D-alanina—D-alanina ligasa

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En enzimología, una D-alanina—D-alanina ligasa (EC 6.3.2.4) es una enzima que cataliza la reacción química.

ATP + 2 D-alanina

\rightleftharpoons

ADP + fosfato + D-alanil-D-alanina

Por lo tanto, los dos sustratos de esta enzima son ATP y D-alanina, mientras que sus tres productos son ADP, fosfato y D-alanil-D-alanina.

Esta enzima pertenece a la familia de las ligasas de unión a ATP, específicamente a las que forman enlaces carbono-nitrógeno como las ligasas ácido-D-aminoácido (péptido sintasas). El nombre sistemático de esta clase de enzimas es D-alanina:D-alanina ligasa (formadora de ADP). Otros nombres comunes incluyen alanina:alanina ligasa (formadora de ADP) y alanilalanina sintetasa. Esta enzima participa en el metabolismo de la D-alanina y la biosíntesis de peptidoglicano. Se sabe que el fosfinato y la D-cicloserina inhiben esta enzima.Se cree que la región N-terminal de la D-alanina—D-alanina ligasa participa en la unión del sustrato, mientras que el C-terminal es un dominio catalítico.

Estudios estructurales

A finales de 2007, se habían resuelto ocho estructuras para esta clase de enzimas, con los códigos de acceso PDB 1EHI, 1IOV, 1IOW, 2DLN, 2FB9, 2I80, 2I87 y 2I8C.

Referencias

^ Roper DI, Huyton T, Vagin A, Dodson G (agosto 2000). "La base molecular de la resistencia a la vancomicina en Enterococci clínicamente relevante: estructura cristalina de ligasa D-alanil-D-lactate (VanA)". Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 97 (16): 8921 –5. Bibcode:2000PNAS...97.8921R. doi:10.1073/pnas.150116497. PMC 16797. PMID 10908650.

Más lectura

Ito, E; Strominger JL (1962). "Enzimática síntesis del péptido en nucleótidos bacterianos de uridina II. Enzimática síntesis y adición de D-alanil-D-alanine". J. Biol. Chem. 237: 2696–2703. doi:10.1016/S0021-9258(19)73809-5.
Neuhaus FC (1962). "Estudios Kinetic sobre la sintetización D-Ala-D-Ala". Fed. Proc. 21: 229.
van Heijenoort J (2001). "Los avances recientes en la formación de la unidad monomer bacteriana peptidoglycan". Nat. Prod. Rep. 18 5): 503 –19. doi:10.1039/a804532a. PMID 11699883.

Este artículo incorpora texto del dominio público Pfam e InterPro: IPR011127

v t e Enzimas: CO CS y ligas CN (EC 6.1-6.3)
6.1: Carbon-Oxygen	Aminoacyl tRNA synthetase Alanine Arginine Asparagine Aspartate Cysteine D-Alanina-poly(phosphoribitol) ligase Glutamate Glutamina Glycine Histidina Isoleucine Leucine Lysine Metionina Fenilalanina Proline Serine Threonine Tryptophan Tyrosine Valine
6.2: Carbon-Sulfur	(2,2,3-trimetil-5-oxociclopent-3-enyl)acetil-CoA synthase 2-furoato—CoA ligase 3-alpha,7-alpha-dihidroxy-5-beta-cholestanato—CoA ligase 3-hidroxibenzoato-CoA ligase 3-hidroxipropionyl-CoA sinthase 4-clorobenzoato—CoA ligase 4-Coumarate-CoA ligase 4-hidroxibenzoato-CoA ligase 6-carboxyhexanoato—CoA ligase Acetato: ligasa ACP Acetato-CoA ligase (formado ADP) Acetoacetate—CoA ligase Acetyl—CoA synthetase Acid—CoA ligase (formado por GDP) Anthranilate—CoA ligase Arachidonato—CoA ligase Benzoato—CoA ligase Biotina-CoA ligase (proteína de acil-carrier de butirosin) - L-glutamato ligase Butyrate—CoA ligase Cholate—CoA ligase Citrate—CoA ligase (citrate (pro-3S)-lyase) ligase Dicarboxilato—CoA ligase Glutarate—CoA ligase Long-chain-fatty-acid—ACP ligase Long-chain-fatty-acid—CoA ligase Malate—CoA ligase Malonato—CoA ligase o-Succinylbenzoate—CoA ligase Oxalato—CoA ligase Phenylacetate—CoA ligase Fitanato—CoA ligase Propionate—CoA ligase Succinate—CoA ligase (forming ADP) Succinate—CoA ligase (formado por GDP) Succinyl—CoA synthetase trans-Feruloyl—CoA synthase
6.3: Carbon-Nitrogen	Sintetizador de glucotamina Ubiquitin ligase Cullin Supresor del tumor de Von Hippel-Lindau UBE3A Mdm2 Complejo de producción de anáfasis UBR1 Glutathione synthetase Sintetizador CTP Adenylosuccinate synthase Argininosuccinate synthase Holocarboxylase sinthetase GMP synthase Asparagine synthetase Carbamoil fosfato sinthetase I II Glutamate-cisteine ligase

v t e Enzymes
Actividad	Sitio activo Sitio de enlace Triada catalítica Oxyanion hole Enzyme promiscuity Enzima limitada a la difusión Cofactor Enzyme catalysis
Reglamento	Regulación alosterica Cooperatividad Inhibidor enzima Activador de Enzyme
Clasificación	Número de la CE Enzyme superfamilia Enzyme family Lista de enzimas
Kinetics	Enzyme kinetics Eadie-Hofstee diagram Hanes-Woolf plot Lineweaver-Burk plot Michaelis–Cinética de los hombres
Tipos	EC1 Oxidoreductas (lista) EC2 Transferases (lista) CE3 Hidrolas (lista) EC4 Lías (lista) EC5 Isomerases (lista) Ligas CE6 (lista) Translocases EC7 (lista)

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