Ortohantavirus Sin Nombre
Sin Nombre orthohantavirus (SNV), miembro de el género Orthohantavirus, es el agente etiológico prototípico del síndrome cardiopulmonar por hantavirus (SHC).
Descubierto en 1993 cerca del Cañón de la Muerte en la Reserva Navajo, originalmente fue llamado hantavirus del Cañón Muerto, de acuerdo con la convención para nombrar nuevos patógenos. Sin embargo, la Nación Navajo se opuso al nombre en 1994. También estaba cerca del punto de las Cuatro Esquinas en los Estados Unidos, por lo que los virólogos intentaron llamarlo "virus de las Cuatro Esquinas". El nombre se cambió después de que los residentes locales presentaran objeciones. Frustrados, los virólogos lo cambiaron a Sin Nombre, que significa "sin nombre" en español.
Historia
Se aisló por primera vez en 1993 de roedores recolectados cerca de la casa de uno de los primeros pacientes con síndrome pulmonar por hantavirus (SPH) en la región de Four Corners en el oeste de Estados Unidos. El aislamiento se logró mediante un paso ciego en Peromyscus maniculatus (ratón venado oriental) y posterior adaptación al crecimiento en células Vero E6. También se han aislado cepas virales adicionales de P. maniculatus asociado con un caso fatal en California y P. leucopus de las proximidades de una probable infección de un caso de Nueva York. El virus del canal Black Creek se aisló de S. hispidus recolectada cerca de la residencia de un caso humano en el condado de Dade, Florida. Otro agente etiológico del HCPS, el virus Bayou, se aisló por primera vez en las cercanías de Monroe, Luisiana.
Epidemiología
El SNV ocurre dondequiera que se encuentre su reservorio roedor portador, el ratón venado Peromyscus maniculatus, que incluye esencialmente toda el área poblada de América del Norte, excepto la región del extremo sureste desde el este de Texas hasta Florida. Alaska y el extremo norte de Canadá. SNV y HCPS son especialmente comunes en los estados occidentales; Se han informado incidencias máximas de HCPS en regiones en las que hay mucho contacto entre humanos y ratones (Nuevo México, Arizona) y en estados con poblaciones rurales excepcionalmente grandes, como California. Todas las provincias occidentales de Canadá también han notificado casos. El SNV se puede contraer mediante la inhalación de excrementos de ratón ciervo contaminados con el virus.
Si bien se entiende que la transmisión del ratón ciervo portador a los humanos ocurre principalmente a través del contacto con la orina y las heces del ratón, se cree que la transmisión dentro de la población de vectores ocurre a través del contacto directo, en contraste con la transmisión por vector entendida para otras especies en el mundo. Género ortohantavirus.
Se informó que la tasa de letalidad del HCPS inducido por SNV en los EE. UU. es aproximadamente del 66,7 % (CDC, 1993). Sin embargo, desde entonces la tasa de letalidad ha disminuido constantemente a medida que se fueron reconociendo más casos leves. En 2007, el CFR había disminuido a alrededor del 35%.
Secuenciación de virus
Al igual que otras especies de Orthohantavirus, SNV tiene un genoma de ARN monocatenario tripartito de sentido negativo. Posteriormente, se determinó la secuencia genómica completa del SNV utilizando ARN extraído de material de autopsia, así como ARN extraído de virus adaptados a cultivos celulares. El ARN L tiene una longitud de 6562 nucleótidos (nt); el ARNm tiene una longitud de 3696 nt; y el ARN S tiene una longitud de 2059 a 2060 nt. Cuando se comparó la secuencia prototipo (NMH15) del SNV detectado en tejidos de un caso de SPH con la secuencia del aislado de SNV (NMR11; aislado en células Vero E6 de Peromyscus maniculatus atrapadas en la residencia del mismo caso), sólo se encontraron 16 cambios de nucleótidos, y ninguno de estos cambios resultó en alteraciones en las secuencias de aminoácidos de las proteínas virales. Se suponía que en el proceso de adaptación al cultivo celular se produciría la selección de variantes del SNV que crecen de manera óptima en el cultivo celular, y que las variantes seleccionadas diferirían genéticamente del virus original. Aunque NMH10 y NMR11 son idénticos en la secuencia de proteínas, las sustituciones de nucleótidos en regiones no traducidas del genoma podrían ser responsables de fenotipos virales alterados, al igual que cambios en la glicosilación de proteínas o los componentes de la membrana del virus.
El ensayo de RT-PCR anidado desarrollado durante el brote inicial de HCPS proporcionó un método rápido para la caracterización genética de nuevos hantavirus que no requerían un aislado del virus. Se han detectado numerosos hantavirus nuevos mediante RT-PCR en tejidos de roedores, pero aún no se han asociado con enfermedades humanas. Estos incluyen el virus El Moro Canyon asociado con el ratón recolector occidental, Reithrodontomys megalotis, el virus Tula con Microtus arvalis y M. rossiaemeridionalis, virus de Río Segundo con el ratón de cosecha mexicano, R. mexicanus, virus de Isla Vista con el topillo de California, M. californicus y virus similares a Prospect Hill en especies Microtus.
Morfología del virión
A diferencia de los miembros del género Orthohantavirus, endémico fuera de América, cuyos viriones son predominantemente redondos o pleomórficos, los viriones SNV tienen una mayor propensión a morfologías de viriones tubulares e irregulares. Este hallazgo sugiere que el género es más diverso en términos de morfología de lo que se suponía anteriormente, lo que puede ayudar a explicar las diferencias en epidemiología entre especies. Dentro de la especie Sin Nombre, existe variabilidad morfológica entre cepas, con viriones de un fenotipo alargado asociados con una mayor virulencia. Los viriones Sin Nombre tienen un diámetro promedio de 90 nm para partículas redondas y 85 nm para partículas tubulares, con una longitud promedio de 180 nm para partículas tubulares, lo que los hace algo más pequeños que los miembros estrechamente relacionados del género.