Dinokaryota

Dinokaryota es un grupo principal de dinoflagelados. Incluyen todas las especies en las que el núcleo sigue siendo un dinocarión durante todo el ciclo celular, que normalmente está dominado por la etapa haploide. Todo lo "típico" los dinoflagelados, como Peridinium y Gymnodinium, pertenecen aquí. Otros son más inusuales, incluidos algunos que son coloniales, ameboides o parásitos. Symbiodinium contiene las zooxantelas simbióticas.

Se cree que los miembros no fotosintéticos derivan de ancestros fotosintéticos.

Clasificación

Los dinoflagelados se clasifican por morfología.

Con una teca

Las especies con teca se dividen en cuatro órdenes, según la disposición de las placas de armadura:

• Dinophysiales - por ejemplo. Dinophysis
• Gonyaulacales - por ejemplo. Ceratium, Gonyaulax
• Peridiniales - por ejemplo. Peridinium
• Prorocentrales - por ejemplo. Prorocentrum

Los Peridiniales son probablemente parafiléticos a los demás, y en los árboles de ARNr se mezclan con las especies que carecen de teca. Los otros tres órdenes son probablemente monofiléticos, con Dinophysiales y Prorocentrales como parientes cercanos, unidos por la presencia de una sutura sagital que divide la teca en dos.

Sin embargo, en los árboles de ARNr, los Prorocentrales están divididos.

Sin teca

Los grupos de dinoflagelados sin teca se entienden artificiales, y en su mayoría son polifiléticos. Muchos de los géneros, como Gymnodinium y Amphidinium, también son polifiléticos. Sin embargo, algunos pueden aproximarse a grupos monofiléticos, como los Suessiales, y algunos no se han estudiado filogenéticamente.

• Gymnodiniales - por ejemplo. Gymnodinium, Amphidinium
• Ptychodiscales
• Suessiales - por ejemplo. Symbiodinium
• Desmocapsales
• Phytodiniales (incluye Dinococcales, Dinotrichales) - por ejemplo. Dinamoeba, Pfiesteria
• Thoracosphaerales

Blastodiniales

También hay un grupo de dinoflagelados parásitos, los Blastodiniales, que no tienen dinokarya durante su etapa trófica. Debido a esto, se han tratado como una clase separada de Blastodiniphyceae, pero es posible que algunas o todas se hayan desarrollado dentro de las Dinophyceae.