ARN de la familia HgcC
HgcC es un ARN pequeño no codificante (ARNnc). Es el producto funcional de un gen que no se traduce en proteína.
Este gen ncRNA se identificó originalmente mediante una búsqueda computacional en el genoma de la arquea termófila Methanococcus jannaschii en busca de regiones no codificantes con un alto contenido de guanina-citosina (GC). La lógica original de esta búsqueda se basó en la observación de que los genomas de estas bacterias son ricos en adenosina-tiamina (AT) y, en consecuencia, tienen un bajo contenido de GC. Sin embargo, el contenido de GC de los genes de ARN ribosómico (ARNr) y ARN de transferencia (ARNt) en hipertermófilos muestra una fuerte correlación con la temperatura de crecimiento óptima. Se propuso que las regiones no codificantes con un alto contenido de GC podrían codificar productos funcionales de ARN. La búsqueda computacional identificó una serie de genes ncRNA nuevos en el genoma de M.jannaschii. Estos se denominaron hgc- ("high GC") A, B, C, D, E, F y G. Se detectaron otros dos homólogos llamados HhcA y HhcB, en honor a "homólogo de hgcC". También se identificó otro elemento de ARN, el ARN SscA.
El producto del gen HgcC fue validado experimentalmente mediante análisis de Northern blot y RACE-PCR. Se desconoce la función de este ARNnc.
Referencias
- ^ a b c Klein RJ, Misulovin Z, Eddy SR (2002). "Noncoding RNA genes identificados en hipertermofílicos ricos en AT". Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 99 (11): 7542 –7547. Bibcode:2002PNAS...99.7542K doi:10.1073/pnas.112063799. PMC 124278. PMID 12032319.
- ^ Galtier N, Lobry JR (1997). "Relaciones entre el contenido genómico G+C, las estructuras secundarias de ARN y la temperatura de crecimiento óptima en los procariotes". J. Mol. Evol. 44 (6): 632–636. Bibcode:1997JMolE..44..632G. doi:10.1007/PL00006186. PMID 9169555. S2CID 19054315.
Enlaces externos
- Page for HgcC family RNA at Rfam
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