Bacillota

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Filo de bacterias

Las Bacillota (sinónimo Firmicutes) son un filo de bacterias, la mayoría de las cuales tienen estructura de pared celular grampositiva. El cambio de nombre de filos como Firmicutes en 2021 sigue siendo controvertido entre los microbiólogos, muchos de los cuales continúan usando los nombres anteriores de larga data en la literatura.

El nombre "Firmicutes" se derivó de las palabras latinas para "piel dura" refiriéndose a la gruesa pared celular típica de las bacterias en este filo. Los científicos una vez clasificaron a los Firmicutes para incluir todas las bacterias grampositivas, pero recientemente los han definido como parte de un grupo central de formas relacionadas llamado grupo de bajo G+C, en contraste con Actinomycetota. Tienen células redondas, llamadas cocos (singular coccus), o formas en forma de varilla (bacillus). Algunos Firmicutes, como Megasphaera, Pectinatus, Selenomonas y Zymophilus, tienen una pseudomembrana externa porosa que hace que se tiñan de gramnegativos.

Muchos Bacillota (Firmicutes) producen endosporas, que son resistentes a la desecación y pueden sobrevivir en condiciones extremas. Se encuentran en varios ambientes y el grupo incluye algunos patógenos notables. Los de una familia, las heliobacterias, producen energía a través de la fotosíntesis anoxigénica. La bacillota juega un papel importante en el deterioro de la cerveza, el vino y la sidra.

Clases

El grupo generalmente se divide en clostridios, que son anaeróbicos, y bacilos, que son aerobios obligados o facultativos.

En los árboles filogenéticos, los dos primeros grupos aparecen como parafiléticos o polifiléticos, al igual que sus géneros principales, Clostridium y Bacillus. Sin embargo, generalmente se cree que Bacillota en su conjunto es monofilético o parafilético con la exclusión de Mollicutes.

Filogenia

La taxonomía actualmente aceptada basada en la Lista de nombres procarióticos con posición en la nomenclatura (LPSN) y el Centro Nacional de Información Biotecnológica (NCBI).

16S rRNA basado en LTP_01_2022 GTDB 08-RS214 by Genome Taxonomy Database

Archaea

Bacterias

"Aquificida"

"Synergistetes"

Atribacterota

Sintrophorhabdia

Thermotomaculales

Spirochaetota

Firmicutes 3 ♦

Dictyoglomota

"Caldicellulosiruptorales"

"Thermosediminibacteria" [incl. "Ammonificales", DSM-22653]

"Thermoanaerobacteria" [incl. Thermanaeromonas, Desulfovirgula]

"FCB group"

Firmicutes 2 ♦

"Sulfobacillia"

"Thermaerobacteria"

"Carboxydothermales"

"Thermacetogeniales"

Moorellales {"Moorellia"}

"Calderihabitantales"

"Koleobacterales"

Zhaonellaceae

"Desulfitibacterales"

"Sintrofomonadia"

Gelria

"Symbiobacteriia" ♦

Actinomycetota

Deinococcota

"Melainabacteria"

"Cyanobacteriota"

Armatimonadota

Chloroflexota

Nitrospirota

"Thermodesulfobiota" ♦

Elusimicrobiota

"Halanaerobiia" ♦

Acidobacteriota

Chitinivibrionia

"Planctobacteria

"Firmicutes" 1 ♦

Thermolithobacteria

"Carboxydocellales"

"Thermincolia"

"Desulfofundulaceae"

UBA4882

"Selenomonadia"

Limnochordia

"Desulfotomaculota"

"Desulfotomaculia"

"Desulfitobacteriia"

"Peptococcia"

"Dethiobacteria"

"Natranaerobiia"

"Clostridiia" (incl. Tissierellia)

Fusobacteriota

Fusobacteria

Mycoplasmatota

Acholeplasmatales

Erysipelotrichia

Mollicutes

"Bacilliia" {Bacillota s.s.}

"Proteobacteria" s.l.

♦ Paraphyletic Firmicutes

Bacillota E

"Thermaerobacteria"

"Ca. Acetocimmeria" {UBA3575}

"Symbiobacteriia"

"Sulfobacillia"

Bacillota G

Limnochordia

"Hydrogenisporia" (UBA4882)

"Halanaerobiaeota"

"Halanaerobiia"

Bacillota s.s.

"Bacillia"

Bacillota D

"Proteinivoracia"

"Dethiobacteria"

"Natranaerobiia"

"Selenobacteria"

"Selenomonadia"

"Desulfotomaculota"

"Sintrofomonadia"

"Peptococcia"

"Dehalobacteriia"

"Desulfitobacteriia"

"Thermacetogeniales"

"Moorellia"

"Carboxydocellales" {GCA-003054495}

"Thermincolia"

"Carboxydothermales"

"Desulfotomaculia"

Bacillota A

"Thermosediminibacteria"

"Thermoanaerobacteria"

"Clostridiia" S.S.

Géneros

Más de 274 géneros se consideraron a partir de 2016 dentro del filo Bacillota, los géneros notables de Bacillota incluyen:

Bacilos, orden Bacillales

  • Bacillus
  • Listeria
  • Staphylococcus

Bacilos, orden Lactobacillales

  • Enterococcus
  • Lactobacillus
  • Leuconostoc
  • Streptococcus

Clostridia

  • Clostridioides
  • Clostridium
  • Selenomonas

Erisipelotriquia

  • Erysipelothrix

Importancia clínica

La bacillota constituye aproximadamente el 30 % del microbioma intestinal humano y de ratón. Se ha demostrado que el filo Bacillota, como parte de la microbiota intestinal, está involucrado en la reabsorción de energía y potencialmente relacionado con el desarrollo de diabetes y obesidad. En el intestino de adultos humanos sanos, la bacteria más abundante: Faecalibacterium prausnitzii (F. prausnitzii), que constituye el 5 % del microbioma intestinal total, es miembro del filo Bacillota. Esta especie está directamente asociada con la reducción de la inflamación de bajo grado en la obesidad. F. prausnitzii se ha encontrado en niveles más altos dentro de los intestinos de niños obesos que en niños no obesos.

En múltiples estudios se ha encontrado una mayor abundancia de Bacillota en individuos obesos que en controles delgados. Se ha encontrado un nivel más alto de Lactobacillus (del filo Bacillota) en pacientes obesos y en un estudio, los pacientes obesos sometidos a dietas para bajar de peso mostraron una cantidad reducida de Bacillota en sus intestinos.

También se ha demostrado que los cambios en la dieta de los ratones promueven cambios en la abundancia de Bacillota. Se observó una mayor abundancia relativa de Bacillota en ratones alimentados con una dieta occidental (alta en grasas/alta en azúcar) que en ratones alimentados con una dieta estándar baja en grasas/alta en polisacáridos. La mayor cantidad de Bacillota también se relacionó con más adiposidad y peso corporal en los ratones. Específicamente, dentro de los ratones obesos, la clase Mollicutes (dentro del filo Bacillota) fue la más común. Cuando la microbiota de ratones obesos con esta mayor abundancia de Bacillota se trasplantó en el intestino de ratones libres de gérmenes, los ratones libres de gérmenes ganaron una cantidad significativa de grasa en comparación con los trasplantados con la microbiota de ratones delgados con menor abundancia de Bacillota.

Se ha encontrado que la presencia de Christensenella (Bacillota, en la clase Clostridia), aislada de heces humanas, se correlaciona con un índice de masa corporal más bajo.

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