Iniciación: posible codón de inicio→
1ra
base
segunda basetercera
base
tuCUNGRAMO
tuUUU(Phe/F) Fenilalaninaflecha arribaINCLINAR(Ser/S) SerinadagaGUAU(Tyr/Y) TirosinadagaUGU(Cys/C) Cisteínadagatu
UUCUCCUACCGUC
UUA(Leu / L) Leucinaflecha arribaUCASAUStop ( Ocre ) *UGAParada ( Ópalo ) *UN
UUG→UCGUAGDetener ( Ámbar ) *UGG(Trp/W) Triptófanoflecha arribaGRAMO
CCUUUCC(Pro/P) Prolinaflecha arribaPRECAUCIÓN(Su/H) Histidinadaga dobleTOS(Arg/R) Argininadaga dobletu
CUCCCCCACCGCC
CANGREJOCCACAA(Gln/Q) GlutaminadagaCGAUN
CUGCCGCAGCGGGRAMO
UNAUU(Ile/I) Isoleucinaflecha arribaA ELLOS(Thr/T) TreoninadagaUCA(Asn/N) AsparaginadagaAGU(Ser/S) Serinadagatu
ABCCACCAACAGC
AUAACAAAA(Lys/K) Lisinadaga doblePERO(Arg/R) Argininadaga dobleUN
AGO→(Met/M) Metioninaflecha arribaACGAAGAGGGRAMO
GRAMOGUU(Val/V) Valinaflecha arribaGCU(Ala/A) Alaninaflecha arribaCERRADO(Asp/D) Ácido aspártico ↓GGU(Gly/G) Glicinaflecha arribatu
FUERZACCGCAGGGCC
CUEVAGCAAGA(Glu/E) Ácido glutámico ↓GGAUN
GUG→GCCMORDAZAGGGGRAMO

Tabla de codones de ARN inverso

Aminoácidoscodones de ARNComprimidoAminoácidoscodones de ARNComprimido
Ala, AUGC, CCG, CCG, CCGGCNcuantos yoAUU, AUC, AUAAUH
Argentina, RCGU, CGC, CGA, CGG; AGA, AGGCGN, AGR; o
CGY, MGR
Leu, L.CUU, CUC, CUA, CUG; UUA, UUGCUN, UUR; o
CUY, TU
asn, nUAA, AACAAYLis, K.AAA, AAGAAR
Asp, D.GAU, GACGAYConocí a M.AGO
Asn o Asp, BHEA, OEA; FALSO, CAGRAYOFe, FUUU, UUCUUY
Cis, CUGU, UGCNEGOCIOPro, PUCC, CCC, CCA, CCGCCN
gln, qCAA, CAGCOCHESer, SUCU, UCC, UCA, UCG; AGU, AGCUCN, CEREBRO
PegamentoGAA, GAGEN ABSOLUTOTr, TUCA, ACC, ACA, ACGACN
Gln o Glu, ZCAA, CAG; GAA, GAGRAETrp, WUGG
Gly, GGGU, GGC, GGA, GGGGGNTiro, YUAU, UACUAY
Su, HCAU, CACISLA PEQUEÑAVale, VGUU, GUC, GUA, GUGPISTOLA
COMIENZOAGODETENERUAA, UGA, UAGURA, RAU

Tabla de codones de ADN estándar

Propiedades bioquímicas de aminoácidosno polarflecha arribaPolardagaBásicodaga dobleÁcido ↓Terminación: codón de terminación *Iniciación: posible codón de inicio→
1ra
base
segunda basetercera
base
TCUNGRAMO
TTT(Phe/F) Fenilalaninaflecha arribaTCT(Ser/S) SerinadagaHACER ENCAJE(Tyr/Y) TirosinadagaTGT(Cys/C) CisteínadagaT
TTCTCCTACTGCC
TTA(Leu / L) Leucinaflecha arribaTCATAAStop ( Ocre ) *TGAParada ( Ópalo ) *UN
TTG→JCCETIQUETADetener ( Ámbar ) *TGG(Trp/W) Triptófanoflecha arribaGRAMO
CCTTCCT(Pro/P) Prolinaflecha arribaGATO(Su/H) Histidinadaga dobleCGT(Arg/R) Argininadaga dobleT
CTCCCCCACCGCC
CTACCACAA(Gln/Q) GlutaminadagaCGAUN
CTGCCGCAGCGGGRAMO
UNPARA(Ile/I) Isoleucinaflecha arribaACTUAR(Thr/T) TreoninadagaAAT(Asn/N) AsparaginadagaOCHO(Ser/S) SerinadagaT
ATCCACCAACAGC
ellosACAAAA(Lys/K) Lisinadaga doblePERO(Arg/R) Argininadaga dobleUN
ATG→(Met/M) Metioninaflecha arribaACGAAGAGGGRAMO
GRAMOGTT(Val/V) Valinaflecha arribaGCT(Ala/A) Alaninaflecha arribaREVÓLVER(Asp/D) Ácido aspártico ↓GGT(Gly/G) Glicinaflecha arribaT
GTCCCGCAGGGCC
GTAGCAAGA(Glu/E) Ácido glutámico ↓GGAUN
GTG→GCCMORDAZAGGGGRAMO

Tabla de codones de ADN inverso

Aminoácidoscodones de ADNComprimidoAminoácidoscodones de ADNComprimido
Ala, AGCT, CCG, GCA, GCGGCNcuantos yoATT, ATC, ATAATH
Argentina, RCGT, CGC, CGA, CGG; AGA, AGGCGN, AGR; o
CGY, MGR
Leu, L.CTT, CTC, CTA, CTG; TTA, TTGCTN, TTR; o
CTY, YTR
asn, nAAT, AACAAYLis, K.AAA, AAGAAR
Asp, D.TAG, GACGAYConocí a M.ATG
Asn o Asp, BAAT, AAC; TAG, GACRAYOFe, FTTT, TTCTTY
Cis, CTGT, TGCTGYPro, PCCT, CCC, CCA, CCGCCN
gln, qCAA, CAGCOCHESer, STCT, TCC, TCA, TCG; AGT, AGCTCN, CEREBRO
PegamentoGAA, GAGEN ABSOLUTOTr, TACTO, ACC, ACA, ACGACN
Gln o Glu, ZCAA, CAG; GAA, GAGRAETrp, WTGG
Gly, GGGT, GGC, GGA, GGGGGNTiro, YTAT, TACMANO
Su, HGATO, CACISLA PEQUEÑAVale, VGTT, GTC, GTA, GTGGTN
COMIENZOATGDETENERTAA, TGA, ETIQUETATRA, ALQUITRÁN

Codones alternativos en otras tablas de traducción

Alguna vez se creyó que el código genético era universal: un codón codificaría el mismo aminoácido independientemente del organismo o la fuente. Sin embargo, ahora se acepta que el código genético evoluciona, lo que genera discrepancias en la forma en que se traduce un codón según la fuente genética. Por ejemplo, en 1981 se descubrió que el uso de los codones AUA, UGA, AGA y AGG por parte del sistema de codificación en las mitocondrias de los mamíferos difería del código universal. Los codones de parada también pueden verse afectados: en los protozoos ciliados, los codones de parada universales UAA y UAG codifican para la glutamina. La siguiente tabla muestra estos codones alternativos.

Propiedades bioquímicas de aminoácidosno polarflecha arribaPolardagaBásicodaga dobleÁcido ↓Terminación: codón de terminación *
Código
Tabla de traducción
Codón de ADN involucradoCodón de ARN involucradoTraducción
con este código
traducción estándarnotas
Estándar1Incluye tabla de traducción 8 (cloroplastos vegetales).
Mitocondrial de vertebrados2PEROPERODetenerse *Argentina (R)daga doble
AGGAGGDetenerse *Argentina (R)daga doble
ellosAUAConocido (M)flecha arribaCuanto yo)flecha arriba
TGAUGATrp (W)flecha arribaDetenerse *
Levadura mitocondrial3ellosAUAConocido (M)flecha arribaCuanto yo)flecha arriba
CTTCUUThr (T)dagaLeu (L)flecha arriba
CTCCUCThr (T)dagaLeu (L)flecha arriba
CTACANGREJOThr (T)dagaLeu (L)flecha arriba
CTGCUGThr (T)dagaLeu (L)flecha arriba
TGAUGATrp (W)flecha arribaDetenerse *
CGACGAausenteArgentina (R)daga doble
CGCCGCausenteArgentina (R)daga doble
Moho, protozoos y celenterados mitocondriales + Mycoplasma / Spiroplasma4TGAUGATrp (W)flecha arribaDetenerse *Incluye la tabla de traducción 7 (cinetoplastos).
Mitocondrial de invertebrados5PEROPEROSer (S)dagaArgentina (R)daga doble
AGGAGGSer (S)dagaArgentina (R)daga doble
ellosAUAConocido (M)flecha arribaCuanto yo)flecha arriba
TGAUGATrp (W)flecha arribaDetenerse *
Ciliate, dasycladacean y Hexamita nuclear6TAASAUgln (q)dagaDetenerse *
ETIQUETAUAGgln (q)dagaDetenerse *
Equinodermos y platelmintos mitocondriales9AAAAAAAsn (N)dagaLys (K)daga doble
PEROPEROSer (S)dagaArgentina (R)daga doble
AGGAGGSer (S)dagaArgentina (R)daga doble
TGAUGATrp (W)flecha arribaDetenerse *
Euplotid nuclear10TGAUGACis (C)dagaDetenerse *
Plástido bacteriano, arqueal y vegetal11Consulte la tabla de traducción 1.
Levadura alternativa nuclear12CTGCUGSer (S)dagaLeu (L)flecha arriba
ascidia mitocondrial13PEROPEROGly (G)flecha arribaArgentina (R)daga doble
AGGAGGGly (G)flecha arribaArgentina (R)daga doble
ellosAUAConocido (M)flecha arribaCuanto yo)flecha arriba
TGAUGATrp (W)flecha arribaDetenerse *
Mitocondrial de gusano plano alternativo14AAAAAAAsn (N)dagaLys (K)daga doble
PEROPEROSer (S)dagaArgentina (R)daga doble
AGGAGGSer (S)dagaArgentina (R)daga doble
TAASAUTiro (Y)dagaDetenerse *
TGAUGATrp (W)flecha arribaDetenerse *
Blefarisma nuclear15ETIQUETAUAGgln (q)dagaDetenerse *A partir del 18 de noviembre de 2016: ausente de la actualización del NCBI. Similar a la tabla de traducción 6.
mitocondrial clorofíceodieciséisETIQUETAUAGLeu (L)flecha arribaDetenerse *
trematodo mitocondrial21TGAUGATrp (W)flecha arribaDetenerse *
ellosAUAConocido (M)flecha arribaCuanto yo)flecha arriba
PEROPEROSer (S)Argentina (R)daga doble
AGGAGGSer (S)dagaArgentina (R)daga doble
AAAAAAAsn (N)dagaLys (K)daga doble
Scenedesmus obliquus mitocondrial22TCAUCADetenerse *Ser (S)daga
ETIQUETAUAGLeu (L)flecha arribaDetenerse *
Thraustochytrium mitocondrial23TTAUUADetenerse *Leu (L)flecha arribaSimilar a la tabla de traducción 11.
Pterobranchia mitocondrial24PEROPEROSer (S)dagaArgentina (R)daga doble
AGGAGGLys (K)daga dobleArgentina (R)daga doble
TGAUGATrp (W)flecha arribaDetenerse *
División candidata SR1 y Gracilibacteria25TGAUGAGly (G)flecha arribaDetenerse *
Pachysolen tannophilus nuclear26CTGCUGAla (A)flecha arribaLeu (L)flecha arriba
cariorelicto nuclear27TAASAUgln (q)dagaDetenerse *
ETIQUETAUAGgln (q)dagaDetenerse *
TGUGADetenerse *oTrp (W)flecha arribaDetenerse *
condilostoma nuclear28TAASAUDetenerse *ogln (q)dagaDetenerse *
ETIQUETAUAGDetenerse *ogln (q)dagaDetenerse *
TGAUGADetenerse *oTrp (W)flecha arribaDetenerse *
mesodinio nuclear29TAASAUTiro (Y)dagaDetenerse *
ETIQUETAUAGTiro (Y)dagaDetenerse *
peritrico nuclear30ejército de reservaSAUGlú (E) ↓Detenerse *
ETIQUETAUAGGlú (E) ↓Detenerse *
Blastocrithidia nuclear31TAASAUDetenerse *oGlú (E) ↓Detenerse *
ETIQUETAUAGDetenerse *oGlú (E) ↓Detenerse *
TGAUGATrp (W)flecha arribaDetenerse *
Código mitocondrial de Cephalodiscidae33PEROPEROSer (S)dagaArgentina (R)daga dobleSimilar a la tabla de traducción 24.
AGGAGGLys (K)daga dobleArgentina (R)daga doble
TAASAUTiro (Y)dagaDetenerse *
TGAUGATrp (W)flecha arribaDetenerse *