Clase de enzimas
Protein family
En enzimología, una
undecaprenil-difosfatasa (EC 3.6.1.27) es una enzima que cataliza la reacción química.
- undecaprenil diphosphate + H2O
undecaprenil fosfato + fosfato
Por lo tanto, los dos sustratos de esta enzima son el difosfato de undecaprenilo y el H₂O, mientras que sus dos productos son el fosfato de undecaprenilo y el fosfato. La actividad enzimática se ve potenciada por cationes divalentes, en particular el Ca₂.En muchas bacterias, esta enzima es una proteína de membrana que participa en la biosíntesis de peptidoglicanos. Se la ha relacionado con la resistencia al antibiótico bacitracina.
Nomenclature
Esta enzima pertenece a la familia de las hidrolasas, específicamente a las que actúan sobre anhídridos de ácido en anhídridos fosforados. El nombre sistemático de esta clase de enzimas es undecaprenil-difosfato fosfohidrolasa. Otros nombres comunes incluyen undecaprenil-pirofosfato fosfatasa (Uppp), fosfatasa UPP, BacA, C55-isoprenil difosfatasa, C55-isoprenil pirofosfatasa e isoprenil pirofosfatasa.Nota: La enzima Uppp/BacA (EC 3.6.1.27) se ha denominado incorrectamente en ocasiones "undecaprenol quinasa". Sin embargo, este nombre debería reservarse para una enzima específica (EC 2.7.1.66), que cataliza la adición de un grupo fosfato del ATP al undecaprenol (alcohol isoprenílico C55).
Estructura
Se encuentran disponibles las estructuras cristalinas de rayos X de la enzima en forma de membrana de E. coli (ID de PDB: 5OON, 6CB2).
Referencias
- ^ Chalker AF, Ingraham KA, Lunsford RD, Bryant AP, Bryant J, Wallis NG, Broskey JP, Pearson SC, Holmes DJ (Julio 2000). "El gen bacA, que determina la susceptibilidad de la bacitracina en Streptococcus pneumoniae y Staphylococcus aureus, también es necesario para la virulencia". Microbiología. 146 (Pt 7): 1547 –53. doi:10.1099/00221287-146-7-1547. PMID 10878119.
- ^ "undecaprenyl diphosphate (YMDB00637) - Yeast Metabolome Database". www.ymdb.ca. Retrieved 2023-09-07.
- ^ El Ghachi M, Bouhss A, Blanot D, Mengin-Lecreulx D (julio de 2004). "El gen bacA de Escherichia coli codifica una actividad de fosfatasa no decaprenil pirofosfato". El Diario de Química Biológica. 279 (29): 30106–13. doi:10.1074/jbc.M401701200. PMID 15138271.
- ^ El Ghachi M, Howe N, Huang CY, Olieric V, Warshamanage R, Touzé T, Weichert D, Stansfeld PJ, Wang M, Kerff F, Caffrey M (marzo 2018). "Crystal structure of undecaprenyl-pyrophosphate phosphatase and its role in peptidoglycan biosynthesis". Nature Communications. 9 (1): 1078. doi:10.1038/s41467-018-03477-5. 5852022. PMID 29540682.
- ^ Workman SD, Worrall LJ, Strynadka NC (marzo 2018). "La estructura Cristal de una fosfatasa intramembranal central a la biosíntesis de paredes celulares bacterianas y reciclaje de lípidos". Nature Communications. 9 (1): 1159. doi:10.1038/s41467-018-03547-8. 5861054. PMID 29559664.
- ^ "5OON - Estructura de la fosfata de undecaprenil-Pyrofosfato, BacA". RCSB Proteína Data Bank.
- ^ "6CB2 - Estructura de cristal de Escherichia coli UppP". RCSB Proteína Data Bank.
Más lectura
- Goldman R, Strominger JL (agosto de 1972). "Purificación y propiedades de C 55 -isoprenilpirofosfato fosfatasa de Micrococcus lysodeikticus". El Diario de Química Biológica. 247 (16): 5116–22. PMID 4341539.
Hidrolas: hidrolasas de anhídrido ácido (EC 3,6) |
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3.6.1 | - Pirofosfatasa
- Apyrase
- Tiamina-trifosfatasa
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3.6.2 | - Adenlylsulfatase
- Phosphoadenylylsulfatase
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3.6.3-4: AT Pase | 3.6.3 | Cu++ (3.6.3.4) | |
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Ca+ (3.6.3.8) | - SERCA
- Membrana de plasma
- SPCA
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Na+/K+ (3.6.3.9) | - ATP1A1
- ATP1A2
- ATP1A3
- ATP1A4
- ATP1B1
- ATP1B2
- ATP1B3
- ATP1B4
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H+/K+ (3.6.3.10) | |
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Otros P tipo ATPase | - ATP8B1
- ATP10A
- ATP11B
- ATP12A
- ATP13A2
- ATP13A3
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3.6.4 | - Dynein
- Kinesin
- Myosin
- Katanin
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3.6.5: GTPase | 3.6.5.1: Proteína heterotrimérica G | - Gαs
- Gαi
- GNAI1
- GNAI2
- GNAI3
- Transducin
- Gustducin
- Gαq/11
- Gα12/13
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3.6.5.2: GTPase pequeño Ras superfamilia | - Rho family of GTPases: Cdc42
- RhoUV
- Rac
- RhoBTB
- RhoH
- Rho
- Rnd
- RhoDF
- otros: Ras
- Rab
- Arf
- Ran
- Rheb
- Rapto
- RGK
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3.6.5.3: Protein-synthesizing GTPase | |
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3.6.5.5-6: motores de polimerización | - dynamin superfamily
- Dynamin
- Proteína de unión de guanylates
- Mitofusin-1
- MX1 y MX2
- OPA1
- Tubulina
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Enzymes |
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Actividad | - Sitio activo
- Sitio de enlace
- Triada catalítica
- Oxyanion hole
- Enzyme promiscuity
- Enzima limitada a la difusión
- Cofactor
- Enzyme catalysis
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Reglamento | - Regulación alosterica
- Cooperatividad
- Inhibidor enzima
- Activador de Enzyme
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Clasificación | - Número de la CE
- Enzyme superfamilia
- Enzyme family
- Lista de enzimas
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Kinetics | - Enzyme kinetics
- Eadie-Hofstee diagram
- Hanes-Woolf plot
- Lineweaver-Burk plot
- Michaelis–Cinética de los hombres
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Tipos | - EC1 Oxidoreductas (lista)
- EC2 Transferases (lista)
- CE3 Hidrolas (lista)
- EC4 Lías (lista)
- EC5 Isomerases (lista)
- Ligas CE6 (lista)
- Translocases EC7 (lista)
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