Actinomicetota

Los Actinomycetota (o Actinobacteria) son un filo de todas las bacterias grampositivas. Pueden ser terrestres o acuáticos. Son de gran importancia económica para los seres humanos porque la agricultura y los bosques dependen de sus contribuciones a los sistemas del suelo. En el suelo, ayudan a descomponer la materia orgánica de los organismos muertos para que las plantas puedan absorber las moléculas de nuevo. Si bien los hongos también desempeñan este papel, los Actinomycetota son mucho más pequeños y es probable que no ocupen el mismo nicho ecológico. En esta función, las colonias a menudo desarrollan extensos micelios, como lo haría un hongo, y el nombre de un orden importante del filo, Actinomycetales (los actinomicetos), refleja que durante mucho tiempo se creyó que eran hongos. Algunos actinomycetota del suelo (como Frankia) viven en simbiosis con las plantas cuyas raíces impregnan el suelo, fijando nitrógeno para las plantas a cambio del acceso a algunos de los sacáridos de la planta. Otras especies, como muchos miembros del género Mycobacterium, son patógenos importantes.

Más allá del gran interés en Actinomycetota por su papel en el suelo, aún queda mucho por aprender sobre ellos. Aunque actualmente se entienden principalmente como bacterias del suelo, podrían ser más abundantes en aguas dulces. Actinomycetota es uno de los filos bacterianos dominantes y contiene uno de los géneros bacterianos más grandes, Streptomyces. Streptomyces y otros actinomycetota son los principales contribuyentes a la amortiguación biológica de los suelos. También son la fuente de muchos antibióticos.

El género Actinomycetota Bifidobacterium es la bacteria más común en el microbioma de los bebés humanos. Aunque los adultos tienen menos bifidobacterias, las bifidobacterias intestinales ayudan a mantener la barrera mucosa y reducen los lipopolisacáridos en el intestino.

Aunque algunas de las células bacterianas más grandes y complejas pertenecen a Actinomycetota, se ha descrito que el grupo de Actinomarinales marinos posee las células procariotas de vida libre más pequeñas.

Se dice que algunos Actinomycetota siberianos o antárticos son los organismos vivos más antiguos de la Tierra, congelados en el permafrost hace alrededor de medio millón de años. Los síntomas de vida fueron detectados por la liberación de CO₂ de muestras de permafrost de 640 kya o menos.

Generales

La mayoría de los Actinomycetota de importancia médica o económica pertenecen a la clase Actinomycetia y pertenecen al orden Actinomycetales. Si bien muchos de estos causan enfermedades en humanos, Streptomyces es notable como fuente de antibióticos.

De los Actinomycetota que no están en los Actinomycetales, Gardnerella es uno de los más investigados. La clasificación de Gardnerella es controvertida y MeSH la cataloga como un organismo Gram-positivo y Gram-negativo.

Actinomycetota, especialmente Streptomyces spp., son reconocidos como productores de muchos metabolitos bioactivos que son útiles para los humanos en medicina, como antibacterianos, antifúngicos, antivirales, antitrombóticos, inmunomodificadores, fármacos antitumorales y inhibidores de enzimas; y en agricultura, incluyendo insecticidas, herbicidas, fungicidas y sustancias que estimulan el crecimiento de plantas y animales. Los antibióticos derivados de actinomycetota que son importantes en medicina incluyen aminoglucósidos, antraciclinas, cloranfenicol, macrólidos, tetraciclinas, etc. Los actinomycetota tienen un alto contenido de guanina y citosina en su ADN. El contenido de G+C de Actinomycetota puede llegar al 70%, aunque algunos pueden tener un bajo contenido de G+C.

Se ha sugerido el análisis de la secuencia de glutamina sintetasa para el análisis filogenético de Actinomycetota.

Filogenia

Taxonomía

La taxonomía actualmente aceptada se basa en la Lista de nombres procarióticos con posición en la nomenclatura (LPSN) y el Centro Nacional de Información Biotecnológica (NCBI).

• Clase ?"Syntrophaliphaticia" Corrrig. Liu et al. 2020
• Clase "Aquicultoria" Jiao et al. 2021
• Clase "Geothermincolia" Jiao et al. 2021
• Clase "Humimicrobiia" Jiao et al. 2021
• Clase Acidimicrobiia Norris 2013
• Actinomycetia de clase (Stackebrandt et al. 1997) Salam et al. 2020 (Nitriliruptoria Ludwig et al. 2013)
  • Subclase Actinobacteridae Stackebrandt, Rainey & Ward-Rainey 1997
  • Subclase Nitriliruptoridae Kurahashi et al. 2010
• Clase Coriobacteriia König 2013
• Clase Rubrobacteria Suzuki 2013
• La termofilia de clase Suzuki y Whitman 2013