Selaginella moellendorffii
Selaginella moellendorffii es una licófita que es un organismo modelo importante, especialmente en genómica comparativa. S. moellendorffii es miembro de un antiguo linaje de plantas vasculares que apareció por primera vez en el registro fósil hace unos 400 millones de años. Más tarde formarían una parte dominante de la flora del mundo durante el período Carbonífero. Tienen una serie de características inusuales y/o "primitivas", como hojas rudimentarias (micrófilas), ramificación dicotómica ubicua, heterosporía y lígula. Como el primer grupo divergente de plantas vasculares modernas, son esenciales para comprender la evolución de las plantas en su conjunto.
Secuenciación de genomas
El tamaño del genoma nuclear es de aproximadamente 100 megapares de bases, uno de los tamaños de genoma más pequeños encontrados para cualquier especie vegetal. El genoma ha sido secuenciado y ensamblado por el Instituto Conjunto del Genoma (DOE JGI) del Departamento de Energía de los Estados Unidos. La anotación comunitaria de los genes y otros elementos de este genoma comenzó en septiembre de 2007. El contenido genético de S. moellendorffii y otros taxones diversos ha demostrado que la transición de un ciclo de vida dominado por gametofitos a un ciclo de vida dominado por esporofitos implicó la adición de menos genes nuevos que el paso de plantas vasculares sin semillas (licofitas) a plantas con flores (angiospermas).
Hecht et al., 2011, descubre que S. moellendorffii tiene el mayor contenido de guanina + citosina de cualquier ADN organelar. Su ADN mitocondrial es 68% G+C; ambos son componentes típicamente raros de cualquier ADN organelar.
Referencias
- ^ Selaginella moellendorffii v1.0, United States Department of Energy Joint Genomics Institute (DOE JGI), 2007, recuperado 2008-02-26
- ^ Banks, Jo Ann; Nishiyama, Tomoaki; Hasebe, Mitsuyasu; Bowman, John L.; Gribskov, Michael; dePamphilis, Claude; Albert, Victor A.; Aono, Naoki; Aoyama, Tsuyoshi (2011-05-20). "La Selaginella Genome identifica los cambios genéticos asociados con la evolución de las plantas vasculares". Ciencia. 332 (6032): 960 –963. doi:10.1126/science.1203810. ISSN 0036-8075. PMC 3166216. PMID 21551031.
- ^ a b Esta revisión David Roy Smith; Patrick J. Keeling (2015). "Arquitectura de genomas mitocondriales y plastoides: temas recurrentes, pero diferencias significativas en los extremos". Actas de la Academia Nacional de Ciencias. 112: 10177 –10184. cites Julia Hecht; Felix Grewe; Volker Knoop (2011). "Extreme RNA Editing in Coding Islands and Abundant Microsatellites in Repita Sequences of Selaginella moellendorffii Mitochondria: The Root of Frequent Plant mtDNA Recombination in Early Tracheophytes". Biología genoma y evolución. 3: 344 –358. doi:10.1093/gbe/evr027. PMC 5654404. S2CID 12973234.
Enlaces externos
- American Society for Plant Biology Selaginella education page
- Selaginella genomics website - contribuir a la anotación genoma
- Purdue University's Selaginella Wiki