Grupo BGI

BGI Group, anteriormente Beijing Genomics Institute, es una empresa china de genómica con sede en el distrito de Yantian, Shenzhen. La empresa se formó originalmente en 1999 como un centro de investigación genética para participar en el Proyecto Genoma Humano. También secuencia los genomas de otros animales, plantas y microorganismos.

BGI ha pasado de ser un pequeño instituto de investigación, destacado por decodificar el ADN de pandas y plantas de arroz, a una empresa diversificada activa en la clonación de animales, pruebas sanitarias e investigación por contrato. La investigación anterior de BGI fue continuada por el Instituto de Genómica de Beijing de la Academia de Ciencias de China. BGI Research, la división sin fines de lucro del grupo, trabaja con el Instituto de Genómica y opera el Banco Nacional de Genes de China bajo un contrato con el gobierno chino. BGI Genomics, una filial, cotizó en la Bolsa de Valores de Shenzhen en 2017.

En 2021, salieron a la luz detalles sobre múltiples controversias que involucran al Grupo BGI. Estas controversias incluyen la supuesta colaboración con el Ejército Popular de Liberación (EPL) y el uso de datos genéticos de pruebas prenatales. BGI negó que comparta datos genéticos prenatales con el EPL.

Historia

Wang Jian, Yu Jun, Yang Huanming y Liu Siqi crearon BGI, originalmente llamado Beijing Genomics Institute, en septiembre de 1999, en Beijing, China, como un instituto de investigación independiente no gubernamental para participar en el Proyecto Genoma Humano como China. #39;representante. Una vez completado el proyecto, la financiación se agotó, tras lo cual BGI se trasladó a Hangzhou a cambio de financiación del gobierno municipal de Hangzhou. En 2002, BGI secuenció el genoma del arroz, que fue artículo de portada de la revista Science. En 2003, BGI decodificó el genoma del virus del SARS y creó un kit para la detección del virus. En 2003, la Academia de Ciencias de China fundó el Instituto de Genómica de Beijing en cooperación con BGI, con Yang Huanming como su primer director. BGI Hangzhou y la Universidad de Zhejiang también fundaron un nuevo instituto de investigación, el Instituto de Ciencias del Genoma James D. Watson de la Universidad de Zhejiang.

En 2007, BGI se separó de la Academia de Ciencias de China y se trasladó a Shenzhen. Yu Jun dejó BGI en ese momento supuestamente vendiendo su participación a los otros 3 fundadores por una suma nominal. En 2008, BGI publicó el primer genoma humano de un individuo asiático.

En 2010, BGI compró 128 máquinas de secuenciación de genes Illumina HiSeq 2000, respaldadas por 1.500 millones de dólares en "fondos colaborativos" durante los próximos 10 años del prestamista estatal Banco de Desarrollo de China. A finales de año, supuestamente tenían un presupuesto de 30 millones de dólares. En 2010, se estableció BGI Americas con su oficina principal en Cambridge, Massachusetts, EE. UU., y BGI Europe se estableció en Copenhague, Dinamarca. Para 2018, BGI abrió oficinas y laboratorios en Seattle y San José en EE. UU., y Londres en el Reino Unido, y también se fundó BGI Asia Pacífico con oficinas en Hong Kong, Kobe (Japón), Bangkok (Tailandia), Laos, Singapur, Brisbane. (Australia) y muchos otros.

En 2011, BGI informó que empleaba a 4.000 científicos y técnicos y tenía unos ingresos de 192 millones de dólares. BGI realizó la secuenciación del genoma del mortal brote de E. coli O104:H4 en Alemania en 2011 en tres días y lo publicó bajo una licencia abierta. Desde 2012, ha comenzado a comercializar sus servicios, contando con inversiones de China Life Insurance Company, Goldstone Investment del grupo CITIC, Yunfeng Capital de Jack Ma y SoftBank China Capital. Ese año también lanzaron su propia revista científica, GigaScience, en asociación con BioMed Central para publicar artículos de ciencias biológicas con gran cantidad de datos. Posteriormente se formó una nueva asociación entre el departamento de GigaScience Press de BGI y Oxford University Press y, desde 2017, GigaScience se publica conjuntamente con Oxford University Press.

En 2013, BGI compró Complete Genomics de Mountain View, California, un importante proveedor de tecnología de secuenciación de ADN, por 118 millones de dólares, después de obtener la aprobación del Comité de Inversión Extranjera de Estados Unidos. Complete Genomics es una subsidiaria de MGI con sede en EE. UU., MGI era una subsidiaria de BGI antes de que se escindiera y cotizara en la bolsa de valores de Shanghai en 2022.

En 2015, BGI firmó una colaboración con el Hospital Zhongshan' Centro de Medicina Clínica de Precisión en Shanghai, inaugurado en mayo de 2015 con un presupuesto de 100 millones de yenes. Según se informa, están participando como institución de secuenciación en el proyecto de investigación de atención médica de 9.200 millones de dólares de China que durará 15 años. En mayo de 2017, se anunció la formación del Centro de Innovación de la Costa Oeste, ubicado conjuntamente en Seattle y San José, en la primera ubicación planificada para trabajar en medicina de precisión y con colaboraciones con la Universidad de Washington, el Instituto Allen para la Ciencia del Cerebro, el Bill &; Fundación Melinda Gates y la Universidad Estatal de Washington, mientras que el segundo laboratorio ya existe con 100 empleados para desarrollar tecnologías de secuenciación de próxima generación. En mayo de 2018, llegó a un acuerdo con el Hospital Mount Sinai (Toronto), Canadá, para la primera instalación de plataformas BGISEQ en Norteamérica.

BGI Genomics, una filial cotizada del grupo, realizó una oferta pública inicial en julio de 2017 en la Bolsa de Valores de Shenzhen. En 2018, según se informó, Wang Jian pertenecía en un 85,3% a BGI, y el grupo posee el 42,4% de su unidad principal, BGI Genomics.

En 2019, se informó que una filial de BGI, Forensic Genomics International, había creado una base de datos habilitada para WeChat de perfiles genéticos de personas en todo el país. En julio de 2020, se informó que BGI devolvió un préstamo del Programa de Protección de Cheques de Pago luego del escrutinio de los medios.

En 2021, las empresas estatales de State Development and Investment Corporation y China Merchants Group adquirieron participaciones en BGI Genomics.

EE.UU. sanciones

En julio de 2020, la Oficina de Industria y Seguridad del Departamento de Comercio de los Estados Unidos colocó a dos subsidiarias de BGI en su Lista de Entidades por ayudar en presuntos abusos contra los derechos humanos debido a su trabajo de análisis genético en Xinjiang.

En marzo de 2023, el Departamento de Comercio de Estados Unidos añadió a BGI Research y BGI Tech Solutions (Hong Kong) a la Lista de Entidades por acusaciones de vigilancia y represión de minorías étnicas.

Proyectos

COVID-19

En enero de 2020, BGI Genomics anunció su kit de RT-PCR fluorescente en tiempo real que ayuda a identificar el virus SARS-CoV-2 que causa el COVID-19. Posteriormente, esto fue verificado y autorizado para su uso en 14 países y regiones, incluida la lista de uso de emergencia de la Organización Mundial de la Salud. BGI Genomics informó que hasta abril de 2021 los kits de RT-PCR se habían distribuido a más de 180 países y regiones. BGI también desarrolló laboratorios de detección de ácido nucleico de alto rendimiento con nivel de bioseguridad 2, denominados laboratorios Huo-Yan.

En la primera mitad de 2020, BGI Group se ofreció a ayudar al estado de California a establecer laboratorios de pruebas de COVID-19 a un costo. El gobierno de California rechazó la oferta debido a preocupaciones geopolíticas, pero el condado de Santa Clara sí compró kits y equipos de prueba de COVID-19 a BGI.

El 25 de agosto de 2020, Reuters informó que a unas 3700 personas en Suecia se les dijo por error que tenían el coronavirus debido a un fallo en un kit de prueba de COVID-19 de BGI Genomics. A pesar de ser la quinta prueba en recibir la Lista de Uso de Emergencia de la OMS y de obtener las mejores calificaciones en pruebas de sensibilidad en un estudio holandés que valida de forma independiente las pruebas disponibles comercialmente. BGI Genomics defendió el producto, culpando a las diferencias en los umbrales utilizados entre los laboratorios que analizan niveles muy bajos del virus.

Tecnología bioinformática

El presupuesto anual para el centro de cómputo fue de 9 millones de dólares. Ese mismo año, los biólogos computacionales de BGI desarrollaron el primer algoritmo exitoso, basado en la teoría de grafos, para alinear miles de millones de cadenas de 25 a 75 pares de bases producidas por secuenciadores de próxima generación, específicamente el Analizador de Genoma de Illumina. durante la secuenciación de novo.

SOAPdenovo es parte del "Paquete de análisis de oligonucleótidos cortos" (SOAP), un conjunto de herramientas desarrolladas por BGI para el ensamblaje de novo de genomas de tamaño humano, alineación, detección de SNP, resecuenciación, búsqueda de indeles y análisis de variación estructural. Creado para los secuenciadores Illumina' En pocas palabras, SOAPdenovo se ha utilizado para ensamblar múltiples genomas humanos (identificando una inserción de ocho kilobases no detectada mediante el mapeo del genoma humano de referencia) y animales, como el panda gigante.

Hasta 2015, BGI había lanzado BGISEQ-100, basado en el dispositivo Ion Torrent de Thermo Fisher Scientific, y BGISEQ-1000, y ambos recibieron la aprobación de la CFDA para un método NIFTY (Non-Invasive Fetal Prueba de trisomía) prueba prenatal.</ref> En octubre de 2015, BGI lanzó BGISEQ-500, un sistema de secuenciación de escritorio más grande. Según se informa, recibió más de 500 pedidos para el sistema y realizó más de 112.000 pruebas hasta finales de 2016. El Banco Nacional de Genes de China, inaugurado por BGI y el gobierno chino en septiembre de 2016, tiene 150 instrumentos del sistema. El BGISEQ-500 fue desarrollado como una plataforma de secuenciación capaz de competir con las plataformas de Illumina. En noviembre de 2016, BGI lanzó BGISEQ-50, una versión en miniatura del secuenciador de escritorio. En 2017, BGI comenzó a ofrecer WGS por 600 dólares. En septiembre de 2022, MGI lanzó DNBSeq-G99, un nuevo secuenciador de velocidad ultraalta y rendimiento medio a bajo.

En 2021, BGI desarrolló Stereo-seq, su tecnología de transcriptómica espacial de todo el genoma y publicó los primeros resultados de la investigación de un consorcio de usuarios científicos de la tecnología en 2022. En 2022, BGI-Research y la Universidad de la Academia de Ciencias de China se unieron con científicos de todo el mundo, utilizó tecnologías de secuenciación para realizar la secuenciación de células individuales para ampliar la comprensión del desarrollo embrionario humano temprano, para completar el primer atlas de células de todo el cuerpo de un primate no humano, para completar el primer atlas de células de todo el cuerpo del mundo. atlas del transcriptoma unicelular de los cerdos, y estudiar el cerebro de las hormigas para explicar por primera vez cómo la división social del trabajo dentro de las colonias de hormigas está determinada por la especialización funcional de sus cerebros a niveles celulares.

Disputas legales

En 2019, el competidor Illumina, Inc. presentó múltiples demandas por infracción de patentes contra BGI. En respuesta, BGI ha presentado demandas por infracción de patentes contra Illumina alegando violaciones de las leyes federales antimonopolio y de competencia desleal de California. En mayo de 2022, un tribunal estadounidense ordenó a Illumina pagar 333,8 millones de dólares al Grupo BGI después de descubrir que los sistemas de secuenciación de ADN de Illumina infringían dos de las patentes de BGI. El fallo también declaró que Illumina infringió las patentes intencionalmente y que tres patentes que había acusado de infringir a la subsidiaria Complete Genomics de BGI no eran válidas. En julio de 2022, Illumina, MGI Tech Co. y Complete Genomics resolvieron demandas estadounidenses sobre tecnología de secuenciación de ADN, e Illumina acordó pagar 325 millones de dólares para resolver todos los litigios estadounidenses. Como parte del acuerdo, Illumina recibirá una licencia para las patentes de las afiliadas de BGI, y ambas compañías acordaron no demandarse entre sí por violaciones de patentes o antimonopolio en los Estados Unidos durante tres años.

Collaboration with the People 's Liberation Army

En enero de 2021, Reuters informó que BGI había trabajado con el Ejército Popular de Liberación (EPL) e instituciones afiliadas, como la Universidad Nacional de Tecnología de Defensa, en esfuerzos para mejorar la calidad de los soldados. fuerza y otros proyectos. En julio de 2021, Reuters informó que BGI desarrolló una prueba prenatal, con la ayuda del Ejército Popular de Liberación, que también se utiliza para la recopilación de datos genéticos. En una entrevista con el South China Morning Post, un representante de BGI negó el informe de Reuters. El South China Morning Post declaró que BGI publicó artículos con el Hospital General del Ejército Popular de Liberación y la Universidad Médica del Ejército, explicando en el artículo que en China "muchos hospitales de primer nivel están afiliados al ejército." BGI declaró además que "todos los datos NIPT recopilados en el extranjero se almacenan en el laboratorio de BGI en Hong Kong y se destruyen después de cinco años, según lo estipulado por el Reglamento General de Protección de Datos (GDPR)". BGI también declaró que "nunca se le ha pedido a BGI que proporcione, ni ha proporcionado, datos de sus pruebas NIFTY a las autoridades chinas con fines de seguridad nacional o de defensa nacional".

En respuesta al informe de Reuters, un regulador de privacidad alemán lanzó una investigación sobre el uso por parte de una empresa alemana de las pruebas genéticas prenatales de BGI. En agosto de 2021, el Reino Unido anunció un requisito de registro ante la Agencia Reguladora de Medicamentos y Productos Sanitarios para las pruebas prenatales de BGI. Los reguladores de Australia, Estonia, Canadá y Polonia también expresaron su preocupación, al igual que el Centro Nacional de Contrainteligencia y Seguridad de Estados Unidos.

En noviembre de 2021, Reuters informó que un profesor de la Universidad de Copenhague, Guojie Zhang, que también trabajaba en BGI, estaba desarrollando medicamentos para que el EPL ayudara a los soldados a controlar el mal de altura. BGI afirmó que el estudio "no se llevó a cabo con fines militares". El 1 de diciembre de 2021, la Universidad de Copenhague comentó el informe de Reuters.

In October 2022, the United States Department of Defense added BGI Genomics Co, a listed subsidiary, to a list of "Chinese military companies " operating in the U.S.