Flaviviridae

Flaviviridae es una familia de virus de ARN de cadena positiva con envoltura que infecta principalmente a mamíferos y aves. Se transmiten principalmente a través de vectores artrópodos (principalmente garrapatas y mosquitos). La familia recibe su nombre del virus de la fiebre amarilla; flavus en latín significa "amarillo", y la fiebre amarilla a su vez recibió su nombre debido a su propensión a causar ictericia en las víctimas. Hay 89 especies en la familia divididas en cuatro géneros. Las enfermedades asociadas con el grupo incluyen: hepatitis (hepacivirus), síndromes hemorrágicos, enfermedades mortales de las mucosas (pestivirus), fiebre hemorrágica, encefalitis y microcefalia (flavivirus) como defecto de nacimiento.

Estructura

Las partículas de virus están envueltas y son esféricas con geometrías de tipo icosaédrico que tienen simetría pseudo T=3. Miden entre 40 y 60 nm de diámetro.

Genoma

Los miembros de la familia Flaviviridae tienen genomas de ARN monopartito, lineal y monocatenario de polaridad positiva y de 9,6 a 12,3 kilobases de longitud total. Los terminales 5' de los flavivirus llevan una cubierta de nucleótidos metilados, mientras que otros miembros de esta familia no tienen cubierta y codifican un sitio de entrada interno al ribosoma.

El genoma codifica una sola poliproteína con múltiples dominios transmembrana que se escinde, tanto por las proteasas virales como del huésped, en proteínas estructurales y no estructurales. Entre los productos proteicos no estructurales (NS), las ubicaciones y secuencias de NS3 y NS5, que contienen motivos esenciales para el procesamiento de poliproteínas y la replicación del ARN, respectivamente, están relativamente bien conservadas en toda la familia y pueden ser útiles para el análisis filogenético.

Ciclo de vida

Ciclo de vida del virus de la encefalitis japonesa (JEV)

La replicación viral es citoplasmática. La entrada en la célula huésped se logra mediante la unión de la proteína E de la cubierta viral a los receptores del huésped, lo que media la endocitosis mediada por clatrina. La replicación sigue el modelo de replicación de virus de ARN de cadena positiva. La transcripción de virus de ARN de cadena positiva es el método de transcripción. La traducción tiene lugar por iniciación viral. El virus sale de la célula huésped por gemación. Los humanos y los mamíferos sirven como huéspedes naturales. El virus se transmite a través de vectores (garrapatas y mosquitos).

Taxonomía

Árbol filogenético de Flaviviridae usando las secuencias de proteínas NS3

La familia tiene cuatro géneros:

• Genus Flavivirus (incluye Dengue virus, Encefalitis japonesa, Kyasanur Forest disease, Virus de Powassan, West Nile virus, Virus de la fiebre amarilla, y Zika virus)
• Genus Hepacivirus (incluye Hepacivirus C (virus de la hepatitis C) y Hepacivirus B (virus B))
• Genus Pegivirus (incluye Pegivirus A (virus GB A), Pegivirus C (virus GB C), y Pegivirus B (virus GB D)
• Genus Pestivirus (incluye Pestivirus A (virus de la diarrea viral bovina 1) y Pestivirus C (virus clásico de la fiebre porcina, virus previamente del cólera de cerdo)). Los virus en este género infectan a los mamíferos no humanos.

No clasificado

Se conocen otros flavivirus que aún no se han clasificado. Estos incluyen el virus del tiburón Wenling.

Jingmenvirus es un grupo de virus no clasificados en la familia que incluye el virus Alongshan, el virus Guaico Culex, el virus de la garrapata Jingmen y el virus de la garrapata Mogiana. Estos virus tienen un genoma segmentado de 4 o 5 piezas. Dos de estos segmentos se derivan de flavivirus.

Varios virus pueden estar relacionados con los flavivirus, pero tienen características que son atípicas de los flavivirus. Estos incluyen el virus similar al Jingmen de los cítricos, el virus del nematodo del quiste de la soja 5, el agente larvario de Toxocara canis, el virus del grillo de Wuhan y posiblemente el virus asociado con Gentian Kobu-sho.

Importancia clínica

Las principales enfermedades causadas por miembros de la familia Flaviviridae incluyen: