Caulimoviridae
Caulimoviridae es una familia de virus que infectan las plantas. Hay 94 especies en esta familia, asignadas a 11 géneros. Los virus que pertenecen a la familia Caulimoviridae se denominan virus de transcripción inversa (o pararetrovirus) de ADN bicatenario (ADNds), es decir, virus que contienen una etapa de transcripción inversa en su ciclo de replicación. Esta familia contiene todos los virus vegetales con un genoma de ADNbc que tienen una fase de transcripción inversa en su ciclo de vida.
Taxonomía
Se reconocen los siguientes géneros:
- Badnavirus
- Caulimovirus
- Cavemovirus
- Dioscovirus
- Petuvirus
- Rosadnavirus
- Ruflodivirus
- Solendovirus
- Soymovirus
- Tungrovirus
- Vaccinivirus
Estructura de las partículas del virus
Todos los virus de esta familia no tienen envoltura. Las partículas de virus son baciliformes o isométricas. El tipo de nucleocápside incorporada a la estructura del virus determina el tamaño de las partículas virales. Las partículas baciliformes tienen aproximadamente entre 35 y 50 nm de diámetro y hasta 900 nm de longitud. Las partículas isométricas tienen un diámetro promedio de 45 a 50 nm y muestran simetría icosaédrica.
Estructura y replicación del genoma
Los genomas de los virus de esta familia contienen ADNds circular monopartito, cerrado no covalentemente, de 7,2 a 9,3 kpb con discontinuidades en ambas cadenas del genoma en lugares específicos. Estos genomas contienen desde un marco de lectura abierto (ORF), como se observa en los petuvirus, hasta ocho ORF, como en los somovirus. Las proteínas codificadas por los genomas virales incluyen la transcriptasa inversa-ribonucleasa H, proteasas aspárticas, nucleocápsides y transactivadores; hay otras proteínas esenciales para la replicación a las que aún no se les ha asignado una función específica.
La replicación tiene lugar tanto en el citoplasma como en el núcleo de las células huésped. Primero, el genoma viral ingresa al citoplasma. El ADN viral forma estructuras de minicromosomas superenrolladas al ingresar al núcleo del huésped, donde se transcribe en ARN poliadenilado que es terminalmente redundante (debido a que la transcripción ocurre dos veces para algunas partes del ADN). El ARN recién transcrito ingresa al citoplasma donde se traduce en proteínas virales o se retrotranscribe en nuevas copias del genoma viral de ADNds mediante la transcriptasa inversa viral. Los nuevos genomas de ADNbc se encapsulan en el citoplasma y se liberan.
El proceso de replicación implica un paso de retrotranscripción y un intermediario de ARN, por lo que los virus de la familia Caulimoviridae no se consideran verdaderos virus de ADNbc, sino que se denominan virus de ADN inverso. transcripción de virus. Comparten esta característica con los retrovirus. Sin embargo, a diferencia de los retrovirus, los virus de la familia Caulimoviridae no requieren la integración del genoma viral en el genoma de sus huéspedes para poder replicarse y por esta razón su genoma sí no codifica la proteína enzimática integrasa.
La presencia de elementos virales endógenos (EVE) en los genomas de las plantas está muy extendida. y la mayoría de los EVE vegetales conocidos se originan a partir de virus con genomas de ADN de la familia Caulimoviridae. Se cree que la integración se produce mediante uniones de extremos no homólogos (recombinación ilegítima) durante los mecanismos de reparación del ADN. La mayoría de los EVE vegetales no son infecciosos. Sin embargo, se han informado EVE Caulimoviridae infecciosos en el genoma de la petunia (virus del aclaramiento de las venas de Petunia), del plátano (virus OL del rayado del plátano, virus GF del rayado del plátano, virus IM del rayado del plátano). ) y Nicotiana edwardsonii (virus aclarador de las venas del tabaco).