Dendrograma

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Dendrogram of a hierarchical clustering (UPGMA) with the height of the nodes (adapted from bacterial 5S rRNA sequence data).
Producción de dendrogramas para agrupación jerárquica de provincias marinas utilizando presencia / ausencia de especies de esponjas.
Un dendrograma del Árbol de la Vida. Este árbol filogenético se adapta de Woese et al. análisis de rRNA. La línea vertical en la parte inferior representa el último antepasado común universal (LUCA).
Heatmap of RNA-Seq data showing two dendrograms in the left and top margins.

Un dendrograma es un diagrama que representa un árbol. Esta representación esquemática se utiliza frecuentemente en diferentes contextos:

  • en agrupación jerárquica, ilustra la disposición de los racimos producidos por los análisis correspondientes.
  • en la biología computacional, muestra el agrupamiento de genes o muestras, a veces en los márgenes de los mapas de calor.
  • en la filogenética, muestra las relaciones evolutivas entre varios taxones biológicos. En este caso, el dendrograma también se llama un árbol filogenético.

El nombre dendrogram deriva de las dos antiguas palabras griegas δتν ()déndron), que significa "árbol", y γδρμμ ()grámma), que significa "drawing, figura matemática".

Ejemplo de agrupación

Para un ejemplo de agrupación, suponga que cinco taxones ( a ) han sido agrupados por UPGMA basado en una matriz de distancias genéticas. El dendrograma de agrupación jerárquica mostrará una columna de cinco nodos que representan los datos iniciales (aquí taxa individual), y los nodos restantes representan los racimos a los que pertenecen los datos, con las flechas que representan la distancia (disimilaridad). La distancia entre los racimos fusionados es monotona, aumentando con el nivel de la fusión: la altura de cada nodo en la parcela es proporcional al valor de la disimilaridad intergrupo entre sus dos hijas (los nodos de la derecha representando las observaciones individuales trazados a cero altura).

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