Fosforilación oxidativa
Fosforilación oxidativa o fosforilación ligada al transporte de electrones u oxidación terminal es la vía metabólica en la que las células utilizan enzimas para oxidar los nutrientes, liberando así energía química para producir trifosfato de adenosina (ATP). En eucariotas, esto tiene lugar dentro de las mitocondrias. Casi todos los organismos aeróbicos llevan a cabo la fosforilación oxidativa. Esta vía es tan generalizada porque libera más energía (proporcionada por oxígeno) que los procesos de fermentación alternativos como la glucólisis anaeróbica.
La energía almacenada en los enlaces químicos de la glucosa es liberada por la célula en el ciclo del ácido cítrico produciendo dióxido de carbono y los donadores energéticos de electrones NADH y FADH. La fosforilación oxidativa utiliza estas moléculas y O 2 para producir ATP, que se utiliza en toda la célula cuando se necesita energía. Durante la fosforilación oxidativa, los electrones se transfieren de los donantes de electrones a una serie de aceptores de electrones en una serie de reacciones redox que terminan en oxígeno, cuya reacción libera la mitad de la energía total.
En eucariotas, estas reacciones redox son catalizadas por una serie de complejos proteicos dentro de la membrana interna de las mitocondrias de la célula, mientras que, en procariotas, estas proteínas están ubicadas en la membrana externa de la célula. Estos conjuntos de proteínas enlazadas se denominan cadena de transporte de electrones. En los eucariotas, están involucrados cinco complejos de proteínas principales, mientras que en los procariotas están presentes muchas enzimas diferentes, que utilizan una variedad de donantes y aceptores de electrones.
La energía transferida por los electrones que fluyen a través de esta cadena de transporte de electrones se usa para transportar protones a través de la membrana mitocondrial interna, en un proceso llamado transporte de electrones. Esto genera energía potencial en forma de un gradiente de pH y un potencial eléctrico a través de esta membrana. Esta reserva de energía se aprovecha cuando los protones fluyen de regreso a través de la membrana y bajan por el gradiente de energía potencial, a través de una gran enzima llamada ATP sintasa en un proceso llamado quimiosmosis. La ATP sintasa utiliza la energía para transformar el difosfato de adenosina (ADP) en trifosfato de adenosina, en una reacción de fosforilación. La reacción es impulsada por el flujo de protones, que fuerza la rotación de una parte de la enzima. La ATP sintasa es un motor mecánico rotatorio.
Aunque la fosforilación oxidativa es una parte vital del metabolismo, produce especies reactivas de oxígeno como el superóxido y el peróxido de hidrógeno, que conducen a la propagación de radicales libres, dañando las células y contribuyendo a la enfermedad y, posiblemente, al envejecimiento y la senescencia. Las enzimas que llevan a cabo esta ruta metabólica también son el objetivo de muchas drogas y venenos que inhiben sus actividades.
Quimiosmosis
La fosforilación oxidativa funciona mediante el uso de reacciones químicas que liberan energía para impulsar reacciones que requieren energía. Se dice que los dos conjuntos de reacciones están acoplados. Esto significa que uno no puede ocurrir sin el otro. La cadena de reacciones redox que impulsa el flujo de electrones a través de la cadena de transporte de electrones, desde los donantes de electrones como el NADH hasta los aceptores de electrones como el oxígeno y el hidrógeno (protones), es un proceso exergónico: libera energía, mientras que la síntesis de ATP es un proceso exergónico. proceso endergónico, que requiere un aporte de energía. Tanto la cadena de transporte de electrones como la ATP sintasa están incrustadas en una membrana, y la energía se transfiere desde la cadena de transporte de electrones a la ATP sintasa mediante movimientos de protones a través de esta membrana, en un proceso llamado quimiosmosis. Una corriente de protones es impulsada desde el lado N negativo de la membrana al lado P positivo a través de las enzimas de bombeo de protones de la cadena de transporte de electrones. El movimiento de protones crea un gradiente electroquímico a través de la membrana, que se denomina fuerza motriz de protones. Tiene dos componentes: una diferencia en la concentración de protones (un gradiente de H, ΔpH) y una diferencia en el potencial eléctrico, con el lado N con carga negativa.
La ATP sintasa libera esta energía almacenada completando el circuito y permitiendo que los protones fluyan por el gradiente electroquímico, de regreso al lado N de la membrana. El gradiente electroquímico impulsa la rotación de parte de la estructura de la enzima y acopla este movimiento a la síntesis de ATP.
Los dos componentes de la fuerza motriz del protón son termodinámicamente equivalentes: en las mitocondrias, la mayor parte de la energía la proporciona el potencial; en las bacterias alcalófilas, la energía eléctrica incluso tiene que compensar una diferencia de pH inversa contrarrestante. Inversamente, los cloroplastos operan principalmente en ΔpH. Sin embargo, también requieren un pequeño potencial de membrana para la cinética de la síntesis de ATP. En el caso de la fusobacterium Propionigenium modestum, impulsa la contrarrotación de las subunidades ayc del motor F O de la ATP sintasa.
La cantidad de energía liberada por la fosforilación oxidativa es alta, en comparación con la cantidad producida por la fermentación anaeróbica, debido a la alta energía del O 2. La glucólisis produce solo 2 moléculas de ATP, pero entre 30 y 36 ATP son producidos por la fosforilación oxidativa de las 10 moléculas de NADH y 2 de succinato hechas al convertir una molécula de glucosa en dióxido de carbono y agua, mientras que cada ciclo de oxidación beta de una grasa El ácido produce alrededor de 14 ATP. Estos rendimientos de ATP son valores máximos teóricos; en la práctica, algunos protones se filtran a través de la membrana, lo que reduce la producción de ATP.
Moléculas de transferencia de electrones y protones.
La cadena de transporte de electrones transporta tanto protones como electrones, pasando electrones de donantes a aceptores y transportando protones a través de una membrana. Estos procesos utilizan moléculas de transferencia tanto solubles como unidas a proteínas. En las mitocondrias, los electrones son transferidos dentro del espacio intermembrana por la proteína de transferencia de electrones soluble en agua citocromo c. Este transporta solo electrones, y estos son transferidos por la reducción y oxidación de un átomo de hierro que la proteína mantiene dentro de un grupo hemo en su estructura. El citocromo c también se encuentra en algunas bacterias, donde se encuentra dentro del espacio periplásmico.
Dentro de la membrana mitocondrial interna, la coenzima Q10 (Q) portadora de electrones soluble en lípidos transporta tanto electrones como protones mediante un ciclo redox. Esta pequeña molécula de benzoquinona es muy hidrófoba, por lo que se difunde libremente dentro de la membrana. Cuando Q acepta dos electrones y dos protones, se reduce a la forma de ubiquinol (QH 2); cuando QH 2 libera dos electrones y dos protones, se vuelve a oxidar a la forma de ubiquinona (Q). Como resultado, si dos enzimas se organizan de modo que Q se reduzca en un lado de la membrana y QH 2 se oxide en el otro, la ubiquinona acoplará estas reacciones y transportará protones a través de la membrana.Algunas cadenas bacterianas de transporte de electrones utilizan diferentes quinonas, como la menaquinona, además de la ubiquinona.
Dentro de las proteínas, los electrones se transfieren entre los cofactores de flavina, los grupos de hierro y azufre y los citocromos. Hay varios tipos de cúmulos de hierro y azufre. El tipo más simple que se encuentra en la cadena de transferencia de electrones consta de dos átomos de hierro unidos por dos átomos de azufre inorgánico; estos se denominan grupos [2Fe–2S]. El segundo tipo, llamado [4Fe–4S], contiene un cubo de cuatro átomos de hierro y cuatro átomos de azufre. Cada átomo de hierro en estos grupos está coordinado por un aminoácido adicional, generalmente por el átomo de azufre de la cisteína. Los cofactores de iones metálicos experimentan reacciones redox sin unirse o liberar protones, por lo que en la cadena de transporte de electrones sirven únicamente para transportar electrones a través de proteínas. Los electrones se mueven distancias bastante largas a través de las proteínas saltando a lo largo de las cadenas de estos cofactores.Esto ocurre por túnel cuántico, que es rápido en distancias de menos de 1,4 × 10 m.
Cadenas de transporte de electrones eucariotas
Muchos procesos bioquímicos catabólicos, como la glucólisis, el ciclo del ácido cítrico y la oxidación beta, producen la coenzima NADH reducida. Esta coenzima contiene electrones que tienen un alto potencial de transferencia; en otras palabras, liberarán una gran cantidad de energía al oxidarse. Sin embargo, la célula no libera toda esta energía de golpe, ya que sería una reacción incontrolable. En cambio, los electrones se eliminan del NADH y pasan al oxígeno a través de una serie de enzimas, cada una de las cuales libera una pequeña cantidad de energía. Este conjunto de enzimas, que consta de complejos I a IV, se denomina cadena de transporte de electrones y se encuentra en la membrana interna de la mitocondria. El succinato también es oxidado por la cadena de transporte de electrones, pero ingresa a la ruta en un punto diferente.
En los eucariotas, las enzimas de este sistema de transporte de electrones utilizan la energía liberada del O 2 por el NADH para bombear protones a través de la membrana interna de la mitocondria. Esto hace que se acumulen protones en el espacio intermembrana y genera un gradiente electroquímico a través de la membrana. La energía almacenada en este potencial es luego utilizada por la ATP sintasa para producir ATP. La fosforilación oxidativa en la mitocondria eucariota es el ejemplo mejor entendido de este proceso. La mitocondria está presente en casi todos los eucariotas, con la excepción de los protozoos anaerobios como Trichomonas vaginalis que, en cambio, reducen los protones a hidrógeno en una mitocondria remanente llamada hidrogenosoma.
| Enzima respiratoria | par redox | Potencial de punto medio (Voltios) |
|---|---|---|
| NADH deshidrogenasa | NAD/NADH | −0,32 |
| succinato deshidrogenasa | FMN o FAD / FMNH 2 o FADH 2 | −0,20 |
| Complejo citocromo bc 1 | Coenzima Q10 buey / Coenzima Q10 roja | +0.06 |
| Complejo citocromo bc 1 | caja de citocromo / caja de citocromo | +0.12 |
| Complejo IV | Citocromo c ox / Citocromo c rojo | +0.22 |
| Complejo IV | Citocromo a buey / Citocromo a rojo | +0.29 |
| Complejo IV | O 2 / H O | +0.82 |
| Condiciones: pH = 7 |
NADH-coenzima Q oxidorreductasa (complejo I)
La NADH-coenzima Q oxidorreductasa, también conocida como NADH deshidrogenasa o complejo I, es la primera proteína en la cadena de transporte de electrones. El complejo I es una enzima gigante con el complejo I de mamíferos que tiene 46 subunidades y una masa molecular de alrededor de 1000 kilodaltons (kDa). La estructura se conoce en detalle solo a partir de una bacteria; en la mayoría de los organismos, el complejo se asemeja a una bota con una gran "bola" que sobresale de la membrana hacia la mitocondria. Los genes que codifican las proteínas individuales están contenidos tanto en el núcleo celular como en el genoma mitocondrial, como es el caso de muchas enzimas presentes en la mitocondria.
La reacción catalizada por esta enzima es la oxidación de dos electrones del NADH por la coenzima Q10 o ubiquinona (representada como Q en la siguiente ecuación), una quinona soluble en lípidos que se encuentra en la membrana de la mitocondria:
{displaystyle {ce {NADH + Q + 5H+_{matriz}-> NAD+ + QH2 + 4H+_{intermembrana}}}} NAD+ + QH2 + 4H+_{intermembrana}}}}"> | (1) |
El comienzo de la reacción, y de hecho de toda la cadena de electrones, es la unión de una molécula de NADH al complejo I y la donación de dos electrones. Los electrones ingresan al complejo I a través de un grupo prostético unido al complejo, mononucleótido de flavina (FMN). La adición de electrones a FMN lo convierte en su forma reducida, FMNH 2. Luego, los electrones se transfieren a través de una serie de grupos de hierro y azufre: el segundo tipo de grupo protésico presente en el complejo. Hay grupos de hierro y azufre tanto [2Fe–2S] como [4Fe–4S] en el complejo I.
A medida que los electrones pasan a través de este complejo, se bombean cuatro protones desde la matriz hacia el espacio intermembrana. No está claro exactamente cómo ocurre esto, pero parece implicar cambios conformacionales en el complejo I que hacen que la proteína se una a los protones en el lado N de la membrana y los libere en el lado P de la membrana. Finalmente, los electrones se transfieren de la cadena de grupos de hierro y azufre a una molécula de ubiquinona en la membrana. La reducción de ubiquinona también contribuye a la generación de un gradiente de protones, ya que se toman dos protones de la matriz cuando se reduce a ubiquinol (QH 2).
Succinato-Q oxidorreductasa (complejo II)
La succinato-Q oxidorreductasa, también conocida como complejo II o succinato deshidrogenasa, es un segundo punto de entrada a la cadena de transporte de electrones. Es inusual porque es la única enzima que forma parte tanto del ciclo del ácido cítrico como de la cadena de transporte de electrones. El complejo II consta de cuatro subunidades de proteínas y contiene un cofactor de dinucleótido de flavina y adenina (FAD) unido, grupos de hierro y azufre y un grupo hemo que no participa en la transferencia de electrones a la coenzima Q, pero se cree que es importante en la disminución de la producción de reactivos. especies de oxígeno.Oxida el succinato a fumarato y reduce la ubiquinona. Como esta reacción libera menos energía que la oxidación de NADH, el complejo II no transporta protones a través de la membrana y no contribuye al gradiente de protones.
{displaystyle {ce {{Succinato}+ Q -> {Fumarato}+ QH2}}} {Fumarato}+ QH2}}}"> | (2) |
En algunos eucariotas, como el gusano parásito Ascaris suum, una enzima similar al complejo II, la fumarato reductasa (menaquinol:fumarato oxidorreductasa o QFR), opera a la inversa para oxidar el ubiquinol y reducir el fumarato. Esto permite que el gusano sobreviva en el ambiente anaeróbico del intestino grueso, llevando a cabo la fosforilación oxidativa anaeróbica con fumarato como aceptor de electrones. Otra función no convencional del complejo II se observa en el parásito de la malaria Plasmodium falciparum. Aquí, la acción inversa del complejo II como oxidasa es importante en la regeneración del ubiquinol, que el parásito usa en una forma inusual de biosíntesis de pirimidina.
Transferencia de electrones flavoproteína-Q oxidorreductasa
La flavoproteína-ubiquinona oxidorreductasa de transferencia de electrones (ETF-Q oxidorreductasa), también conocida como deshidrogenasa de flavoproteína de transferencia de electrones, es un tercer punto de entrada a la cadena de transporte de electrones. Es una enzima que acepta electrones de la flavoproteína de transferencia de electrones en la matriz mitocondrial y utiliza estos electrones para reducir la ubiquinona. Esta enzima contiene una flavina y un grupo de [4Fe–4S], pero, a diferencia de otros complejos respiratorios, se adhiere a la superficie de la membrana y no atraviesa la bicapa lipídica.
{displaystyle {ce {ETF_{red}{}+ Q -> ETF_{ox}{}+ QH2}}} ETF_{ox}{}+ QH2}}}"> | (3) |
En los mamíferos, esta vía metabólica es importante en la oxidación beta de los ácidos grasos y el catabolismo de los aminoácidos y la colina, ya que acepta electrones de múltiples acetil-CoA deshidrogenasas. En las plantas, la ETF-Q oxidorreductasa también es importante en las respuestas metabólicas que permiten la supervivencia en períodos prolongados de oscuridad.
Q-citocromo c oxidorreductasa (complejo III)
La Q-citocromo c oxidorreductasa también se conoce como citocromo c reductasa, complejo citocromo bc 1 o simplemente complejo III. En los mamíferos, esta enzima es un dímero, con cada complejo de subunidades que contiene 11 subunidades de proteínas, un grupo de hierro-azufre [2Fe-2S] y tres citocromos: un citocromo c 1 y dos citocromos b. Un citocromo es un tipo de proteína de transferencia de electrones que contiene al menos un grupo hemo. Los átomos de hierro dentro de los grupos hemo del complejo III alternan entre un estado ferroso reducido (+2) y férrico oxidado (+3) a medida que los electrones se transfieren a través de la proteína.
La reacción catalizada por el complejo III es la oxidación de una molécula de ubiquinol y la reducción de dos moléculas de citocromo c, una proteína hemo débilmente asociada con la mitocondria. A diferencia de la coenzima Q, que transporta dos electrones, el citocromo c transporta solo un electrón.
{displaystyle {ce {QH2{}+ 2 Cyt, c_{ox}{}+ 2H+_{matriz}-> Q{}+ 2 Cyt, c_{red}{}+ 4H+_{intermembrana }}}} Q{}+ 2 Cyt, c_{red}{}+ 4H+_{intermembrana }}}}"> | (4) |
Como solo uno de los electrones puede transferirse del donante QH 2 al aceptor del citocromo c a la vez, el mecanismo de reacción del complejo III es más elaborado que el de los otros complejos respiratorios y ocurre en dos pasos llamados ciclo Q. En el primer paso, la enzima se une a tres sustratos, primero, QH 2, que luego se oxida y pasa un electrón al segundo sustrato, el citocromo c. Los dos protones liberados por QH 2 pasan al espacio intermembrana. El tercer sustrato es Q, que acepta el segundo electrón del QH 2 y se reduce a Q, que es el radical libre ubisemiquinona. Los dos primeros sustratos se liberan, pero este intermedio de ubisemiquinona permanece unido. En el segundo paso, se une una segunda molécula de QH 2 y nuevamente pasa su primer electrón a un aceptor de citocromo c. El segundo electrón pasa a la ubisemiquinona unida, reduciéndola a QH 2 a medida que gana dos protones de la matriz mitocondrial. Este QH 2 luego se libera de la enzima.
A medida que la coenzima Q se reduce a ubiquinol en el lado interno de la membrana y se oxida a ubiquinona en el otro lado, se produce una transferencia neta de protones a través de la membrana, lo que se suma al gradiente de protones. El mecanismo bastante complejo de dos pasos por el que esto ocurre es importante, ya que aumenta la eficiencia de la transferencia de protones. Si, en lugar del ciclo Q, se usara una molécula de QH 2 para reducir directamente dos moléculas de citocromo c, la eficiencia se reduciría a la mitad, con solo un protón transferido por citocromo c reducido.
Citocromo c oxidasa (complejo IV)
La citocromo c oxidasa, también conocida como complejo IV, es el complejo proteico final en la cadena de transporte de electrones. La enzima de los mamíferos tiene una estructura extremadamente complicada y contiene 13 subunidades, dos grupos hemo, así como múltiples cofactores de iones metálicos: en total, tres átomos de cobre, uno de magnesio y uno de zinc.
Esta enzima media la reacción final en la cadena de transporte de electrones y transfiere electrones a oxígeno e hidrógeno (protones), mientras bombea protones a través de la membrana. El oxígeno aceptor final de electrones, que proporciona la mayor parte de la energía liberada en la cadena de transferencia de electrones y también se denomina aceptor terminal de electrones, se reduce a agua en este paso, que libera la mitad de toda la energía en la respiración aeróbica. Tanto el bombeo directo de protones como el consumo de protones de la matriz en la reducción de oxígeno contribuyen al gradiente de protones. La reacción catalizada es la oxidación del citocromo c y la reducción del oxígeno:
{displaystyle {ce {4Cyt,c_{red}{}+O2{}+8H+_{matriz}->4Cyt,c_{ox}{}+2H2O{}+4H+_{intermembrana}} }} 4Cyt,c_{ox}{}+2H2O{}+4H+_{intermembrana}} }}"> | (5) |
Reductasas y oxidasas alternativas
Muchos organismos eucarióticos tienen cadenas de transporte de electrones que difieren de las enzimas de mamíferos que se han estudiado mucho y que se describen anteriormente. Por ejemplo, las plantas tienen NADH oxidasas alternativas, que oxidan el NADH en el citosol en lugar de en la matriz mitocondrial y pasan estos electrones al conjunto de ubiquinonas. Estas enzimas no transportan protones y, por lo tanto, reducen la ubiquinona sin alterar el gradiente electroquímico a través de la membrana interna.
Otro ejemplo de una cadena de transporte de electrones divergente es la oxidasa alternativa, que se encuentra en las plantas, así como en algunos hongos, protistas y posiblemente en algunos animales. Esta enzima transfiere electrones directamente del ubiquinol al oxígeno.
Las rutas de transporte de electrones producidas por estas oxidasas de NADH y ubiquinona alternativas tienen rendimientos de ATP más bajos que la ruta completa. Las ventajas que produce una vía más corta no están del todo claras. Sin embargo, la oxidasa alternativa se produce en respuesta a estrés como el frío, las especies reactivas de oxígeno y la infección por patógenos, así como otros factores que inhiben la cadena completa de transporte de electrones. Por lo tanto, las vías alternativas podrían mejorar la resistencia de los organismos a las lesiones al reducir el estrés oxidativo.
Organización de complejos
El modelo original de cómo se organizan los complejos de la cadena respiratoria era que se difundían libre e independientemente en la membrana mitocondrial. Sin embargo, datos recientes sugieren que los complejos podrían formar estructuras de orden superior llamadas supercomplejos o "respirasomas". En este modelo, los diversos complejos existen como conjuntos organizados de enzimas que interactúan. Estas asociaciones podrían permitir la canalización de sustratos entre los diversos complejos enzimáticos, aumentando la velocidad y la eficiencia de la transferencia de electrones. Dentro de dichos supercomplejos de mamíferos, algunos componentes estarían presentes en cantidades más altas que otros, y algunos datos sugieren una relación entre los complejos I/II/III/IV y la ATP sintasa de aproximadamente 1:1:3:7:4.Sin embargo, el debate sobre esta hipótesis supercompleja no está completamente resuelto, ya que algunos datos no parecen encajar con este modelo.
Cadenas de transporte de electrones procariotas
En contraste con la similitud general en estructura y función de las cadenas de transporte de electrones en eucariotas, las bacterias y las arqueas poseen una gran variedad de enzimas de transferencia de electrones. Estos utilizan un conjunto igualmente amplio de productos químicos como sustratos. Al igual que los eucariotas, el transporte de electrones procariótico utiliza la energía liberada por la oxidación de un sustrato para bombear iones a través de una membrana y generar un gradiente electroquímico. En las bacterias, la fosforilación oxidativa en Escherichia coli se comprende con mayor detalle, mientras que los sistemas de arqueas se conocen poco en la actualidad.
La principal diferencia entre la fosforilación oxidativa de eucariotas y procariotas es que las bacterias y las arqueas utilizan muchas sustancias diferentes para donar o aceptar electrones. Esto permite que los procariotas crezcan en una amplia variedad de condiciones ambientales. En E. coli, por ejemplo, la fosforilación oxidativa puede ser impulsada por un gran número de pares de agentes reductores y agentes oxidantes, que se enumeran a continuación. El potencial de punto medio de una sustancia química mide la cantidad de energía que se libera cuando se oxida o se reduce, teniendo los agentes reductores potenciales negativos y los agentes oxidantes potenciales positivos.
| Enzima respiratoria | par redox | Potencial de punto medio (Voltios) |
|---|---|---|
| Formiato deshidrogenasa | Bicarbonato / Formiato | −0,43 |
| Hidrogenasa | Protón / Hidrógeno | −0,42 |
| NADH deshidrogenasa | NAD/NADH | −0,32 |
| Glicerol-3-fosfato deshidrogenasa | DHAP / Gly-3-P | −0,19 |
| piruvato oxidasa | Acetato + Dióxido de carbono / Piruvato | ? |
| Lactato deshidrogenasa | Piruvato / Lactato | −0,19 |
| D -aminoácido deshidrogenasa | 2-oxoácido + amoníaco / D -aminoácido | ? |
| Glucosa deshidrogenasa | Gluconato / Glucosa | −0,14 |
| succinato deshidrogenasa | Fumarato / Succinato | +0.03 |
| Ubiquinol oxidasa | Oxígeno / Agua | +0.82 |
| Nitrato reductasa | Nitrato / Nitrito | +0.42 |
| Nitrito reductasa | Nitrito / Amoníaco | +0.36 |
| Dimetilsulfóxido reductasa | DMSO/DMS | +0.16 |
| Trimetilamina N -óxido reductasa | OTMA/TMA | +0.13 |
| fumarato reductasa | Fumarato / Succinato | +0.03 |
Como se muestra arriba, E. coli puede crecer con agentes reductores como formiato, hidrógeno o lactato como donantes de electrones y nitrato, DMSO u oxígeno como aceptores. Cuanto mayor sea la diferencia en el potencial de punto medio entre un agente oxidante y reductor, más energía se libera cuando reaccionan. De estos compuestos, el par succinato/fumarato es inusual, ya que su potencial de punto medio es cercano a cero. Por lo tanto, el succinato se puede oxidar a fumarato si se dispone de un agente oxidante fuerte como el oxígeno, o el fumarato se puede reducir a succinato usando un agente reductor fuerte como el formiato. Estas reacciones alternativas son catalizadas por succinato deshidrogenasa y fumarato reductasa, respectivamente.
Algunos procariotas usan pares redox que tienen solo una pequeña diferencia en el potencial de punto medio. Por ejemplo, las bacterias nitrificantes como Nitrobacter oxidan el nitrito a nitrato, donando los electrones al oxígeno. La pequeña cantidad de energía liberada en esta reacción es suficiente para bombear protones y generar ATP, pero no lo suficiente para producir directamente NADH o NADPH para su uso en el anabolismo. Este problema se resuelve mediante el uso de una nitrito oxidorreductasa para producir suficiente fuerza motriz de protones para ejecutar parte de la cadena de transporte de electrones en sentido inverso, lo que hace que el complejo I genere NADH.
Los procariotas controlan el uso que hacen de estos donantes y aceptores de electrones variando las enzimas que se producen, en respuesta a las condiciones ambientales. Esta flexibilidad es posible porque diferentes oxidasas y reductasas usan el mismo grupo de ubiquinona. Esto permite que muchas combinaciones de enzimas funcionen juntas, unidas por el intermediario común ubiquinol. Por lo tanto, estas cadenas respiratorias tienen un diseño modular, con conjuntos de sistemas enzimáticos fácilmente intercambiables.
Además de esta diversidad metabólica, los procariotas también poseen una variedad de isoenzimas, diferentes enzimas que catalizan la misma reacción. Por ejemplo, en E. coli, hay dos tipos diferentes de ubiquinol oxidasa que utilizan oxígeno como aceptor de electrones. En condiciones altamente aeróbicas, la célula utiliza una oxidasa con poca afinidad por el oxígeno que puede transportar dos protones por electrón. Sin embargo, si los niveles de oxígeno caen, cambian a una oxidasa que transfiere solo un protón por electrón, pero tiene una gran afinidad por el oxígeno.
ATP sintasa (complejo V)
La ATP sintasa, también llamada complejo V, es la enzima final en la ruta de fosforilación oxidativa. Esta enzima se encuentra en todas las formas de vida y funciona de la misma manera tanto en procariotas como en eucariotas. La enzima utiliza la energía almacenada en un gradiente de protones a través de una membrana para impulsar la síntesis de ATP a partir de ADP y fosfato (P i). Las estimaciones de la cantidad de protones necesarios para sintetizar un ATP han oscilado entre tres y cuatro, y algunas células sugieren que esta proporción puede variar para adaptarse a diferentes condiciones.
| {displaystyle {ce {ADP + P_i + 4H+_{intermembrana}<=> ATP + H2O + 4H+_{matriz}}}}<img src="https://wikimedia.org/api/rest_v1/media/math/render/svg/6e00c484092294e00a44c19935d545d871565b0d" alt="{displaystyle {ce {ADP + P_i + 4H+_{intermembrana} ATP + H2O + 4H+_{matriz}}}}"> | (6) |
Esta reacción de fosforilación es un equilibrio, que puede cambiarse alterando la fuerza motriz del protón. En ausencia de una fuerza motriz de protones, la reacción de ATP sintasa se desarrollará de derecha a izquierda, hidrolizando ATP y bombeando protones fuera de la matriz a través de la membrana. Sin embargo, cuando la fuerza motriz del protón es alta, la reacción se ve obligada a desarrollarse en la dirección opuesta; procede de izquierda a derecha, permitiendo que los protones fluyan a favor de su gradiente de concentración y convirtiendo el ADP en ATP. De hecho, en las H+-ATPasas de tipo vacuolar estrechamente relacionadas, la reacción de hidrólisis se utiliza para acidificar los compartimentos celulares, bombeando protones e hidrolizando ATP.
La ATP sintasa es un complejo proteico masivo con forma de hongo. El complejo enzimático de los mamíferos contiene 16 subunidades y tiene una masa de aproximadamente 600 kilodaltons. La porción incrustada dentro de la membrana se llama F O y contiene un anillo de subunidades c y el canal de protones. El tallo y la cabeza en forma de bola se llama F 1 y es el sitio de síntesis de ATP. El complejo en forma de bola al final de la porción F 1 contiene seis proteínas de dos tipos diferentes (tres subunidades α y tres subunidades β), mientras que el "tallo" consta de una proteína: la subunidad γ, con la punta del tallo extendiéndose hacia la bola de las subunidades α y β.Las subunidades α y β se unen a nucleótidos, pero solo las subunidades β catalizan la reacción de síntesis de ATP. A lo largo del lado de la porción F 1 y de regreso a la membrana hay una subunidad similar a una barra larga que ancla las subunidades α y β en la base de la enzima.
A medida que los protones cruzan la membrana a través del canal en la base de la ATP sintasa, el motor impulsado por protones F O gira. La rotación puede ser causada por cambios en la ionización de los aminoácidos en el anillo de las subunidades c que causan interacciones electrostáticas que impulsan el anillo de las subunidades c más allá del canal de protones. Este anillo giratorio, a su vez, impulsa la rotación del eje central (el tallo de la subunidad γ) dentro de las subunidades α y β. El brazo lateral, que actúa como un estator, impide que las subunidades α y β giren por sí mismas. Este movimiento de la punta de la subunidad γ dentro de la bola de las subunidades α y β proporciona la energía para que los sitios activos de las subunidades β experimenten un ciclo de movimientos que produce y luego libera ATP.
Esta reacción de síntesis de ATP se denomina mecanismo de cambio de unión e involucra el sitio activo de una subunidad β que cicla entre tres estados. En el estado "abierto", el ADP y el fosfato ingresan al sitio activo (que se muestra en marrón en el diagrama). Luego, la proteína se cierra alrededor de las moléculas y las une sin apretar: el estado "suelto" (que se muestra en rojo). Luego, la enzima cambia de forma nuevamente y fuerza a estas moléculas a unirse, con el sitio activo en el estado "apretado" resultante (que se muestra en rosa) uniéndose a la molécula de ATP recién producida con una afinidad muy alta. Finalmente, el sitio activo regresa al estado abierto, libera ATP y une más ADP y fosfato, listo para el siguiente ciclo.
En algunas bacterias y arqueas, la síntesis de ATP está impulsada por el movimiento de iones de sodio a través de la membrana celular, en lugar del movimiento de protones. Las arqueas como Methanococcus también contienen la A 1 A o sintasa, una forma de la enzima que contiene proteínas adicionales con poca similitud en secuencia con otras subunidades de ATP sintasa bacterianas y eucarióticas. Es posible que, en algunas especies, la forma A 1 A o de la enzima sea una ATP sintasa especializada impulsada por sodio, pero esto podría no ser cierto en todos los casos.
Fosforilación oxidativa - energética
La energía liberada en la fosforilación oxidativa se puede atribuir principalmente al O 2 con su doble enlace relativamente débil. El transporte de electrones del par redox NAD / NADH al par redox final 1/2 O 2 / H 2 O puede resumirse como
1/2 O 2 + NADH + H → H 2 O + NAD
La diferencia de potencial entre estos dos pares redox es de 1,14 voltios, lo que equivale a -52 kcal/mol o -2600 kJ por 6 mol de O 2.
Cuando un NADH se oxida a través de la cadena de transferencia de electrones, se producen tres ATP, lo que equivale a 7,3 kcal/mol x 3 = 21,9 kcal/mol.
La conservación de la energía se puede calcular mediante la siguiente fórmula
Eficiencia = (21,9 x 100%) / 52 = 42%
Entonces podemos concluir que cuando se oxida el NADH, alrededor del 42 % de la energía se conserva en forma de tres ATP y la energía restante (58 %) se pierde en forma de calor (a menos que se haya subestimado la energía química del ATP en condiciones fisiológicas).
Especies de oxígeno reactivas
El oxígeno molecular es un aceptor de electrones terminal ideal porque es un agente oxidante fuerte. La reducción de oxígeno involucra intermediarios potencialmente dañinos. Aunque la transferencia de cuatro electrones y cuatro protones reduce el oxígeno al agua, que es inofensivo, la transferencia de uno o dos electrones produce aniones superóxido o peróxido, que son peligrosamente reactivos.
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Estas especies reactivas de oxígeno y sus productos de reacción, como el radical hidroxilo, son muy perjudiciales para las células, ya que oxidan las proteínas y provocan mutaciones en el ADN. Este daño celular podría contribuir a la enfermedad y se propone como una de las causas del envejecimiento.
El complejo de citocromo c oxidasa es muy eficaz para reducir el oxígeno a agua y libera muy pocos intermediarios parcialmente reducidos; sin embargo, la cadena de transporte de electrones produce pequeñas cantidades de anión superóxido y peróxido. Particularmente importante es la reducción de la coenzima Q en el complejo III, ya que se forma un radical libre de ubisemiquinona altamente reactivo como intermediario en el ciclo Q. Esta especie inestable puede provocar una "fuga" de electrones cuando los electrones se transfieren directamente al oxígeno, formando superóxido. Como la producción de especies reactivas de oxígeno por parte de estos complejos de bombeo de protones es mayor a potenciales de membrana altos, se ha propuesto que las mitocondrias regulan su actividad para mantener el potencial de membrana dentro de un rango estrecho que equilibra la producción de ATP con la generación de oxidantes.Por ejemplo, los oxidantes pueden activar proteínas desacopladoras que reducen el potencial de membrana.
Para contrarrestar estas especies reactivas de oxígeno, las células contienen numerosos sistemas antioxidantes, incluidas vitaminas antioxidantes como la vitamina C y la vitamina E, y enzimas antioxidantes como la superóxido dismutasa, la catalasa y las peroxidasas, que desintoxican las especies reactivas y limitan el daño a la célula.
Fosforilación oxidativa en condiciones hipóxicas.
Como el oxígeno es fundamental para la fosforilación oxidativa, es probable que una escasez en el nivel de O 2 altere las tasas de producción de ATP. Sin embargo, la fuerza motriz de protones y la producción de ATP pueden mantenerse mediante acidosis intracelular. Los protones citosólicos que se han acumulado con la hidrólisis de ATP y la acidosis láctica pueden difundirse libremente a través de la membrana externa mitocondrial y acidificar el espacio entre membranas, contribuyendo así directamente a la fuerza motriz del protón y la producción de ATP.
Inhibidores
Existen varios fármacos y toxinas bien conocidos que inhiben la fosforilación oxidativa. Aunque cualquiera de estas toxinas inhibe solo una enzima en la cadena de transporte de electrones, la inhibición de cualquier paso en este proceso detendrá el resto del proceso. Por ejemplo, si la oligomicina inhibe la ATP sintasa, los protones no pueden regresar a la mitocondria. Como resultado, las bombas de protones no pueden funcionar, ya que el gradiente se vuelve demasiado fuerte para que lo superen. Entonces, el NADH ya no se oxida y el ciclo del ácido cítrico deja de funcionar porque la concentración de NAD cae por debajo de la concentración que estas enzimas pueden usar.
Muchos inhibidores específicos de sitio de la cadena de transporte de electrones han contribuido al conocimiento actual de la respiración mitocondrial. La síntesis de ATP también depende de la cadena de transporte de electrones, por lo que todos los inhibidores específicos de sitio también inhiben la formación de ATP. Los peces envenenan a la rotenona, el barbitúrico amytal y el antibiótico piericidina A inhiben el NADH y la coenzima Q.
El monóxido de carbono, el cianuro, el sulfuro de hidrógeno y la azida inhiben eficazmente la citocromo oxidasa. El monóxido de carbono reacciona con la forma reducida del citocromo mientras que el cianuro y la azida reaccionan con la forma oxidada. Un antibiótico, la antimicina A y la antilewisita británica, un antídoto utilizado contra las armas químicas, son los dos inhibidores importantes del sitio entre el citocromo B y el C1.
| Compuestos | Usar | Sitio de acción | Efecto sobre la fosforilación oxidativa |
|---|---|---|---|
| CianuroMonóxido de carbonoAzidaSulfuro de hidrógeno | venenos | Complejo IV | Inhibe la cadena de transporte de electrones uniéndose con más fuerza que el oxígeno al centro Fe-Cu en la citocromo c oxidasa, evitando la reducción de oxígeno. |
| Oligomicina | Antibiótico | Complejo V | Inhibe la ATP sintasa al bloquear el flujo de protones a través de la subunidad F o. |
| CCCP2,4-dinitrofenol | Venenos, pérdida de peso. | Membrana interna | Ionóforos que interrumpen el gradiente de protones transportando protones a través de una membrana. Este ionóforo desacopla el bombeo de protones de la síntesis de ATP porque transporta protones a través de la membrana mitocondrial interna. |
| rotenona | Pesticida | Complejo I | Previene la transferencia de electrones del complejo I a la ubiquinona al bloquear el sitio de unión de la ubiquinona. |
| Malonato y oxaloacetato | venenos | Complejo II | Inhibidores competitivos de la succinato deshidrogenasa (complejo II). |
| Antimicina A | piscicida | Complejo III | Se une al sitio Qi de la citocromo c reductasa, inhibiendo así la oxidación del ubiquinol. |
No todos los inhibidores de la fosforilación oxidativa son toxinas. En el tejido adiposo pardo, los canales de protones regulados llamados proteínas desacopladoras pueden desacoplar la respiración de la síntesis de ATP. Esta respiración rápida produce calor y es particularmente importante como una forma de mantener la temperatura corporal para los animales que hibernan, aunque estas proteínas también pueden tener una función más general en las respuestas de las células al estrés.
Historia
El campo de la fosforilación oxidativa comenzó con el informe en 1906 de Arthur Harden sobre el papel vital del fosfato en la fermentación celular, pero inicialmente solo se sabía que estaban involucrados los fosfatos de azúcar. Sin embargo, a principios de la década de 1940, Herman Kalckar estableció firmemente el vínculo entre la oxidación de los azúcares y la generación de ATP, lo que confirmó el papel central del ATP en la transferencia de energía que había sido propuesto por Fritz Albert Lipmann en 1941. Más tarde, en 1949, Morris Friedkin y Albert L. Lehninger demostraron que la coenzima NADH unía vías metabólicas como el ciclo del ácido cítrico y la síntesis de ATP. El término fosforilación oxidativa fue acuñado por Volodymyr Belitser [uk] en 1939.
Durante otros veinte años, el mecanismo por el cual se genera ATP siguió siendo un misterio, y los científicos buscaban un elusivo "intermedio de alta energía" que vinculara las reacciones de oxidación y fosforilación. Este rompecabezas fue resuelto por Peter D. Mitchell con la publicación de la teoría quimiosmótica en 1961. Al principio, esta propuesta fue muy controvertida, pero fue aceptada lentamente y Mitchell recibió un premio Nobel en 1978. La investigación posterior se concentró en purificar y caracterizar las enzimas involucradas, con contribuciones importantes de David E. Green sobre los complejos de la cadena de transporte de electrones, así como de Efraim Racker sobre la ATP sintasa.Paul D. Boyer dio un paso crítico hacia la solución del mecanismo de la ATP sintasa al desarrollar en 1973 el mecanismo de "cambio de unión", seguido de su propuesta radical de catálisis rotacional en 1982. El trabajo más reciente ha incluido estudios estructurales. sobre las enzimas involucradas en la fosforilación oxidativa por John E. Walker, y Walker y Boyer recibieron el Premio Nobel en 1997.
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