Sapovirus

Sapovirus es un género genéticamente diverso de virus sin envoltura, de ARN monocatenario de sentido positivo, perteneciente a la familia Caliciviridae. Junto con el norovirus, los sapovirus son la causa más común de gastroenteritis aguda (comúnmente llamada "gripe estomacal", aunque no está relacionada con la influenza) en humanos y animales. Es un taxón monotípico que contiene solo una especie, el virus Sapporo.

Los huéspedes naturales del virus son los seres humanos y los cerdos. El virus se transmite por contacto oral o fecal. El sapovirus se presenta comúnmente en niños y bebés y, por lo tanto, se propaga a menudo en guarderías y centros de día; sin embargo, también se ha encontrado en centros de atención a largo plazo. Esto podría deberse a la falta de medidas de higiene personal y saneamiento. Los síntomas comunes incluyen diarrea y vómitos. El sapovirus se descubrió inicialmente en un brote de gastroenteritis en un orfanato en Sapporo, Japón, en 1977.

El Sapovirus se extiende a través de la ruta fecal-oral. Personas infectadas expulsan más que ${\displaystyle 10^{9}$ partículas/gramos de heces o vómitos. Las partículas del individuo infectado siguen siendo viables durante años, y una dosis infecciosa puede ser tan pocas como 10 partículas. La contaminación de superficies de trabajo, manos, etc. puede causar un gran número de nuevas infecciones. La infección puede ocurrir si las partículas son inhaladas, como cuando las partículas se aerosolizan cuando los que están infectados vómito, o cuando el inodoro es inhalado después de un vómito individual infectado. Otras formas de transmisión incluyen el manejo excesivo de alimentos por un individuo infectado (esto ocurre más comúnmente en un entorno de restaurante), el consumo de mariscos que vivían en aguas contaminadas con materia fecal infectada, y la ingestión de agua contaminada.

Después de un período de incubación de 1 a 4 días, comienzan a aparecer los síntomas de la enfermedad. Los síntomas del sapovirus son muy similares a los del norovirus. Los síntomas más comunes son vómitos y diarrea. Sin embargo, pueden aparecer síntomas adicionales, como escalofríos, náuseas, dolor de cabeza, calambres abdominales, mialgia y fiebre, aunque es muy poco frecuente. Si bien los pacientes suelen comenzar a mostrar síntomas después del período de incubación de 1 a 4 días, ha habido casos en los que un individuo es asintomático. Aunque el individuo no muestra síntomas, aún es capaz de propagar el virus a través del modo general de transmisión, que es la vía oral-fecal.

La higiene sanitaria general es el método más importante para prevenir el sapovirus. Esto se puede hacer lavándose bien las manos después de usar el baño y antes de comer o preparar alimentos. El desinfectante de manos a base de alcohol no es eficaz contra el sapovirus. Las superficies contaminadas deben limpiarse con desinfectante o soluciones que contengan cloro. Otras medidas preventivas incluyen evitar el contacto y compartir bebidas o alimentos con personas infectadas.

• Los pacientes afectados deben estar aislados y los funcionarios infectados deben suspenderse del trabajo.
• Los lavadores de cacerolas deben ser conscientes y educados para que puedan trabajar con precaución.
• Si se produce un brote extremo, "puede ser necesario cerrar las salas a nuevas admisiones".
• "Debe prohibirse el movimiento de las personas afectadas a las salas no afectadas: se detienen las actividades de grupos y se desalientan las visitas de los niños".

No existe ningún medicamento específico para las personas infectadas con sapovirus. El sapovirus no se puede tratar con antibióticos porque no es una infección bacteriana. Los tratamientos incluyen el apoyo a los síntomas, como la rehidratación del individuo.

El sapovirus es un virus de ARN monocatenario, de polaridad positiva y sin envoltura, de aproximadamente 7,7 kb de tamaño. El virus tiene una cola poli(A) de 3' pero no una tapa de 5'. El sapovirus tiene una estructura icosaédrica que contiene 180 subunidades (T=3). El diámetro de la cápside es de entre 27 y 40 nm. Al igual que otros calicivirus, la cápside del sapovirus tiene protuberancias redondeadas en su superficie. Sin embargo, su morfología superficial de "estrella de David" lo distingue de otros calicivirus.

El genoma del sapovirus está organizado en dos (posiblemente tres) marcos de lectura abiertos (ORF) bien conocidos. El ORF1 codifica proteínas no estructurales y VP1, la proteína principal de la cápside. VP1 tiene dos dominios estándar, el de la cubierta (S) y el de la protuberancia (P). La función de la proteína S es "formar el andamiaje alrededor del ácido nucleico", mientras que la proteína P es importante para formar un "homodímero con los receptores". El ORF2 codifica poliproteínas estructurales menores, VP2. Si bien se ha predicho la existencia de un tercer ORF (ORF3), no hay pruebas de cuál es su función.

Se han analizado e identificado al menos 21 genomas completos de sapovirus, todos los cuales pueden clasificarse en cinco categorías (GI-GV), que a su vez pueden dividirse en diferentes grupos genéticos. Cuatro de los cinco grupos (GI, GII, GIV, GV) pueden infectar a los humanos y estos cuatro grupos corresponden a las cuatro cepas antigénicamente distintas de sapovirus: Sapporo, Houston, Londres y Estocolmo. Si bien existen al menos 21 genotipos de este virus, se siguen reportando nuevos en América, Asia y Europa.

Genus	Estructura	Simmetría	Capsid	Disposición genómica	segmentación genómica
Sapovirus	Icosahedral	T=3	No desarrollada	Linear	Monopartito

La PCR con transcripción inversa (RT-PCR) es la herramienta de detección más utilizada para el sapovirus debido a su amplia reactividad, sensibilidad, velocidad y especificidad. Debido a la diversidad del sapovirus, se han diseñado cientos de iniciadores para atacar y amplificar específicamente la ARN polimerasa dependiente de ARN. Esto se puede utilizar para "caracterizar parcialmente el sapovirus e investigar la similitud del sapovirus detectado".

"Los sapovirus se pueden distinguir morfológicamente de otros patógenos de la gastroenteritis (p. ej., norovirus, rotavirus, astrovirus o adenovirus) por su típica morfología superficial en forma de "estrella de David" al microscopio electrónico. Sin embargo, esta característica tiene una sensibilidad baja en comparación con los métodos de detección de ácidos nucleicos."

Ensayos de inmunosorbentes ligados a enzimas (ELISA) se han utilizado para detectar sapovirus humano de muestras clínicas. Si bien ELISA puede usarse para detectar antígenos de sapovirus humanos, no se usa comúnmente. La diversidad de las muchas cepas del sapovirus dificulta la detección de la amplia gama de antígenos que pueden estar presentes. Debido a que hay muchos antígenos posibles, ELISA no es tan preciso o tan sensible como los métodos de detección de ácido nucleico.

no se ha determinado el ciclo de replicación exacto del sapovirus; Sin embargo, se cree que tiene el mismo ciclo de replicación citoplasmática o similar que muestran otros calicivirus. El ciclo de replicación citoplasmática es el siguiente:

1. La entrada en la célula huésped se logra mediante el apego a los receptores anfitriones, que media la endocitosis del virus en la célula huésped.
2. Descodificación y liberación del ARN genómico viral en el citoplasma.
3. El VPg se elimina del ARN viral, que luego se traduce en una poliproteína ORF1 procesada para producir las proteínas de replicación.
4. La replicación ocurre en las fábricas virales. Un genoma dsRNA se sintetiza del ss genómicoRNA(+).
5. El genoma dsRNA se transcribe/replica con lo que proporciona mRNAs virales/nuevos genomas ssRNA(+).
6. La traducción subgenomic RNA da lugar a la proteína capsida y VP2.
7. Asamblea de nuevas partículas de virus y liberación por lisis celular."

Usando la microscopía electrónica, el sapovirus se observó por primera vez en muestras de heces diarreicas del Reino Unido en 1977 y pronto se conoció como un patógeno de gastroenteritis. Mientras que el virus se vio por primera vez en el Reino Unido, la cepa prototipo del género Sapovirus fue de otro brote en Sapporo, Japón en 1982. " El primer genoma completo del sapovirus se interpretó a partir de la cepa de Manchester en el Reino Unido en 1993. Anteriormente, los sapovirus se llamaban "Virus tipo Sapporo " ;; Sin embargo, en 2002, se cambiaron al virus de Sapporo de especies, género sapovirus , en la familia caliciviridae . " Actualmente, la familia Caliciviridae consta de cinco géneros establecidos: Sapovirus, Norovirus, Lagovirus, Vesivirus , y Nebovirus. "

Un resultado positivo para la infección por sapovirus se confirmó en el Hospital Gisborne en Nueva Zelanda. Se encontraron dos casos adicionales en los miembros del personal y cinco pacientes adicionales se pusieron en aislamiento. El personal del hospital utilizó medidas de precaución mediante el uso de protección personal al ingresar a las habitaciones.

Cincuenta y cinco miembros de la facultad de una universidad en el condado de Taipei habían sido diagnosticados con infección por sapovirus.

" Utilizando datos de los departamentos de salud pública de Oregón y Minnesota, los investigadores investigaron 2161 brotes de gastroenteritis entre 2002 hasta 2009. Probado adicionalmente para otros virus gastrointestinales que incluyen sapovirus, astrovirus, adenovirus y rotavirus. El sapovirus se identificó en 21 brotes (23 por ciento), con el 66 por ciento de estos ocurriendo en instalaciones de atención a largo plazo. Cerca de la mitad de estos casos ocurrieron solo en 2007. " Los investigadores explicaron además que si bien la proporción de sapovirus que ocurre en las instalaciones de atención a largo plazo era alta, probablemente era un artefacto de informes de brotes legalmente obligatorios.

norovirus se asocia más comúnmente con el sapovirus. Los genomas de norovirus y sapovirus están muy relacionados; La distinción entre los dos solo se puede hacer de las diferencias en su estrategia de codificación y marcos de lectura. Los norovirus, junto con los sapovirus, son la causa más común de gastroenteritis y, por lo tanto, muestran los mismos síntomas que los demás.

Astrovirus , como el sapovirus, causa gastroenteritis en los niños y los ancianos, especialmente aquellos que están inmunocomprometidos. Mientras que Sapovirus tiene dos ORF, el astrovirus tiene tres. El astrovirus también tiene 6 cepas recombinantes. El astrovirus se replica dentro del citoplasma y se propaga fácilmente en el tracto gastrointestinal.

rotavirus , como norovirus, astrovirus y sapovirus, causa gastroenteritis. El rotavirus, sin embargo, es mucho más letal, lo que causa el 37% de las muertes en niños con diarrea y 215,000 muertes en todo el mundo.

Se han

identificado sapovirus en murciélagos, leones marinos de California, perros, cerdos y visones.

• ICTV Informe: Caliciviridae
• Viralzone: Sapovirus