Fluoróforo

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Una célula humana etiquetada con fluoroforo.

Un fluoróforo (o fluorocromo, de manera similar a un cromóforo) es un compuesto químico fluorescente que puede reemitir luz tras la excitación de la luz. Los fluoróforos suelen contener varios grupos aromáticos combinados, o moléculas planas o cíclicas con varios enlaces π.

Los fluoróforos a veces se utilizan solos, como trazadores en fluidos, como tinte para teñir determinadas estructuras, como sustrato de enzimas o como sonda o indicador (cuando su fluorescencia se ve afectada por aspectos ambientales como la polaridad o los iones).). De manera más general, están unidos covalentemente a una macromolécula y sirven como marcador (o colorante, etiqueta o indicador) para reactivos afines o bioactivos (anticuerpos, péptidos, ácidos nucleicos). Los fluoróforos se utilizan especialmente para teñir tejidos, células o materiales en una variedad de métodos analíticos, es decir, imágenes fluorescentes y espectroscopia.

La fluoresceína, a través de su isotiocianato de fluoresceína (FITC), derivado isotiocianato reactivo con aminas, ha sido uno de los fluoróforos más populares. Del marcaje de anticuerpos, las aplicaciones se han extendido a los ácidos nucleicos gracias a la carboxifluoresceína (FAM), TET,...). Otros fluoróforos históricamente comunes son los derivados de rodamina (TRITC), cumarina y cianina. Las nuevas generaciones de fluoróforos, muchos de los cuales son patentados, a menudo funcionan mejor, siendo más fotoestables, más brillantes y/o menos sensibles al pH que los tintes tradicionales con excitación y emisión comparables.

Fluorescencia

El fluoróforo absorbe energía luminosa de una longitud de onda específica y reemite luz en una longitud de onda más larga. Las longitudes de onda absorbidas, la eficiencia de la transferencia de energía y el tiempo antes de la emisión dependen tanto de la estructura del fluoróforo como de su entorno químico, ya que la molécula en su estado excitado interactúa con las moléculas circundantes. Las longitudes de onda de máxima absorción (≈ excitación) y emisión (por ejemplo, Absorción/Emisión = 485 nm/517 nm) son los términos típicos utilizados para referirse a un fluoróforo determinado, pero puede ser importante considerar todo el espectro. El espectro de longitudes de onda de excitación puede ser una banda muy estrecha o más amplia, o puede estar por encima de un nivel de corte. El espectro de emisión suele ser más nítido que el espectro de excitación, tiene una longitud de onda más larga y, en consecuencia, una energía más baja. Las energías de excitación varían desde el ultravioleta hasta el espectro visible, y las energías de emisión pueden continuar desde la luz visible hasta la región del infrarrojo cercano.

Las principales características de los fluoróforos son:

  • Potenciación máxima y longitud de onda de emisión (expresado en nanometros (nm)): corresponde al pico en el espectro de excitación y emisión (generalmente un pico cada uno).
  • Coeficiente de absorción de molares (en Molar−1cm−1): vincula la cantidad de luz absorbida, a una longitud de onda determinada, a la concentración de fluoróforo en solución.
  • Rendimiento cuántico: eficiencia de la energía transferida de la luz del incidente a fluorescencia emitida (= número de fotones emitidos por fotones absorbidos).
  • Vida (en picosegundos): duración del estado excitado de un fluoróforo antes de regresar a su estado del suelo. Se refiere al tiempo que se toma para una población de fluoróforos excitados para desintegrarse a 1/e (Ω0.368) de la cantidad original.
  • Cambio de estómagos: diferencia entre la máxima excitación y longitudes de onda máximas de emisión.
  • Fracción oscura: proporción de las moléculas activas en la emisión de fluorescencia. Para puntos cuánticos, la microscopía prolongada de un solo molécula mostró que el 20-90% de todas las partículas nunca emiten fluorescencia. Por otro lado, las nanopartículas polímeros conjugadas (Pdots) muestran casi ninguna fracción oscura en su fluorescencia. Las proteínas fluorescentes pueden tener una fracción oscura de la formación de cromoforo de proteínas o defectuosas.

Estas características impulsan otras propiedades, incluido el fotoblanqueo o la fotorresistencia (pérdida de fluorescencia tras la excitación de luz continua). Se deben considerar otros parámetros, ya que la polaridad de la molécula del fluoróforo, el tamaño y la forma del fluoróforo (es decir, el patrón de fluorescencia de polarización) y otros factores pueden cambiar el comportamiento de los fluoróforos.

Los fluoróforos también se pueden utilizar para apagar la fluorescencia de otros tintes fluorescentes (consulte el artículo Extinción (fluorescencia)) o para transmitir su fluorescencia a longitudes de onda aún más largas (consulte el artículo Transferencia de energía por resonancia de Förster (FRET)).

Ver más sobre el principio de fluorescencia.

Tamaño (peso molecular)

La mayoría de los fluoróforos son pequeñas moléculas orgánicas de 20 a 100 átomos (200 a 1000 Dalton; el peso molecular puede ser mayor dependiendo de las modificaciones injertadas y las moléculas conjugadas), pero también hay fluoróforos naturales mucho más grandes que son proteínas: verde fluorescente La proteína (GFP) es de 27 kDa y varias ficobiliproteínas (PE, APC...) son de ≈240 kDa. En 2020, se afirmó que el fluoróforo más pequeño conocido era el 3-hidroxiisonicotinaldehído, un compuesto de 14 átomos y solo 123 Da.

Las partículas fluorescentes como los puntos cuánticos: de 2 a 10 nm de diámetro y de 100 a 100 000 átomos, también se consideran fluoróforos.

El tamaño del fluoróforo podría obstaculizar estéricamente la molécula marcada y afectar la polaridad de la fluorescencia.

Familias

Fluorescencia de diferentes sustancias bajo luz UV. Verde es una fluoresceína, rojo es Rhodamine B, amarillo es Rhodamine 6G, azul es quinina, púrpura es una mezcla de quinina y rodamina 6g. Las soluciones son alrededor del 0.001% de concentración en agua.

Las moléculas de fluoróforo podrían utilizarse solas o servir como motivo fluorescente de un sistema funcional. Según la complejidad molecular y los métodos sintéticos, las moléculas de fluoróforo podrían clasificarse generalmente en cuatro categorías: proteínas y péptidos, pequeños compuestos orgánicos, oligómeros y polímeros sintéticos y sistemas de múltiples componentes.

Las proteínas fluorescentes GFP (verde), YFP (amarilla) y RFP (roja) se pueden unir a otras proteínas específicas para formar una proteína de fusión, sintetizada en células después de la transfección de un portador de plásmido adecuado.

Los fluoróforos orgánicos

no proteicos pertenecen a las siguientes familias químicas principales:

  • Xanthene derivatives: fluoresceína, rodamina, Oregon verde, eosina y Texas rojo
  • Derivados cianinos: cianina, indocarbociana, oxacarbociana, tiacarbociana y merocianina
  • Derivados de escuadra y escuadras substituidas por anillo, incluyendo los tintes de Seta y Square
  • Derivados rotativos escuaranos: See Tau dyes
  • Derivados de naftalina (Ddansyl y derivados prodan)
  • Derivados Coumarin
  • Derivados oxadiazoles: pyridyloxazole, nitrobenzoxazole y benzoxadiazole
  • Derivados antracitanos: antraquinones, incluyendo DRAQ5, DRAQ7 y CyTRAK Orange
  • Pyrene derivatives: azul cascada, etc.
  • Derivados de Oxazina: Nilo rojo, Azul Nilo, violeta de cresilo, oxazina 170, etc.
  • Acridine derivatives: proflavin, acridina naranja, acridina amarilla, etc.
  • Arylmethine derivatives: auramina, violeta de cristal, verde malachito
  • Tetrapyrrole derivatives: porfin, phthalocyanine, bilirubin
  • Dipyrromethene derivatives: BODIPY, aza-BODIPY

Estos fluoróforos emiten fluorescencia debido a electrones deslocalizados que pueden saltar una banda y estabilizar la energía absorbida. El benceno, uno de los hidrocarburos aromáticos más simples, por ejemplo, se excita a 254 nm y emite a 300 nm. Esto distingue los fluoróforos de los puntos cuánticos, que son nanopartículas semiconductoras fluorescentes.

Se pueden unir a proteínas a grupos funcionales específicos, como grupos amino (éster activo, carboxilato, isotiocianato, hidracina), grupos carboxilo (carbodiimida), tiol (maleimida, bromuro de acetilo), azida orgánica (mediante química de clic). o de forma no específica (glutaraldehído)).

Además, pueden estar presentes varios grupos funcionales para alterar sus propiedades, como la solubilidad, o conferir propiedades especiales, como el ácido borónico que se une a azúcares o múltiples grupos carboxilo para unirse a ciertos cationes. Cuando el tinte contiene un grupo donador de electrones y un grupo aceptor de electrones en los extremos opuestos del sistema aromático, este tinte probablemente será sensible a la polaridad del medio ambiente (solvatocrómico), por lo que se denomina sensible al medio ambiente. A menudo se utilizan colorantes en el interior de las células, que son impermeables a las moléculas cargadas, como resultado de esto los grupos carboxilo se convierten en un éster, que se elimina mediante esterasas dentro de las células, por ejemplo, fura-2AM y diacetato de fluoresceína.

Las siguientes familias de tintes son grupos de marcas registradas y no necesariamente comparten similitudes estructurales.

  • Tinte CF (Biotium)
  • Sondas DRAQ y CyTRAK (BioStatus)
  • BODIPY (Invitrogen)
  • EverFluor (Setareh Biotech)
  • Alexa Fluor (Invitrógeno)
  • Bella Fluor (Setareh Biotech)
  • Fluor DyLight (Thermo Scientific, Pierce)
  • Atto y Tracy (Sigma Aldrich)
  • FluoProbes (Interchim)
  • Abberior Dyes (Abberior)
  • DY y MegaStokes Dyes (Dyomics)
  • Sulfo Cy dyes (Cyandye)
  • Fluor HiLyte (AnaSpec)
  • Seta, Setau y Square Dyes (SETA BioMedicals)
  • Tintes de Quasar y Cal Fluor (Biosearch Technologies)
  • SureLight Dyes (APC, RPEPerCP, Phycobilisomes) (Columbia Biosciences)
  • APC, APCXL, RPE, BPE (Phyco-Biotech, Greensea, Prozyme, Flogen)
  • Vio Dyes (Miltenyi Biotec)
Pulmonar Bovine Artery Endothelial cell nuclei manchado azul con DAPI, mitocondria manchado rojo con MitoTracker Red CMXRos, y F-actin manchado verde con Alexa Fluor 488 phalloidin e imagenado en un microscopio fluorescente.

Ejemplos de fluoróforos que se encuentran con frecuencia

Colorantes reactivos y conjugados

Dye Ex (nm) Em (nm) MW Notas
Hydroxycoumarin 325 386 331 Succinimidyl ester
Aminocoumarina 350 445 330 Succinimidyl ester
Methoxycoumarin 360 410 317 Succinimidyl ester
Cascade Blue (375);401 423 596 Hidrazide
Pacific Blue 403 455 406 Maleimide
Pacific Orange 403 551
3-Hydroxyisonicotinaldehyde 385 525 123 PY 0.15; pH sensible
Lucifer amarillo 425 528
NBD 466 539 294 NBD-X
R-Phycoerythrin (PE) 480;565 578 240 k
PE-Cy5 conjugados 480;565; 650 670 aka Cychrome, R670, Tri-Color, Quantum Red
PE-Cy7 conjugados 480;565;743 767
Rojo 613 480;565 613 PE-Texas Red
PerCP 490 675 35kDa Proteína de clorofila peridina
TruRed 490.675 695 PerCP-Cy5.5 conjugado
FluorX 494 520 587 (GE Healthcare)
Fluorescein 495 519 389 FITC; pH sensible
BODIPY-FL 503 512
G-Dye100 498 524 adecuado para etiquetado de proteínas y electroforesis
G-Dye200 554 575 adecuado para etiquetado de proteínas y electroforesis
G-Dye300 648 663 adecuado para etiquetado de proteínas y electroforesis
G-Dye400 736 760 adecuado para etiquetado de proteínas y electroforesis
Cy2 489 506 714 QY 0.12
Cy3 (512);550 570;(615) 767 QY 0.15
Cy3B 558 572; (620) 658 QY 0.67
Cy3.5 581 594; (640) 1102 QY 0.15
Cy5 (625); 650 670 792 QY 0,28
Cy5.5 675 694 1272 QY 0,23
Cy7 743 767 818 QY 0,28
TRITC 547 572 444 TRITC
X-Rhodamine 570 576 548 XRITC
Lissamine Rhodamine B 570 590
Texas Red 589 615 625 Sulfonyl chloride
Allophycocyanin (APC) 650 660 104 k
APC-Cy7 conjugados 650;755 767 Far Red

Abreviaturas:

  • Ex (nm): longitud de onda de excitación en nanometros
  • Em (nm): longitud de onda de emisión en nanometros
  • MW: Peso molecular
  • QY: Rendimiento cuántico

Tintes de ácidos nucleicos

Dye Ex (nm) Em (nm) MW Notas
Hoechst 33342 343 483 616 AT-selective
DAPI 345 455 AT-selective
Hoechst 33258 345 478 624 AT-selective
SYTOX Azul 431 480 ~400 ADN
Cromomicina A3 445 575 CG-selective
Mithramycin 445 575
YOYO-1 491 509 1271
Ethidium Bromide 210;285 605 394 en solución acuosa
GelRed 290;520 595 1239 Sustituto no tóxico de Ethidium Bromide
Acridine Orange 503 530/640 DNA/RNA
SYTOX Verde 504 523 ~600 ADN
TOTO-1, TO-PRO-1 509 533 Vital mancha, TOTO: Cyanine Dimer
TO-PRO: Cyanine Monomer
Thiazole Orange 510 530
CyTRAK Naranja 520 615 - (Biostatus) (excitación roja oscura)
Propidium Iodide (PI) 536 617 668.4
LDS 751 543;590 712; 607 472 ADN (543ex/712em), ARN (590ex/607em)
7-AAD 546 647 7-aminoactinomycin D, CG-selective
SYTOX Naranja 547 570 ~500 ADN
TOTO-3, TO-PRO-3 642 661
DRAQ5 600/647 697 413 (Biostatus) (excitación útil hasta 488)
DRAQ7 599/644 694 ~700 (Biostatus) (excitación útil hasta 488)

Tintes de función celular

Dye Ex (nm) Em (nm) MW Notas
Indo-1 361/330 490/405 Graben 19, 1010 AM ester, bajo/alto calcio (Ca2+)
Fluo-3 506 526 855 AM Ester. pH Ø 6
Fluo-4 491/494 516 1097 AM Ester. pH 7.2
DCFH 505 535 529 2'7'Dichorodihidrofluoresceína, forma oxidada
DHR 505 534 346 Dihidrorhodamina 123, forma oxidada, cataliza la luz oxidación
SNARF 548/579 587/635 pH 6/9

Proteínas fluorescentes

Dye Ex (nm) Em (nm) MW QY BR PS Notas
GFP (Y66H mutation) 360 442
GFP (mutación Y66F) 360 508
EBFP 380 440 0.18 0,277 monomer
EBFP2 383 448 20 monomer
Azurite 383 447 15 monomer
GFPuv 385 508
T-Sapphire 399 511 0.60 26 25 débil dimer
Cerulean 433 475 0,622 27 36 débil dimer
mCFP 433 475 0.40 13 64 monomer
mTurquoise2 434 474 0.93 28 monomer
ECFP 434 477 0.15 3
CyPet 435 477 0.51 18 59 débil dimer
GFP (Y66W mutation) 436 485
m Keima-Red 440 620 0,244 3 monomer (MBL)
TagCFP 458 480 29 dimer (Evrogen)
AmCyan1 458 489 0,75 29 tetramer, (Clontech)
mTFP1 462 492 54 dimer
GFP (S65A mutation) 471 504
Midoriishi Cyan 472 495 0.9 25 dimer (MBL)
Tipo salvaje GFP 396.475 508 26k 0,777
GFP (S65C mutation) 479 507
TurboGFP 482 502 26 k 0,53 37 dimer, (Evrogen)
TagGFP 482 505 34 monomer (Evrogen)
GFP (S65L mutation) 484 510
Esmeralda 487 509 0,688 39 0.69 débil, (Invitrógeno)
GFP (S65T mutation) 488 511
EGFP 488 507 26k 0.60 34 174 débil, (Clontech)
Azami Green 492 505 0,74 41 monomer (MBL)
ZsGreen1 493 505 105k 0.91 40 tetramer, (Clontech)
TagyFP 508 524 47 monomer (Evrogen)
EYFP 514 527 26k 0.61 51 60 débil, (Clontech)
Topacio 514 527 57 monomer
Venus 515 528 0,57 53 15 débil dimer
m Citrine 516 529 0,76 59 49 monomer
YPet 517 530 0,777 80 49 débil dimer
TurboYFP 525 538 26 k 0,53 55,7 dimer, (Evrogen)
ZsYellow1 529 539 0.65 13 tetramer, (Clontech)
Kusabira Orange 548 559 0.60 31 monomer (MBL)
m Naranja 548 562 0.69 49 9 monomer
Allophycocyanin (APC) 652 657,5 105 kDa 0,688 heterodimer, crosslinked
mKO 548 559 0.60 31 122 monomer
TurboRFP 553 574 26 k 0,677 62 dimer, (Evrogen)
tdTomato 554 581 0.69 95 98 Tandem dimer
TagRFP 555 584 50 monomer (Evrogen)
DsRed monomer 556 586 ~28k 0.1 3.5 16 monomer, (Clontech)
DsRed2 ("RFP") 563 582 ~110k 0,555 24 (Clontech)
mStrawberry 574 596 0.29 26 15 monomer
TurboFP602 574 602 26 k 0,355 26 dimer, (Evrogen)
AsRed2 576 592 ~110k 0.21 13 tetramer, (Clontech)
mRFP1 584 607 ~30k 0,25 monomer, (Tsien lab)
J-Red 584 610 0.20 8.8 13 dimer
R-phycoerythrin (RPE) 565 Ø498 573 250 kDa 0.84 heterotrimer
B-phycoerythrin (BPE) 545 572 240 kDa 0.98 heterotrimer
m Cherry 587 610 0.22 16 96 monomer
HcRed1 588 618 ~52k 0,03 0.6 dimer, (Clontech)
Katusha 588 635 23 dimer
P3 614 662 ~10.000 kDa complejo fitobilioso
Peridinin Chlorophyll (PerCP) 483 676 35 kDa trimer
mKate (TagFP635) 588 635 15 monomer (Evrogen)
TurboFP635 588 635 26 k 0.34 22 dimer, (Evrogen)
m Plum 590 649 51,4 k 0.10 4.1 53
m Raspberry 598 625 0.15 13 monómero, fotobleach más rápido que mPlum
m Scarlet 569 594 0 71 277 monomer

Abreviaturas:

  • Ex (nm): longitud de onda de excitación en nanometros
  • Em (nm): longitud de onda de emisión en nanometros
  • MW: Peso molecular
  • QY: Rendimiento cuántico
  • BR: Brillo: coeficiente de absorción de molares * rendimiento cuántico / 1000
  • PS: Photostability: time [sec] to reduce brightness by 50%

Aplicaciones

Los fluoróforos tienen particular importancia en el campo de la bioquímica y los estudios de proteínas, por ejemplo, en inmunofluorescencia pero también en el análisis celular, por ejemplo. inmunohistoquímica y sensores de moléculas pequeñas.

Usos fuera de las ciencias biológicas

Tinte de mar fluorescente

Además, los tintes fluorescentes encuentran un amplio uso en la industria, bajo el nombre de "colores neón", como por ejemplo:

  • Usos de escala multiton en tintes textiles y brillos ópticos en detergentes de lavandería
  • Formulaciones cosméticas avanzadas; equipo de seguridad y ropa
  • Diódos orgánicos emisores de luz (OLED)
  • Bellas artes y diseño (posteros y pinturas)
  • Sinergistas para insecticidas y fármacos experimentales
  • Como tinte en los resaltadores para dar un efecto de brillo
  • Paneles solares para recoger más luz / longitudes de onda
  • El tinte de mar fluorescente se utiliza para ayudar a los equipos de búsqueda y rescate aéreos a localizar objetos en el agua

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