Tablas de codones
Se puede usar una tabla de codones para traducir un código genético en una secuencia de aminoácidos. El código genético estándar se representa tradicionalmente como una tabla de codones de ARN, porque cuando los ribosomas producen proteínas en una célula, es el ARN mensajero (ARNm) el que dirige la síntesis de proteínas. La secuencia de ARNm está determinada por la secuencia de ADN genómico. En este contexto, el código genético estándar se denomina tabla de traducción 1. También se puede representar en una tabla de codones de ADN. Los codones de ADN en dichas tablas se encuentran en la cadena de ADN sentido y están dispuestos en una dirección de 5′ a 3′. Se utilizan diferentes tablas con codones alternos dependiendo de la fuente del código genético, como de un núcleo celular, mitocondria, plástido o hidrogenosoma.
Hay 64 codones diferentes en el código genético y las tablas a continuación; la mayoría especifica un aminoácido. Tres secuencias, UAG, UGA y UAA, conocidas como codones de parada, no codifican un aminoácido sino que señalan la liberación del polipéptido naciente del ribosoma. En el código estándar, la secuencia AUG, que se lee como metionina, puede servir como codón de inicio y, junto con secuencias como un factor de iniciación, inicia la traducción. En raras ocasiones, los codones de inicio en el código estándar también pueden incluir GUG o UUG; estos codones normalmente representan valina y leucina, respectivamente, pero como codones de inicio se traducen como metionina o formilmetionina.
La primera tabla, la tabla estándar, se puede utilizar para traducir tripletes de nucleótidos en el aminoácido correspondiente o en la señal adecuada si se trata de un codón de inicio o finalización. La segunda tabla, apropiadamente llamada la inversa, hace lo contrario: se puede usar para deducir un posible código de triplete si se conoce el aminoácido. Como varios codones pueden codificar el mismo aminoácido, en algunos casos se proporciona la notación de ácido nucleico de la Unión Internacional de Química Pura y Aplicada (IUPAC).
Tabla de traducción 1
Tabla de codones de ARN estándar
Propiedades bioquímicas de aminoácidos | no polar | Polar | Básico | Ácido ↓ | Terminación: codón de terminación * | Iniciación: posible codón de inicio |
1ra base | segunda base | tercera base | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
tu | C | UN | GRAMO | ||||||
tu | UUU | (Phe/F) Fenilalanina | INCLINAR | (Ser/S) Serina | GUAU | (Tyr/Y) Tirosina | UGU | (Cys/C) Cisteína | tu |
UUC | UCC | UAC | CGU | C | |||||
UUA | (Leu / L) Leucina | UCA | SAU | Stop ( Ocre ) * | UGA | Parada ( Ópalo ) * | UN | ||
UUG | UCG | UAG | Detener ( Ámbar ) * | UGG | (Trp/W) Triptófano | GRAMO | |||
C | CUU | UCC | (Pro/P) Prolina | PRECAUCIÓN | (Su/H) Histidina | TOS | (Arg/R) Arginina | tu | |
CUC | CCC | CAC | CGC | C | |||||
CANGREJO | CCA | CAA | (Gln/Q) Glutamina | CGA | UN | ||||
CUG | CCG | CAG | CGG | GRAMO | |||||
UN | AUU | (Ile/I) Isoleucina | A ELLOS | (Thr/T) Treonina | UCA | (Asn/N) Asparagina | AGU | (Ser/S) Serina | tu |
ABC | CAC | CAA | CAG | C | |||||
AUA | ACA | AAA | (Lys/K) Lisina | PERO | (Arg/R) Arginina | UN | |||
AGO | (Met/M) Metionina | ACG | AAG | AGG | GRAMO | ||||
GRAMO | GUU | (Val/V) Valina | GCU | (Ala/A) Alanina | CERRADO | (Asp/D) Ácido aspártico ↓ | GGU | (Gly/G) Glicina | tu |
FUERZA | CCG | CAG | GGC | C | |||||
CUEVA | GCA | AGA | (Glu/E) Ácido glutámico ↓ | GGA | UN | ||||
GUG | GCC | MORDAZA | GGG | GRAMO |
Tabla de codones de ARN inverso
Aminoácidos | codones de ARN | Comprimido | Aminoácidos | codones de ARN | Comprimido | |
---|---|---|---|---|---|---|
Ala, A | UGC, CCG, CCG, CCG | GCN | cuantos yo | AUU, AUC, AUA | AUH | |
Argentina, R | CGU, CGC, CGA, CGG; AGA, AGG | CGN, AGR; o CGY, MGR | Leu, L. | CUU, CUC, CUA, CUG; UUA, UUG | CUN, UUR; o CUY, TU | |
asn, n | UAA, AAC | AAY | Lis, K. | AAA, AAG | AAR | |
Asp, D. | GAU, GAC | GAY | Conocí a M. | AGO | ||
Asn o Asp, B | HEA, OEA; FALSO, CAG | RAYO | Fe, F | UUU, UUC | UUY | |
Cis, C | UGU, UGC | NEGOCIO | Pro, P | UCC, CCC, CCA, CCG | CCN | |
gln, q | CAA, CAG | COCHE | Ser, S | UCU, UCC, UCA, UCG; AGU, AGC | UCN, CEREBRO | |
Pegamento | GAA, GAG | EN ABSOLUTO | Tr, T | UCA, ACC, ACA, ACG | ACN | |
Gln o Glu, Z | CAA, CAG; GAA, GAG | RAE | Trp, W | UGG | ||
Gly, G | GGU, GGC, GGA, GGG | GGN | Tiro, Y | UAU, UAC | UAY | |
Su, H | CAU, CAC | ISLA PEQUEÑA | Vale, V | GUU, GUC, GUA, GUG | PISTOLA | |
COMIENZO | AGO | DETENER | UAA, UGA, UAG | URA, RAU |
Tabla de codones de ADN estándar
Propiedades bioquímicas de aminoácidos | no polar | Polar | Básico | Ácido ↓ | Terminación: codón de terminación * | Iniciación: posible codón de inicio |
1ra base | segunda base | tercera base | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
T | C | UN | GRAMO | ||||||
T | TT | (Phe/F) Fenilalanina | TCT | (Ser/S) Serina | HACER ENCAJE | (Tyr/Y) Tirosina | TGT | (Cys/C) Cisteína | T |
TTC | TCC | TAC | TGC | C | |||||
TTA | (Leu / L) Leucina | TCA | TAA | Stop ( Ocre ) * | TGA | Parada ( Ópalo ) * | UN | ||
TTG | JCC | ETIQUETA | Detener ( Ámbar ) * | TGG | (Trp/W) Triptófano | GRAMO | |||
C | CTT | CCT | (Pro/P) Prolina | GATO | (Su/H) Histidina | CGT | (Arg/R) Arginina | T | |
CTC | CCC | CAC | CGC | C | |||||
CTA | CCA | CAA | (Gln/Q) Glutamina | CGA | UN | ||||
CTG | CCG | CAG | CGG | GRAMO | |||||
UN | PARA | (Ile/I) Isoleucina | ACTUAR | (Thr/T) Treonina | AAT | (Asn/N) Asparagina | OCHO | (Ser/S) Serina | T |
ATC | CAC | CAA | CAG | C | |||||
ellos | ACA | AAA | (Lys/K) Lisina | PERO | (Arg/R) Arginina | UN | |||
ATG | (Met/M) Metionina | ACG | AAG | AGG | GRAMO | ||||
GRAMO | GTT | (Val/V) Valina | GCT | (Ala/A) Alanina | REVÓLVER | (Asp/D) Ácido aspártico ↓ | GGT | (Gly/G) Glicina | T |
GTC | CCG | CAG | GGC | C | |||||
GTA | GCA | AGA | (Glu/E) Ácido glutámico ↓ | GGA | UN | ||||
GTG | GCC | MORDAZA | GGG | GRAMO |
Tabla de codones de ADN inverso
Aminoácidos | codones de ADN | Comprimido | Aminoácidos | codones de ADN | Comprimido | |
---|---|---|---|---|---|---|
Ala, A | GCT, CCG, GCA, GCG | GCN | cuantos yo | ATT, ATC, ATA | ATH | |
Argentina, R | CGT, CGC, CGA, CGG; AGA, AGG | CGN, AGR; o CGY, MGR | Leu, L. | CTT, CTC, CTA, CTG; TTA, TTG | CTN, TTR; o CTY, YTR | |
asn, n | AAT, AAC | AAY | Lis, K. | AAA, AAG | AAR | |
Asp, D. | TAG, GAC | GAY | Conocí a M. | ATG | ||
Asn o Asp, B | AAT, AAC; TAG, GAC | RAYO | Fe, F | TTT, TTC | TTY | |
Cis, C | TGT, TGC | TGY | Pro, P | CCT, CCC, CCA, CCG | CCN | |
gln, q | CAA, CAG | COCHE | Ser, S | TCT, TCC, TCA, TCG; AGT, AGC | TCN, CEREBRO | |
Pegamento | GAA, GAG | EN ABSOLUTO | Tr, T | ACTO, ACC, ACA, ACG | ACN | |
Gln o Glu, Z | CAA, CAG; GAA, GAG | RAE | Trp, W | TGG | ||
Gly, G | GGT, GGC, GGA, GGG | GGN | Tiro, Y | TAT, TAC | MANO | |
Su, H | GATO, CAC | ISLA PEQUEÑA | Vale, V | GTT, GTC, GTA, GTG | GTN | |
COMIENZO | ATG | DETENER | TAA, TGA, ETIQUETA | TRA, ALQUITRÁN |
Codones alternativos en otras tablas de traducción
Alguna vez se creyó que el código genético era universal: un codón codificaría el mismo aminoácido independientemente del organismo o la fuente. Sin embargo, ahora se acepta que el código genético evoluciona, lo que genera discrepancias en la forma en que se traduce un codón según la fuente genética. Por ejemplo, en 1981 se descubrió que el uso de los codones AUA, UGA, AGA y AGG por parte del sistema de codificación en las mitocondrias de los mamíferos difería del código universal. Los codones de parada también pueden verse afectados: en los protozoos ciliados, los codones de parada universales UAA y UAG codifican para la glutamina. La siguiente tabla muestra estos codones alternativos.
Propiedades bioquímicas de aminoácidos | no polar | Polar | Básico | Ácido ↓ | Terminación: codón de terminación * |
Código | Tabla de traducción | Codón de ADN involucrado | Codón de ARN involucrado | Traducción con este código | traducción estándar | notas | ||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Estándar | 1 | Incluye tabla de traducción 8 (cloroplastos vegetales). | ||||||
Mitocondrial de vertebrados | 2 | PERO | PERO | Detenerse * | Argentina (R) | |||
AGG | AGG | Detenerse * | Argentina (R) | |||||
ellos | AUA | Conocido (M) | Cuanto yo) | |||||
TGA | UGA | Trp (W) | Detenerse * | |||||
Levadura mitocondrial | 3 | ellos | AUA | Conocido (M) | Cuanto yo) | |||
CTT | CUU | Thr (T) | Leu (L) | |||||
CTC | CUC | Thr (T) | Leu (L) | |||||
CTA | CANGREJO | Thr (T) | Leu (L) | |||||
CTG | CUG | Thr (T) | Leu (L) | |||||
TGA | UGA | Trp (W) | Detenerse * | |||||
CGA | CGA | ausente | Argentina (R) | |||||
CGC | CGC | ausente | Argentina (R) | |||||
Moho, protozoos y celenterados mitocondriales + Mycoplasma / Spiroplasma | 4 | TGA | UGA | Trp (W) | Detenerse * | Incluye la tabla de traducción 7 (cinetoplastos). | ||
Mitocondrial de invertebrados | 5 | PERO | PERO | Ser (S) | Argentina (R) | |||
AGG | AGG | Ser (S) | Argentina (R) | |||||
ellos | AUA | Conocido (M) | Cuanto yo) | |||||
TGA | UGA | Trp (W) | Detenerse * | |||||
Ciliate, dasycladacean y Hexamita nuclear | 6 | TAA | SAU | gln (q) | Detenerse * | |||
ETIQUETA | UAG | gln (q) | Detenerse * | |||||
Equinodermos y platelmintos mitocondriales | 9 | AAA | AAA | Asn (N) | Lys (K) | |||
PERO | PERO | Ser (S) | Argentina (R) | |||||
AGG | AGG | Ser (S) | Argentina (R) | |||||
TGA | UGA | Trp (W) | Detenerse * | |||||
Euplotid nuclear | 10 | TGA | UGA | Cis (C) | Detenerse * | |||
Plástido bacteriano, arqueal y vegetal | 11 | Consulte la tabla de traducción 1. | ||||||
Levadura alternativa nuclear | 12 | CTG | CUG | Ser (S) | Leu (L) | |||
ascidia mitocondrial | 13 | PERO | PERO | Gly (G) | Argentina (R) | |||
AGG | AGG | Gly (G) | Argentina (R) | |||||
ellos | AUA | Conocido (M) | Cuanto yo) | |||||
TGA | UGA | Trp (W) | Detenerse * | |||||
Mitocondrial de gusano plano alternativo | 14 | AAA | AAA | Asn (N) | Lys (K) | |||
PERO | PERO | Ser (S) | Argentina (R) | |||||
AGG | AGG | Ser (S) | Argentina (R) | |||||
TAA | SAU | Tiro (Y) | Detenerse * | |||||
TGA | UGA | Trp (W) | Detenerse * | |||||
Blefarisma nuclear | 15 | ETIQUETA | UAG | gln (q) | Detenerse * | A partir del 18 de noviembre de 2016: ausente de la actualización del NCBI. Similar a la tabla de traducción 6. | ||
mitocondrial clorofíceo | dieciséis | ETIQUETA | UAG | Leu (L) | Detenerse * | |||
trematodo mitocondrial | 21 | TGA | UGA | Trp (W) | Detenerse * | |||
ellos | AUA | Conocido (M) | Cuanto yo) | |||||
PERO | PERO | Ser (S) | Argentina (R) | |||||
AGG | AGG | Ser (S) | Argentina (R) | |||||
AAA | AAA | Asn (N) | Lys (K) | |||||
Scenedesmus obliquus mitocondrial | 22 | TCA | UCA | Detenerse * | Ser (S) | |||
ETIQUETA | UAG | Leu (L) | Detenerse * | |||||
Thraustochytrium mitocondrial | 23 | TTA | UUA | Detenerse * | Leu (L) | Similar a la tabla de traducción 11. | ||
Pterobranchia mitocondrial | 24 | PERO | PERO | Ser (S) | Argentina (R) | |||
AGG | AGG | Lys (K) | Argentina (R) | |||||
TGA | UGA | Trp (W) | Detenerse * | |||||
División candidata SR1 y Gracilibacteria | 25 | TGA | UGA | Gly (G) | Detenerse * | |||
Pachysolen tannophilus nuclear | 26 | CTG | CUG | Ala (A) | Leu (L) | |||
cariorelicto nuclear | 27 | TAA | SAU | gln (q) | Detenerse * | |||
ETIQUETA | UAG | gln (q) | Detenerse * | |||||
TG | UGA | Detenerse * | o | Trp (W) | Detenerse * | |||
condilostoma nuclear | 28 | TAA | SAU | Detenerse * | o | gln (q) | Detenerse * | |
ETIQUETA | UAG | Detenerse * | o | gln (q) | Detenerse * | |||
TGA | UGA | Detenerse * | o | Trp (W) | Detenerse * | |||
mesodinio nuclear | 29 | TAA | SAU | Tiro (Y) | Detenerse * | |||
ETIQUETA | UAG | Tiro (Y) | Detenerse * | |||||
peritrico nuclear | 30 | ejército de reserva | SAU | Glú (E) ↓ | Detenerse * | |||
ETIQUETA | UAG | Glú (E) ↓ | Detenerse * | |||||
Blastocrithidia nuclear | 31 | TAA | SAU | Detenerse * | o | Glú (E) ↓ | Detenerse * | |
ETIQUETA | UAG | Detenerse * | o | Glú (E) ↓ | Detenerse * | |||
TGA | UGA | Trp (W) | Detenerse * | |||||
Código mitocondrial de Cephalodiscidae | 33 | PERO | PERO | Ser (S) | Argentina (R) | Similar a la tabla de traducción 24. | ||
AGG | AGG | Lys (K) | Argentina (R) | |||||
TAA | SAU | Tiro (Y) | Detenerse * | |||||
TGA | UGA | Trp (W) | Detenerse * |
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