Nucleossoma

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Unidade estrutural básica de embalagem de DNA em eukaryotes
Unidades básicas de estrutura de cromatina

Um nucleossomo é a unidade estrutural básica do empacotamento do DNA em eucariotos. A estrutura de um nucleossomo consiste em um segmento de DNA enrolado em torno de oito proteínas histonas e se assemelha a um fio enrolado em um carretel. O nucleossomo é a subunidade fundamental da cromatina. Cada nucleossomo é composto por pouco menos de duas voltas de DNA enroladas em um conjunto de oito proteínas chamadas histonas, conhecidas como octâmeros de histonas. Cada octâmero de histona é composto de duas cópias de cada uma das proteínas histonas H2A, H2B, H3 e H4.

O DNA deve ser compactado em nucleossomos para caber no núcleo da célula. Além do envolvimento do nucleossomo, a cromatina eucariótica é ainda mais compactada ao ser dobrada em uma série de estruturas mais complexas, eventualmente formando um cromossomo. Cada célula humana contém cerca de 30 milhões de nucleossomos.

Acredita-se que os nucleossomos carregam informações herdadas epigeneticamente na forma de modificações covalentes de suas histonas centrais. As posições dos nucleossomos no genoma não são aleatórias e é importante saber onde cada nucleossomo está localizado porque isso determina a acessibilidade do DNA às proteínas reguladoras.

Os nucleossomos foram observados pela primeira vez como partículas no microscópio eletrônico por Don e Ada Olins em 1974, e sua existência e estrutura (como octâmeros de histonas cercadas por aproximadamente 200 pares de bases de DNA) foram propostas por Roger Kornberg. O papel do nucleossomo como regulador da transcrição foi demonstrado por Lorch et al. in vitro em 1987 e por Han e Grunstein e Clark-Adams et al. in vivo em 1988.

A partícula central do nucleossomo consiste em aproximadamente 146 pares de bases (bp) de DNA enrolados em 1,67 voltas super-hélices canhotas em torno de um octâmero de histonas, consistindo em 2 cópias de cada uma das histonas centrais H2A, H2B, H3 e H4. As partículas do núcleo são conectadas por trechos de DNA de ligação, que podem ter até cerca de 80 pb de comprimento. Tecnicamente, um nucleossomo é definido como a partícula central mais uma dessas regiões de ligação; no entanto, a palavra é muitas vezes sinônimo de partícula central. Mapas de posicionamento de nucleossomos em todo o genoma estão agora disponíveis para muitos organismos modelo e células humanas.

As histonas de ligação, como H1 e suas isoformas, estão envolvidas na compactação da cromatina e ficam na base do nucleossomo perto da entrada e saída do DNA ligando-se à região de ligação do DNA. Os nucleossomos não condensados sem a histona de ligação se assemelham a "esferas em uma cadeia de DNA" sob um microscópio eletrônico.

Em contraste com a maioria das células eucarióticas, os espermatozóides maduros usam amplamente protaminas para empacotar seu DNA genômico, provavelmente para atingir uma taxa de empacotamento ainda maior. Equivalentes de histonas e uma estrutura de cromatina simplificada também foram encontrados em Archaea, sugerindo que os eucariotos não são os únicos organismos que usam nucleossomos.

Estrutura

Estrutura da partícula central

A estrutura de cristal da partícula do núcleossomo consiste em H2A , H2B , H3 e H4 histones e DNA. A vista é do topo através do eixo superélico.

Visão geral

Estudos estruturais pioneiros na década de 1980 pelo grupo de Aaron Klug forneceram a primeira evidência de que um octâmero de proteínas histonas envolve o DNA em torno de si mesmo em cerca de 1,7 voltas de uma super-hélice canhota. Em 1997, a primeira estrutura cristalina de resolução quase atômica do nucleossomo foi resolvida pelo grupo de Richmond, mostrando os detalhes mais importantes da partícula. O DNA palindrômico do satélite alfa humano, crítico para alcançar a estrutura cristalina do nucleossomo de 1997, foi desenvolvido pelo grupo Bunick no Oak Ridge National Laboratory, no Tennessee. As estruturas de mais de 20 diferentes partículas do núcleo do nucleossomo foram resolvidas até o momento, incluindo aquelas contendo variantes de histonas e histonas de diferentes espécies. A estrutura da partícula central do nucleossomo é notavelmente conservada, e mesmo uma mudança de mais de 100 resíduos entre histonas de sapo e levedura resulta em mapas de densidade de elétrons com um desvio médio quadrado geral de apenas 1,6Å.

A partícula central do nucleossomo (NCP)

A partícula central do nucleossomo (mostrada na figura) consiste em cerca de 146 pares de bases de DNA enrolados em 1,67 voltas super-hélices à esquerda ao redor do octâmero de histonas, consistindo em 2 cópias de cada uma das histonas centrais H2A, H2B, H3 e H4. Os nucleossomos adjacentes são unidos por um trecho de DNA livre denominado DNA ligante (que varia de 10 a 80 pb de comprimento, dependendo da espécie e do tipo de tecido). Toda a estrutura gera um cilindro de 11 nm de diâmetro e 5,5 nm de altura.

Escada de ADN apótico. A cromatina digerida está na primeira faixa; a segunda contém padrão de DNA para comparar comprimentos.
Esquema de organização nucleossoma.
A estrutura cristalina da partícula do núcleossomo (PDB: 1EQZ)

As partículas do núcleo do nucleossomo são observadas quando a cromatina na interfase é tratada para fazer com que a cromatina se desdobre parcialmente. A imagem resultante, por meio de um microscópio eletrônico, é "contas em uma corda". A corda é o DNA, enquanto cada conta no nucleossomo é uma partícula central. A partícula central do nucleossomo é composta de DNA e proteínas histonas.

A digestão parcial da cromatina com DNAse revela sua estrutura de nucleossomo. Como as porções de DNA das partículas do núcleo do nucleossomo são menos acessíveis para a DNAse do que as seções de ligação, o DNA é digerido em fragmentos de comprimentos iguais à multiplicidade de distância entre os nucleossomos (180, 360, 540 pares de bases, etc.). Portanto, um padrão muito característico semelhante a uma escada é visível durante a eletroforese em gel desse DNA. Essa digestão pode ocorrer também em condições naturais durante a apoptose ("suicídio celular" ou morte celular programada), porque a autodestruição do DNA normalmente é seu papel.

Interações de proteínas dentro do nucleossomo

As proteínas histonas centrais contêm um motivo estrutural característico denominado "dobra de histona", que consiste em três alfa-hélices (α1-3) separadas por dois loops (L1-2). Em solução, as histonas formam heterodímeros H2A-H2B e heterotetrâmeros H3-H4. As histonas dimerizam em torno de suas longas hélices α2 em uma orientação antiparalela e, no caso de H3 e H4, dois desses dímeros formam um feixe de 4 hélices estabilizado por extensos H3-H3' interação. O dímero H2A/H2B se liga ao tetrâmero H3/H4 devido a interações entre H4 e H2B, que incluem a formação de um aglomerado hidrofóbico. O octâmero de histona é formado por um tetrâmero H3/H4 central entre dois dímeros H2A/H2B. Devido à carga altamente básica de todas as quatro histonas centrais, o octâmero de histonas é estável apenas na presença de DNA ou concentrações de sal muito altas.

Histona - interações de DNA

O nucleossomo contém mais de 120 interações proteína-DNA diretas e várias centenas mediadas por água. Proteína direta - as interações do DNA não estão espalhadas uniformemente sobre a superfície do octâmero, mas sim localizadas em locais discretos. Estes são devidos à formação de dois tipos de sítios de ligação de DNA dentro do octâmero; o sítio α1α1, que utiliza a hélice α1 de duas histonas adjacentes, e o sítio L1L2 formado pelas alças L1 e L2. As ligações salinas e as pontes de hidrogênio entre os grupos hidroxila e básicos da cadeia lateral e as amidas da cadeia principal com os fosfatos do esqueleto do DNA formam a maior parte das interações com o DNA. Isso é importante, uma vez que a distribuição ubíqua de nucleossomos ao longo dos genomas exige que seja um fator de ligação ao DNA não específico de sequência. Embora os nucleossomos tendam a preferir algumas sequências de DNA em detrimento de outras, eles são capazes de se ligar praticamente a qualquer sequência, o que se acredita ser devido à flexibilidade na formação dessas interações mediadas pela água. Além disso, interações não polares são feitas entre as cadeias laterais de proteínas e os grupos desoxirribose, e uma cadeia lateral de arginina se intercala no sulco menor do DNA em todos os 14 locais onde ela enfrenta a superfície do octâmero. A distribuição e a força dos sítios de ligação do DNA sobre a superfície do octâmero distorcem o DNA dentro do núcleo do nucleossomo. O DNA é dobrado de maneira não uniforme e também contém defeitos de torção. A torção do DNA de forma B livre em solução é de 10,5 pb por volta. No entanto, a torção geral do DNA nucleossomal é de apenas 10,2 pb por volta, variando de um valor de 9,4 a 10,9 pb por volta.

Domínios de cauda de histona

As extensões da cauda das histonas constituem até 30% em massa de histonas, mas não são visíveis nas estruturas cristalinas dos nucleossomos devido à sua alta flexibilidade intrínseca, e acredita-se que sejam amplamente desestruturadas. As caudas N-terminais das histonas H3 e H2B passam por um canal formado pelos sulcos menores das duas fitas de DNA, projetando-se do DNA a cada 20 pb. A cauda N-terminal da histona H4, por outro lado, possui uma região de aminoácidos altamente básicos (16-25), que, na estrutura cristalina, forma uma interação com a região altamente ácida da superfície de um dímero H2A-H2B de outro nucleossomo, sendo potencialmente relevante para a estrutura de ordem superior dos nucleossomos. Acredita-se que essa interação ocorra também em condições fisiológicas e sugere que a acetilação da cauda H4 distorce a estrutura de ordem superior da cromatina.

Estrutura de ordem superior

O modelo de compactação cromatina atual.

A organização do DNA que é alcançada pelo nucleossomo não pode explicar totalmente o empacotamento do DNA observado no núcleo da célula. A compactação adicional da cromatina no núcleo da célula é necessária, mas ainda não é bem compreendida. O entendimento atual é que a repetição de nucleossomos com "ligador" O DNA forma uma fibra de 10 nm, descrita como "contas em uma corda", e tem uma proporção de empacotamento de cerca de cinco a dez. Uma cadeia de nucleossomos pode ser arranjada em uma fibra de 30 nm, uma estrutura compactada com razão de empacotamento de ~50 e cuja formação depende da presença da histona H1.

Uma estrutura cristalina de um tetranucleossomo foi apresentada e usada para construir uma estrutura proposta da fibra de 30 nm como uma hélice de duas entradas. Ainda há certa controvérsia em relação a esse modelo, pois é incompatível com dados recentes de microscopia eletrônica. Além disso, a estrutura da cromatina é pouco compreendida, mas é classicamente sugerido que a fibra de 30 nm está disposta em alças ao longo de um andaime de proteína central para formar a eucromatina transcricionalmente ativa. A compactação adicional leva a heterocromatina transcricionalmente inativa.

Dinâmica

Embora o nucleossomo seja um complexo proteína-DNA muito estável, ele não é estático e demonstrou sofrer vários rearranjos estruturais diferentes, incluindo deslizamento do nucleossomo e exposição do local do DNA. Dependendo do contexto, os nucleossomos podem inibir ou facilitar a ligação do fator de transcrição. As posições do nucleossomo são controladas por três contribuições principais: Primeiro, a afinidade de ligação intrínseca do octâmero de histona depende da sequência de DNA. Em segundo lugar, o nucleossomo pode ser deslocado ou recrutado pela ligação competitiva ou cooperativa de outros fatores protéicos. Em terceiro lugar, o nucleossomo pode ser ativamente translocado por complexos de remodelação dependentes de ATP.

Deslizamento do nucleossomo

O trabalho realizado no laboratório de Bradbury mostrou que os nucleossomos reconstituídos na sequência de posicionamento do DNA 5S foram capazes de se reposicionar translacionalmente nas sequências adjacentes quando incubados termicamente. Trabalhos posteriores mostraram que esse reposicionamento não exigia a interrupção do octâmero de histonas, mas era consistente com a capacidade dos nucleossomos de "deslizar" ao longo do DNA em cis. Em 2008, foi ainda revelado que os sítios de ligação CTCF atuam como âncoras de posicionamento de nucleossomos de modo que, quando usados para alinhar vários sinais genômicos, vários nucleossomos flanqueadores podem ser facilmente identificados. Embora os nucleossomos sejam intrinsecamente móveis, os eucariotos desenvolveram uma grande família de enzimas de remodelação da cromatina dependentes de ATP para alterar a estrutura da cromatina, muitas das quais o fazem por meio do deslizamento do nucleossomo. Em 2012, o laboratório de Beena Pillai demonstrou que o deslizamento do nucleossomo é um dos mecanismos possíveis para a expressão de genes específicos de tecidos em larga escala. O trabalho mostra que o sítio de início da transcrição de genes expressos em um determinado tecido está esgotado no nucleossomo, enquanto o mesmo conjunto de genes em outro tecido onde não são expressos está ligado ao nucleossomo.

Exposição do local de DNA

O trabalho do laboratório Widom mostrou que o DNA nucleossômico está em equilíbrio entre um estado embrulhado e não embrulhado. As medições dessas taxas usando o FRET resolvido no tempo revelaram que o DNA dentro do nucleossomo permanece totalmente embrulhado por apenas 250 ms antes de ser desembrulhado por 10 a 50 ms e depois rapidamente reembalado. Isso implica que o DNA não precisa ser ativamente dissociado do nucleossomo, mas que há uma fração significativa de tempo durante o qual ele é totalmente acessível. De fato, isso pode ser estendido para a observação de que a introdução de uma sequência de ligação ao DNA dentro do nucleossomo aumenta a acessibilidade de regiões adjacentes do DNA quando ligadas. Essa propensão do DNA dentro do nucleossomo para "respirar" tem consequências funcionais importantes para todas as proteínas de ligação ao DNA que operam em um ambiente de cromatina. Em particular, a respiração dinâmica dos nucleossomos desempenha um papel importante na restrição do avanço da RNA polimerase II durante o alongamento da transcrição.

Região livre de nucleossomos

Promotores de genes ativos possuem regiões livres de nucleossomos (NFR). Isso permite a acessibilidade do DNA do promotor a várias proteínas, como fatores de transcrição. A região livre de nucleossoma abrange tipicamente 200 nucleótidos em S. cerevisiae Nucleossomos bem posicionados formam limites de NFR. Esses nucleossomos são chamados de +1-nucleossomo e -1-nucleossomo e estão localizados a distâncias canônicas a jusante e a montante, respectivamente, do local de início da transcrição. +1-nucleossomo e vários nucleossomos a jusante também tendem a incorporar a variante de histona H2A.Z.

Modulação da estrutura do nucleossomo

Os genomas eucarióticos estão ubiquamente associados à cromatina; no entanto, as células devem regular espacial e temporalmente loci específicos independentemente da cromatina em massa. A fim de atingir o alto nível de controle necessário para coordenar os processos nucleares, como replicação, reparo e transcrição do DNA, as células desenvolveram uma variedade de meios para modular local e especificamente a estrutura e a função da cromatina. Isso pode envolver modificação covalente de histonas, a incorporação de variantes de histonas e remodelação não covalente por enzimas de remodelação dependentes de ATP.

Modificações pós-traducionais de histonas

Histone caudas e sua função na formação de cromatina

Desde que foram descobertas em meados da década de 1960, previu-se que as modificações das histonas afetam a transcrição. O fato de a maioria das primeiras modificações pós-traducionais encontradas estarem concentradas nas extensões da cauda que se projetam do núcleo do nucleossomo leva a duas teorias principais sobre o mecanismo de modificação das histonas. A primeira das teorias sugeria que eles podem afetar as interações eletrostáticas entre as caudas das histonas e o DNA para "soltar" o DNA. estrutura da cromatina. Mais tarde, foi proposto que as combinações dessas modificações podem criar epítopos de ligação com os quais recrutar outras proteínas. Recentemente, dado que mais modificações foram encontradas nas regiões estruturadas das histonas, foi proposto que essas modificações podem afetar as interações histona-DNA e histona-histona dentro do núcleo do nucleossomo. Prevê-se que modificações (como acetilação ou fosforilação) que diminuem a carga do núcleo globular de histonas "afrouxam" associação núcleo-DNA; a força do efeito depende da localização da modificação dentro do núcleo. Algumas modificações demonstraram estar correlacionadas com o silenciamento de genes; outros parecem estar correlacionados com a ativação do gene. Modificações comuns incluem acetilação, metilação ou ubiquitinação da lisina; metilação da arginina; e fosforilação da serina. A informação armazenada desta forma é considerada epigenética, uma vez que não é codificada no DNA, mas ainda é herdada pelas células filhas. A manutenção de um estado reprimido ou ativado de um gene é muitas vezes necessária para a diferenciação celular.

Variantes de histonas

Embora as histonas sejam notavelmente conservadas ao longo da evolução, várias formas variantes foram identificadas. Essa diversificação da função das histonas é restrita a H2A e H3, com H2B e H4 sendo principalmente invariantes. H2A pode ser substituído por H2AZ (que leva à redução da estabilidade do nucleossomo) ou H2AX (que está associado ao reparo do DNA e diferenciação de células T), enquanto os cromossomos X inativos em mamíferos são enriquecidos em macroH2A. H3 pode ser substituído por H3.3 (que se correlaciona com genes ativados e elementos reguladores) e nos centrômeros H3 é substituído por CENPA.

Remodelação do nucleossomo dependente de ATP

Várias reações distintas estão associadas ao termo remodelamento da cromatina dependente de ATP. Foi demonstrado que as enzimas remodeladoras deslizam os nucleossomos ao longo do DNA, interrompem os contatos histona-DNA a ponto de desestabilizar o dímero H2A/H2B e gerar torção super-hélice negativa no DNA e na cromatina. Recentemente, a enzima de remodelação Swr1 demonstrou introduzir a variante histona H2A.Z nos nucleossomos. Atualmente, não está claro se todos eles representam reações distintas ou apenas resultados alternativos de um mecanismo comum. O que é compartilhado entre todos, e de fato a marca registrada da remodelação da cromatina dependente de ATP, é que todos eles resultam em acessibilidade alterada do DNA.

Estudos que analisam a ativação do gene in vivo e, mais surpreendentemente, a remodelação in vitro revelaram que os eventos de remodelação da cromatina e a ligação do fator de transcrição são de natureza cíclica e periódica. Embora as consequências disso para o mecanismo de reação de remodelamento da cromatina não sejam conhecidas, a natureza dinâmica do sistema pode permitir que ele responda mais rapidamente a estímulos externos. Um estudo recente indica que as posições do nucleossomo mudam significativamente durante o desenvolvimento de células-tronco embrionárias de camundongos, e essas mudanças estão relacionadas à ligação de fatores de transcrição do desenvolvimento.

Remodelação dinâmica do nucleossomo no genoma da levedura

Estudos de 2007 catalogaram as posições dos nucleossomos em leveduras e mostraram que os nucleossomos estão esgotados nas regiões promotoras e nas origens de replicação. Cerca de 80% do genoma da levedura parece ser coberto por nucleossomos e o padrão de posicionamento do nucleossomo relaciona-se claramente com regiões de DNA que regulam a transcrição, regiões que são transcritas e regiões que iniciam a replicação do DNA. Mais recentemente, um novo estudo examinou mudanças dinâmicas no reposicionamento do nucleossomo durante um evento de reprogramação transcricional global para elucidar os efeitos no deslocamento do nucleossomo durante mudanças transcricionais em todo o genoma em levedura (Saccharomyces cerevisiae). Os resultados sugeriram que os nucleossomos localizados nas regiões promotoras são deslocados em resposta ao estresse (como choque térmico). Além disso, a remoção de nucleossomos geralmente correspondia à ativação transcricional e a substituição de nucleossomos geralmente correspondia à repressão transcricional, presumivelmente porque os locais de ligação do fator de transcrição se tornaram mais ou menos acessíveis, respectivamente. Em geral, apenas um ou dois nucleossomos foram reposicionados no promotor para efetuar essas alterações transcricionais. No entanto, mesmo em regiões cromossômicas que não foram associadas a alterações transcricionais, foi observado o reposicionamento do nucleossomo, sugerindo que o recobrimento e o descobrimento do DNA transcricional não necessariamente produzem um evento transcricional. Após a transcrição, a região do rDNA deve ser protegida de qualquer dano, sugerindo que as proteínas HMGB desempenham um papel importante na proteção da região livre do nucleossomo.

Defeitos de torção de DNA

Os defeitos de torção do DNA ocorrem quando a adição de um ou alguns pares de bases de um segmento de DNA é transferida para o próximo segmento, resultando em uma mudança na torção do DNA. Isso não apenas mudará a torção do DNA, mas também mudará o comprimento. Esse defeito de torção eventualmente se move ao redor do nucleossomo através da transferência do par de bases, o que significa que as torções do DNA podem causar deslizamento do nucleossomo. As estruturas cristalinas do nucleossomo mostraram que as localizações 2 e 5 da super-hélice no nucleossomo são comumente encontradas onde ocorrem os defeitos de torção do DNA, pois esses são locais comuns de ligação do remodelador. Há uma variedade de remodeladores de cromatina, mas todos compartilham a existência de um motor ATPase que facilita o deslizamento da cromatina no DNA através da ligação e hidrólise do ATP. ATPase tem um estado aberto e fechado. Quando o motor ATPase está mudando dos estados aberto e fechado, o DNA duplex muda de geometria e exibe a inclinação do par de bases. O início dos defeitos de torção por meio do motor ATPase faz com que a tensão se acumule ao redor do local do remodelador. A tensão é liberada quando o deslizamento do DNA é concluído ao longo do nucleossomo por meio da propagação de dois defeitos de torção (um em cada fita) em direções opostas.

Montagem do nucleossomo in vitro

Diagrama da montagem do nucleossoma.

Os nucleossomas podem ser montados in vitro usando histonas nativas ou recombinantes purificadas. Uma técnica padrão de carregar o DNA ao redor das histonas envolve o uso de diálise de sal. Uma reação que consiste nos octâmeros de histona e um molde de DNA nu pode ser incubada em conjunto a uma concentração de sal de 2 M. Ao diminuir constantemente a concentração de sal, o DNA se equilibrará em uma posição em que é enrolado em torno dos octâmeros de histona, formando nucleossomos. Em condições apropriadas, esse processo de reconstituição permite que a afinidade de posicionamento do nucleossomo de uma determinada sequência seja mapeada experimentalmente.

Partículas de núcleo de nucleossomo reticuladas por dissulfeto

Um avanço recente na produção de partículas de núcleo de nucleossomo com estabilidade aprimorada envolve ligações cruzadas de dissulfeto específicas do local. Duas reticulações diferentes podem ser introduzidas na partícula central do nucleossomo. Um primeiro reticula as duas cópias de H2A através de uma cisteína introduzida (N38C) resultando em octâmero de histona que é estável contra a perda do dímero H2A/H2B durante a reconstituição do nucleossomo. Uma segunda reticulação pode ser introduzida entre a cauda da histona H3 N-terminal e as extremidades do DNA do nucleossomo por meio de um nucleotídeo conversível incorporado. A ligação cruzada DNA-histona octâmero estabiliza a partícula central do nucleossomo contra a dissociação do DNA em concentrações muito baixas de partículas e em concentrações elevadas de sal.

Montagem do nucleossomo in vivo

Etapas na montagem do nucleossoma

Os nucleossomos são a unidade básica de embalagem do DNA construída a partir de proteínas histonas em torno das quais o DNA é enrolado. Eles servem como um andaime para a formação da estrutura da cromatina de ordem superior, bem como para uma camada de controle regulador da expressão gênica. Os nucleossomos são rapidamente montados no DNA recém-sintetizado atrás da forquilha de replicação.

H3 e H4

As histonas H3 e H4 de nucleossomos antigos desmontados são mantidas nas proximidades e distribuídas aleatoriamente no DNA recém-sintetizado. Eles são montados pelo complexo do fator de montagem da cromatina 1 (CAF-1), que consiste em três subunidades (p150, p60 e p48). H3 e H4 recentemente sintetizados são montados pelo fator de montagem de acoplamento de replicação (RCAF). RCAF contém a subunidade Asf1, que se liga às proteínas H3 e H4 recentemente sintetizadas. As antigas proteínas H3 e H4 retêm suas modificações químicas, o que contribui para a transmissão da assinatura epigenética. As proteínas H3 e H4 recentemente sintetizadas são gradualmente acetiladas em diferentes resíduos de lisina como parte do processo de maturação da cromatina. Pensa-se também que as antigas proteínas H3 e H4 nos novos nucleossomas recrutam enzimas modificadoras de histonas que marcam as novas histonas, contribuindo para a memória epigenética.

H2A e H2B

Em contraste com os antigos H3 e H4, as antigas proteínas histonas H2A e H2B são liberadas e degradadas; portanto, proteínas H2A e H2B recém-montadas são incorporadas a novos nucleossomos. H2A e H2B são montados em dímeros que são então carregados nos nucleossomos pela proteína-1 de montagem do nucleossomo (NAP-1), que também auxilia no deslizamento do nucleossomo. Os nucleossomos também são espaçados por complexos de remodelação de nucleossomos dependentes de ATP contendo enzimas como Isw1 Ino80 e Chd1 e subsequentemente montados em estruturas de ordem superior.

Galeria

A estrutura cristalina da partícula central do nucleossomo (PDB: 1EQZ) - diferentes visualizações mostrando detalhes do dobramento e organização das histonas. Histonas H2A, H2B, H3, H4 e DNA são coloridos.

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