Halobacterias

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Familia de archaea

Halobacteriaceae es una familia del orden Halobacteriales y del dominio Archaea. Halobacteriaceae representa una gran parte de Archaea halófilas, junto con miembros de otras dos familias metanogénicas, Methanosarcinaceae y Methanocalculaceae. La familia consta de muchos géneros diversos que pueden sobrevivir en nichos ambientales extremos. Lo más común es que las Halobacteriaceae se encuentren en lagos hipersalinos e incluso pueden tolerar sitios contaminados por metales pesados. Incluyen neutrófilos, acidófilos (por ejemplo, Halarchaeum acidiphilum), alcalófilos (por ejemplo, Natronobacterium) e incluso se han descubierto especies psicrotolerantes (por ejemplo, Hrr. lacusprofundi). Se sabe que algunos miembros viven tanto aeróbicamente como anaeróbicamente, y tienen muchas morfologías diferentes. Estas diversas morfologías incluyen bastones en el género Halobacterium, cocos en Halococcus, discos o copas aplanados en Haloferax y otras formas que van desde triángulos aplanados en Haloarcula hasta cuadrados en Haloquadratum y Natronorubrum. La mayoría de las especies de Halobacteriaceae son mejor conocidas por su alta tolerancia a la sal y sus miembros pigmentados de color rojo rosado (debido a los carotenoides de la bacterioruberina), pero también hay especies no pigmentadas y aquellas que requieren condiciones moderadas de sal. Se ha demostrado que algunas especies de Halobacteriaceae exhiben actividades solubilizadoras de fósforo que contribuyen al ciclo del fósforo en ambientes hipersalinos. Técnicas como el análisis de ARNr 16S y la hibridación ADN-ADN han contribuido de manera importante a la clasificación taxonómica de Halobacteriaceae, en parte debido a la dificultad en el cultivo de Archaea halófilas.

Descripción general

Las halobacteriáceas se encuentran en agua saturada o casi saturada de sal. También se les llama halófilos, aunque este nombre también se utiliza para otros organismos que viven en agua salada algo menos concentrada. Son comunes en la mayoría de los ambientes donde hay grandes cantidades de sal, humedad y material orgánico disponibles. Las flores grandes aparecen de color rojizo, debido al pigmento bacteriorrodopsina. Este pigmento se utiliza para absorber la luz, lo que proporciona energía para crear ATP. Las halobacterias también poseen un segundo pigmento, la halorrodopsina, que bombea iones de cloruro en respuesta a los fotones, creando un gradiente de voltaje y ayudando en la producción de energía a partir de la luz. El proceso no está relacionado con otras formas de fotosíntesis que implican transporte de electrones y las halobacterias son incapaces de fijar carbono a partir de dióxido de carbono.

Las halobacterias pueden existir en ambientes salados porque, aunque son aerobias, tienen una forma separada y diferente de crear energía mediante el uso de energía luminosa. Partes de las membranas de las halobacterias son de color violáceo y contienen pigmento retiniano. Esto les permite crear un gradiente de protones a través de la membrana de la célula que puede usarse para crear ATP para su propio uso.

Tienen ciertas adaptaciones para vivir en sus ambientes salados. Por ejemplo, su maquinaria celular está adaptada a altas concentraciones de sal al tener aminoácidos cargados en sus superficies, lo que permite a la célula mantener sus moléculas de agua alrededor de estos componentes. La presión osmótica y estos aminoácidos ayudan a controlar la cantidad de sal dentro de la célula. Sin embargo, debido a estas adaptaciones, si la célula se coloca en un ambiente húmedo y menos salado, es probable que explote inmediatamente debido a la presión osmótica.

Filogenia

La taxonomía actualmente aceptada se basa en la Lista de nombres procarióticos con vigencia en la nomenclatura (LPSN) y el Centro Nacional de Información Biotecnológica (NCBI).

16S rRNA basado en LTP_08_2023 53 proteínas de marcadores GTDB 08-RS214
Halobacteriales
Halobacteriaceae 2 *

Halomarina Inoue et al. 2011 *

Salinirubellus Hou et al. 2018 *

"Halorarius" Sun et al. 2023

Salella Deshmukh " Oren 2023

Halosegnis

Halocatena Verma y otros 2020 *

Haloglomus

Natronomonas Kamekura et al. 1997 *

Halobacteriaceae 3 *

Halosimplex

Halorientalis

Salinibaculum Han & Cui 2020 *

Saliniruso

Halovenus Makhdoumi-Kakhki et al. 2012 *

Halapricum

Halococcoides

Halorhabdus

Haloarculaceae

Halomicrobium zhouii

Halomicrobium mukohataei

Halomicroarcula

Haloarcula [incl. Halosiccatus; parafiletic]

Halobacteriaceae *

Halanaeroarchaeum Sorokin et al. 2016 *

Halodesulfurarchaeum Sorokin et al. 2017 *

Salarchaeum Shimane et al. 2011 *

Halobacterium Elazari-Volcani 1957 *

Halocalculus Minegishi et al. 2015 *

Halarchaeum Minegishi et al. 2010 *

"Haladaptaceae"

Haloruso grupo de especies 2

Halomicrococcus Chen et al 2020 *

Halorussus halophilus

Haladaptatus Savage et al. 2007 *

Haloruso Cui et al. 2010 *

Halostella Song et al. 2016 {QS-9-68-17} *

Halalkalicoccus Xue et al. 2005 Halalkalicoccaceae *

Haloccus {Halococcaceae}

Halobacteriaceae 4 *

Halorubellus Cui et al. 2014 *

Haloarchaeobius Makhdoumi-Kakhki et al. 2012 *

Natronoarchaeum Shimane y otros 2010 Natronoarchaeaceae *

Salinarchaeum Salinarchaeaceae

Natrialbaceae

Salinirubrum Corrrig. Cui ' Qiu 2014 *

Haloferacaceae (incl. Halorubraceae)

Halobacteriales
"Haladaptaceae"

Haloruso *

Haladaptatus *

Halobacteriaceae *

Halanaeroarchaeum *

Halodesulfurarchaeum *

Salarchaeum *

Halocalculus *

Halarchaeum *

Halobacterium *

Salinarchaeum Salinarchaeaceae

Halostella {QS-9-68-17} *

Natronoarchaeum Natronoarchaeaceae *

Natrialbaceae

Haloccus {Halococcaceae}

Haloarculaceae

Halocatena *

Halomarina *

Haloglomus

Halosegnis

Natronomonas*

Halorientalis

Halapricum

Halococcoides

Halorhabdus

Halosimplex

Saliniruso

Salinibaculum *

Halovenus *

Halomicrobium [incl. Halosiccatus]

Halomicroarcula

Haloarcula

Halalkalicoccus Halalkalicoccaceae *

Haloferacaceae (incl. Halorubraceae)

Nota 1: * Halobacteriaceae parafilética
Nota 2: Halobacteriaceae no asignadas

  • "Actinoarchaeum" Tang et al. 2023
  • "Haloalcalophilium" Lizama y otros 2000a
  • "Halorarius" Sun et al. 2023
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