Cromosoma 22
El Cromosoma 22 es uno de los 23 pares de cromosomas de las células humanas. Los humanos normalmente tenemos dos copias del cromosoma 22 en cada célula. El cromosoma 22 es el segundo cromosoma humano más pequeño, abarca alrededor de 51 millones de pares de bases de ADN y representa entre el 1,5 y el 2% del ADN total de las células.
En 1999, los investigadores que trabajaban en el Proyecto Genoma Humano anunciaron que habían determinado la secuencia de pares de bases que componen este cromosoma. El cromosoma 22 fue el primer cromosoma humano secuenciado completamente.
Los cromosomas humanos se numeran según su tamaño aparente en el cariotipo, siendo el cromosoma 1 el más grande y el cromosoma 22 originalmente identificado como el más pequeño. Sin embargo, la secuenciación del genoma ha revelado que el cromosoma 21 es en realidad más pequeño que el cromosoma 22.
Genes
Número de genes
Las siguientes son algunas de las estimaciones del recuento de genes del cromosoma 22 humano. Debido a que los investigadores utilizan diferentes enfoques para la anotación del genoma, sus predicciones sobre la cantidad de genes en cada cromosoma varían (para obtener detalles técnicos, consulte predicción de genes). Entre varios proyectos, el proyecto colaborativo de secuencia de codificación por consenso (CCDS) adopta una estrategia extremadamente conservadora. Por lo tanto, la predicción del número de genes del CCDS representa un límite inferior en el número total de genes que codifican proteínas humanas.
Estimación | genes de codificación de proteínas | genes de ARN no codificación | Pseudogenes | Fuente | Fecha de lanzamiento |
---|---|---|---|---|---|
CCDS | 417 | — | — | 2016-09-08 | |
HGNC | 424 | 161 | 295 | 2019-07-08 | |
Ensembl | 489 | 515 | 325 | 2017-03-29 | |
UniProt | 496 | — | — | 2018-02-28 | |
NCBI | 474 | 392 | 379 | 2017-05-19 |
Lista de genes
Lo siguiente es una lista parcial de genes en el cromosoma humano 22. Para la lista completa, vea el enlace en el cuadro de información a la derecha.
- ADM2: proteína de codificación ADM2
- APOBEC3B: proteína de codificación probable ADN dC- título enzima APOBEC-3B
- ARFGAP3: proteína de codificación Factor de ribosylación ADP Proteína activada por GTPasa 3
- ASCC2: proteína de codificación que activa el cointegrador de señal 1 subunidad compleja 2
- ATF4 (22q13) proteína cíclica factor de transcripción ATF-4
- BCR (22q11) encoding breakpoint cluster region protein
- CARD10 (22q13) proteína de reclutamiento de cacao de codificación 10
- CBX7 (22q13) chromobox protein homolog 7
- CDC42EP1: proteína de efecto CDC42 1
- CECR1: Síndrome de ojo gato región crítica proteína 1
- CHEK2 (22q12)
- COMT
- CRELD2: rico en cisteína con proteína de dominio similar a EGF 2
- CSDC2: proteína D2 que contiene el dominio del shock frío
- CSNK1E: encoding enzima casein kinase I isoform epsilon o CK1ε,
- DGCR5: encoding a long non-coding RNA
- DGCR6: síndrome de DiGeorge crítico región gen 6
- EP300
- EP300-AS1
- EWSR1
- TAFA5: familia con semejanza de secuencia 19 miembros A5
- FAM227A: proteína de codificación FAM227A
- FBLN1
- GTPBP1: proteína de unión GTP 1
- HMGXB4: proteína de codificación HMG-box que contiene 4
- IFT27: encoding protein intraflagellar transport 27
- IGL@
- IGLJ3 proteína de codificación inmunoglobulina lambda uniendo 3
- IGLL5: proteína de codificación inmunoglobulina lambda como polipéptida 5
- KIAA0930: proteína no carbonatada KIAA0930
- LINC00899 proteína de codificación larga codificación intergénica RNA 899
- MAPK1
- MAPK12
- MCAT: enzima encoding malonyl CoA-acyl portador protein transacylase, mitocondrial
- MCM5
- MIF
- MIRLET7BHG: proteína de codificación MIRLET7B gen de host (codificación no proteína)
- MKL1
- MMP11
- MN1
- MTP18:
- MYH9
- NF2
- NOL12: proteína nucleolar de codificación 12
- PARVB
- PDGFB
- PI4KA: enzima de codificación fosfatidylinositol 4-kinasa alfa
- PI4KAP2: pseudogene phosphatidylinositol 4-kinase alpha pseudogene 2
- PISD: enzima encoding fosphatidylserine decarboxylase proenzyme
- PNPLA3: enzima de codificación patatina-como fosfolipasa proteína de dominio que contiene 3
- PRAME: encoding protein melanoma antigeno preferentemente expresado en tumores
- RAC2
- RBX1
- RNR5: codificación de ARN, cúmulo costosomal 45S 5
- RNU12: proteína de codificación ARN, U12 pequeño nuclear
- RRP7A: proteína de codificación proteína ribosomal proteína de procesamiento de ARN 7 homolog A
- RTCB: proteína de codificación RNA 2',3' de fosfato cíclico y ligasa 5'-OH
- RTL6: proteína de codificación retrotransposon Gag como 6
- SAMM50: componente de clasificación de proteínas de codificación y montaje 50 homolog
- SEPT3: proteína de codificación septina neuronal específica-3
- SEPT5
- SHFM3P1:
- SOX10
- SYNGR1: proteína de codificación sinaptogirina-1
- TBC1D10A: proteína de codificación TBC1 propiedad familiar 10A
- TEF: factor embrionario de proteína de codificación
- THAP7: proteína de codificación THAP proteína que contiene dominio 7
- THOC5: proteína de codificación THO complejo subunidad 5 homolog
- TRMU: enzima de codificación mitocondrial tRNA específico 2-tiouridylase 1
- TTC28: proteína de codificación tetratricopeptida repetición dominio 28
- TTLL1: enzima de codificación probable tubulina poliglutamylase TTLL1
- XRCC6: proteína de codificación Ku70
Locus | Gene | Descripción | Estado |
22q11.1-q11.2 | IGL@ | Facies asimétricas de llanto (síndrome cardiofacial de Cayler) | |
22q11.21 | TBX1 | T-box 1 | |
22q11 | RTN4R | Reticulón 4 receptor | Esquizofrenia |
22q11.21-q11.23 | COMT | gen catechol-O-methyltransferase | |
22q12.1-q13.1 | NEFH | neurofilamento, polipéptidos pesados 200kDa | |
22q12.1 | CHEK2 | CHK2 checkpoint homolog (S. pombe) | |
22q12.2 | NF2 | neurofibromin 2 | neuroma acústica bilateral |
22q13 | SOX10 | SRY (sex determining region Y)-box 10 | |
22q13.1 | APOL1 | Apolipoproteína L1 | |
22q13.2 | EP300 | proteína de unión E1A p300 | |
22q13.3 | WNT7B | Familia del sitio de integración MMTV de tipo Wingless, miembro 7B | Síndrome de eliminación 22q13 |
22q13.3 | SHANK3 | SH3 y múltiples dominios de repetición de ankyrina 3 | Síndrome de eliminación 22q13 |
22q13.3 | SULT4A1 | sulfotransferase family 4A, member 1 | Síndrome de eliminación 22q13 |
22q13.3 | PARVB | parvin beta (organización del citoesqueleto y adhesión celular) | Síndrome de eliminación 22q13 |
Enfermedades y trastornos
Las siguientes enfermedades son algunas de las relacionadas con genes en el cromosoma 22:
- Esclerosis lateral amiotrófica
- Cáncer de mama
- Síndrome de ojo de gato
- Leucemia mieloide crónica
- síndrome de DiGeorge
- Tumor de células pequeñas desmoplastic
- 22q11.2 síndrome de eliminación distal
- Síndrome de eliminación 22q13 o síndrome de Phelan-McDermid
- Síndrome de Emanuel
- Sarcoma de Ewing
- Glomerulosclerosis segmental focal
- Síndrome de Li-Fraumeni
- Leucodistrofia metacromática
- Methemoglobinemia
- Neurofibromatosis tipo 2
- Síndrome de Opitz G/BBB
- Carcinoma medular renal
- Síndrome de Rubinstein-Taybi
- Síndrome de Waardenburg
- Esquizofrenia
Condiciones cromosómicas
Las siguientes condiciones son causadas por cambios en la estructura o número de copias del cromosoma 22:
- Síndrome de eliminación 22q11.2: La mayoría de las personas con síndrome de eliminación 22q11.2 faltan unos 3 millones de pares base en una copia del cromosoma 22 en cada célula. La eliminación se produce cerca del centro del cromosoma en un lugar designado como q11.2. Esta región contiene unos 30 genes, pero muchos de estos genes no se han caracterizado bien. Un pequeño porcentaje de personas afectadas tienen menos supresiones en la misma región.
Se cree que la pérdida de un gen en particular, TBX1, es responsable de muchas de las características del síndrome de eliminación de 22q11.2, como defectos cardíacos, una abertura en el techo de la boca (palabra izquierda), características faciales distintivas y niveles bajos de calcio. Una pérdida de este gen no parece causar discapacidades de aprendizaje, sin embargo. Otros genes en la región eliminada también pueden contribuir a los signos y síntomas del síndrome de eliminación 22q11.2. - 22q11.2 síndrome de eliminación distal
- Síndrome de eliminación 22q13
- Otras condiciones cromosómicas: Otros cambios en el número o estructura del cromosoma 22 pueden tener una variedad de efectos, incluyendo la discapacidad intelectual, el desarrollo retardado, anomalías físicas y otros problemas médicos. Estos cambios incluyen una pieza extra de cromosoma 22 en cada célula (tristomía parcial), un segmento faltante del cromosoma en cada célula (monotomía parcial), y una estructura circular llamada cromosoma de anillo 22 que es causada por la rotura y reajuste de ambos extremos del cromosoma.
- El síndrome de ojo de gato es un trastorno raro causado con más frecuencia por un cambio cromosómico llamado un duplicado invertido 22. Un pequeño cromosoma extra se compone de material genético del cromosoma 22 que ha sido duplicado anormalmente (copado). El material genético extra causa los signos y síntomas característicos del síndrome de gato-ojo, incluyendo una anomalía ocular llamada coloboma del iris ocular (una brecha o división en la parte coloreada del ojo), pequeñas etiquetas de la piel o agujeros delante del oído, defectos cardíacos, problemas renales, y, en algunos casos, retraso en el desarrollo.
- Una reorganización (translocación) del material genético entre los cromosomas 9 y 22 se asocia con varios tipos de cáncer de sangre (leucemia). Esta anormalidad cromosómica, que se llama comúnmente el cromosoma de Filadelfia, se encuentra sólo en las células cancerosas. El cromosoma de Filadelfia se ha identificado en la mayoría de los casos de una forma de cáncer de sangre que avanza lentamente llamada leucemia mieloide crónica o LMC. También se ha encontrado en algunos casos de cánceres de sangre más rápidos (leucemias agudas). La presencia del cromosoma de Filadelfia puede ayudar a predecir cómo el cáncer progresará y proporciona un objetivo para terapias moleculares.
- El síndrome de Emanuel es una translocación de los cromosomas 11 y 22. Originalmente conocido como síndrome de der supernumerario (22), se produce cuando un individuo tiene un cromosoma extra compuesto por piezas de los cromosomas 11 y 22.
Banda citogenética
Chr. | Arma | Banda | ISCN Empieza | ISCN Para | Basepair Empieza | Basepair Para | Stain | Densidad |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
22 | p | 13 | 0 | 260 | 1 | 4.300.000 | gvar | |
22 | p | 12 | 260 | 576 | 4.300.001 | 9.400.000 | Talla | |
22 | p | 11.2 | 576 | 836 | 9.400.001 | 13.700.000 | gvar | |
22 | p | 11.1 | 836 | 1015 | 13.700.001 | 15,000,000 | acen | |
22 | q | 11.1 | 1015 | 1234 | 15.000.001 | 17.400.000 | acen | |
22 | q | 11.21 | 1234 | 1563 | 17.400.001 | 21.700.000 | gneg | |
22 | q | 11.22 | 1563 | 1700 | 21.700.001 | 23.100.000 | gpos | 25 |
22 | q | 11.23 | 1700 | 1878 | 23.100.001 | 25,500,000 | gneg | |
22 | q | 12.1 | 1878 | 2029 | 25.500.001 | 29,200,000 | gpos | 50 |
22 | q | 12.2 | 2029 | 2194 | 29.200.001 | 31.800,000 | gneg | |
22 | q | 12.3 | 2194 | 2413 | 31.800.001 | 37,200,000 | gpos | 50 |
22 | q | 13.1 | 2413 | 2687 | 37.200.001 | 40.600,000 | gneg | |
22 | q | 13.2 | 2687 | 2852 | 40.600.001 | 43.800,000 | gpos | 50 |
22 | q | 13.31 | 2852 | 3181 | 43.800.001 | 48,100,000 | gneg | |
22 | q | 13.32 | 3181 | 3290 | 48,100,001 | 49,100,000 | gpos | 50 |
22 | q | 13.33 | 3290 | 3400 | 49,100,001 | 50,818,468 | gneg |